Әлемдік Қоғамдық Тор: Ғылыми Зерттеулерге Көмектесетін Волонтёрлық Есептеу Жүйесі

Ғылыми зерттеулерге көмектесетін WCG жобасы – бос компьютер қуатын пайдаланып, маңызды мәселелерді шешуге бағытталған еріктік платформа. BOINC негізінде жұмыс істейді.

15 мин оқу

100%

Дереккөз: World Community Grid — Wikipedia

Ағылшыншамен салыстырыңыз: абзацты басыңыз — түпнұсқа терезеде ашылады. Абзац астындағы EN түймесі оны мәтін ішінде көрсетеді.

Мазмұны

Кіріспе

Ғылыми зерттеулерге көмектесу үшін BOINC негізіндегі ерікті есептеу жобасы. World Community Grid (WCG) – адамзатқа пайда әкелетін ғылыми зерттеулерді шешу үшін әлемдегі ең ірі ерікті есептеу платформасын құруға бағытталған күш-жігер. 2004 жылдың 16 қарашасында United Devices компаниясының Grid MP клиентімен және 2005 жылы Berkeley Open Infrastructure for Network Computing (BOINC) қолдауымен іске қосылған World Community Grid, 2008 жылы Grid MP клиентін тоқтатып, BOINC платформасында біріктірілді. 2021 жылдың қыркүйегінде IBM компаниясы меншік құқығын Онтарионың Торонто қаласындағы Университет денсаулық сақтау желісінің Крембил ғылыми-зерттеу институтына бергені хабарланды. World Community Grid тұтынушылық құрылғылардың (PC, ноутбуктер, Android смартфондар және т.б.) пайдаланылмаған өңдеу қуатын пайдаланып, желіге қатысатын зерттеу топтары жасаған деректерді талдайды. WCG жобалары адам геномы, адам микробиомы, HIV, денге қызыбы, бұлшықет дистрофиясы, қатерлі ісік, тұмау, Эбола, Зика вирусы, виртуалды скрининг, күріш өнімділігі, таза энергия, су тазарту және COVID-19 салаларындағы деректерді талдады. Қазіргі уақытта 5 белсенді және 26 аяқталған жоба бар. Осы жобалардың бірнешеуі WCG жинаған деректерді талдау нәтижесінде жарияланған рецензияланған мақалаларға негізделген. Олардың ішінде Зика вирусының NS3 геликаза ақуызын тежейтін (FAM 3) қосылыстың табылуы туралы OpenZika жобасының мақаласы бар, бұл вирус репликациясын 86%-ға дейін азайтады; жаңа дәрілік мақсаттарға мүмкіндік беретін HIV-1 капсид ақуызындағы жаңа осалдықтарды анықтау туралы FightAIDS@home мақаласы; және дәлірек нәтижелер алу үшін жаңа есептеулік дәрілік препараттарды ашу әдістері туралы FightAIDS@home мақаласы кіреді.

Тарих

2003 жылы IBM және басқа да зерттеу қатысушылары шешекке қарсы ем табуды жеделдету үшін Шешек зерттеу желісі жобасын демеушілік етті. Шешек зерттеуі препараттардың шешекке қарсы тиімділігін талдау үшін үлкен тараған есептеу желісін пайдаланды. Бұл жоба ғалымдарға шешек протеиндерінің бірнешеуіне қарсы 35 миллион потенциалды дәрілік молекулаларды тексеруге мүмкіндік берді. Алғашқы 72 сағатта 100 000 нәтиже алынды. Жоба аяқталған кезде 44 перспективті емдеу кандидаты анықталды. Шешек зерттеуінің табысы негізінде, IBM 2004 жылдың 16 қарашасында басқа да гуманитарлық зерттеулерді жүзеге асыруға арналған техникалық орта құру мақсатымен Дүниежүзілік қоғамдастық желісін құруды жариялады. BOINC енгізілгеннен бері Mac OS және Linux қолдауы қосылды. 2007 жылы Дүниежүзілік қоғамдастық желісі барлық қолдау көрсетілетін платформалар үшін Grid MP-ден BOINC-ке көшірілді. 2021 жылдың қыркүйегінде IBM Дүниежүзілік қоғамдастық желісінің меншік құқығын Крембил зерттеу институтына бергенін хабарлады. Толық ауысу процесі келесі бірнеше айда аяқталады.

Операция

World Community Grid бағдарламалық жасақтамасы зерттеу есептеулерін жүргізу үшін интернетке қосылған құрылғылардың қолданылмаған есептеу уақытын пайдаланады. Пайдаланушылар WCG клиенттік бағдарламалық жасақтамасын өз құрылғыларына орнатады. Бұл бағдарламалық қамтамасыз ету WCG үшін жұмыс істеу үшін бос жүйе ресурстарын пайдалана отырып, фоновым режимде жұмыс істейді. Жұмыс немесе жұмыс бірлігі аяқталғаннан кейін клиенттік бағдарламалық жасақтама оны интернет арқылы WCG-ге қайта жібереді және жаңа жұмыс бірлігін жүктейді. Дұрыстығын қамтамасыз ету үшін WCG серверлері әр жұмыс бірлігінің бірнеше көшірмесін жібереді. Содан кейін нәтижелер келіп түскеннен кейін, олар жинақталып, бір-бірімен тексеріледі. World Community Grid бір орталықта көптеген гуманитарлық жобаларды ұсынады. Пайдаланушылар әдепкі бойынша жобалардың бір бөлігіне қосылады, бірақ олар қалаған жобалардан бас тарта алады. WCG ашық кодты клиенттік бағдарламалық жасақтаманы пайдаланса да, ғылыми есептеулерді орындайтын нақты қолданбалар олай болмауы мүмкін. Дегенмен, бірнеше ғылыми қолданбалар тегін лицензиямен қолжетімді, бірақ бастапқы код тікелей WCG-ден қолжетімді емес.

Мүмкін болатын проблемалар

World Community Grid бағдарламалық жасақтамасы CPU-ның пайдаланылуын пайдаланбайтын өңдеу уақытын тұтыну арқылы арттырады; 1990 жылдардың соңы мен 2000 жылдардың басында мұндай есептеулер «босқа кеткен» CPU циклдарын азайту мақсатында жасалған. Қазіргі заманғы процессорларда динамикалық жиілік реттелуі кең таралғандықтан, пайдаланудың артуы процессорды жоғары жиілікте жұмыс істеуге мәжбүр етеді, қуат тұтынуды арттырады және қуатты басқаруға қарсы жылуды күшейтеді. Сонымен қатар, қуат өнімділігіне, яғни бір ваттқа жұмсалатын өнімділікке назар аудару артып, ескі/тиімсіз компьютерлерді желіге қосу бірдей есептеулерді орындау үшін қажетті жалпы/орташа қуатты арттырады. BOINC клиенті жеткіліксіз бос ресурстар болғанда есептеуді тоқтататын түрлі шектеулерді қолдану арқылы компьютердің баяулауын болдырмайды. Басқа BOINC жобаларынан өзгеше, World Community Grid BOINC параметрлерін консервативті түрде орнатады, бұл компьютердің зақымдану мүмкіндігін едәуір төмендетеді. CPU-ны шектеудің әдепкі деңгейі 60%-қа тең. Шектеу дөңгелектей орнатылған; мысалы, пайдалану 60%-қа орнатылса, ол 3 секунд бойы 100% қуатпен жұмыс істейді, содан кейін 2 секунд бойы 0% қуатпен жұмыс істейді, нәтижесінде процессордың орташа жүктемесі төмендейді. Windows компьютерлері үшін қосымша бағдарлама – TThrottle – CPU және/немесе GPU температурасын өлшеу арқылы және оған сәйкес жұмыс уақытын реттеу арқылы BOINC жобасының хост-компьютерді пайдалануын тікелей шектеу арқылы қызу мәселесін шеше алады. Бұл бағдарлама ауысу уақытын бір секундтан кем етеді, соның салдарынан ауысу кезінде температураның өзгеруі азаяды.

Статистика және бәсекелестік

Әрбір пайдаланушының үлесі тіркеледі және пайдаланушы үлесінің статистикасы қоғамға ашық түрде қолжетімді. Жұмыс бірлігін аяқтағаннан кейін, BOINC клиенті бағдарламалық қамтамасыз етудің өлшемдемелеріне сүйене отырып, өзіне тиесілі деп санайтын ұпайлар санын сұрайды (BOINC Credit System#Cobblestones бөлімін қараңыз). Дәлдікті қамтамасыз ету үшін бір жұмыс бірлігін бірнеше компьютер өңдейтін болғандықтан, World Community Grid серверлері осы компьютерлердің әрқайсысы талап еткен ұпайларды қарастыра алады. WCG серверлері статистикалық қателіктерді ескермейді, қалған мәндерді орташалайды және әрбір компьютерге осы орташа есептің нәтижесіндегі ұпай санын береді. Желі ішінде пайдаланушылар ұйымдар, топтар немесе жеке тұлғалар құрған командаларға қосыла алады. Командалар қауымдастық сезімін күшейтеді және бәсекелестікті ынталандырады. Командалар бір-бірімен жарысқанда, желі үшін жалпы жұмыс көлемі артады.

Қатысу

World Community Grid компаниялар мен ұйымдарды серіктес ретінде мойындайды, егер олар өз компанияларында немесе ұйымдарында WCG-ні насихаттаса. 2021 жылдың сәуір айына дейін WCG-нің 452 серіктесі болды. Сонымен қатар, адам денсаулығы мен әл-ауқатын жақсартуға берілгендігінің бір бөлігі ретінде World Community Grid-те орындалған барлық есептеулердің нәтижелері қоғамдық доменге жіберіліп, ғылыми қауымдастыққа қолжетімді етіледі. Бұл жаңалық WCG еріктілерінің қолдауымен жасалды және жаңа емдеуге жасалған позитивті қадам болып табылады. Жоба, құрамаларды емдеуге айналдыру үшін фармацевтикалық компаниямен ынтымақтастық орнатуды жоспарлап отыр. Жобаның сәттілігін ескере отырып, ғалымдар басқа балалардың қатерлі ісіктеріне назар аударатын келесі жобаны жоспарлап отырғанын мәлімдеді, мүмкін жаңа құрылған Пан Азиялық онкологиялық тобымен бірлесіп, олардың құрылтайшы мүшесі болып табылады. 2012 жылдың шілдесінен бастап Адам протеомын бүктеу жобасы WCG деректерін пайдалана отырып бірнеше мақала жариялады. Оларға валидациялау әдістері және ақуыз құрылымы мен функциясының жаңа дерекқоры туралы болжамдар; адам процестерін реттейтін ақуыздарды анықтау; бес өсімдік отбасының геномдары мен олардың протеомдарын талдау (WCG 29 000-нан астам ақуыз құрылымын құру үшін пайдаланылған); Saccharomyces cerevisiae протеомы туралы мақалалар кіреді. Малярияға қарсы күрес жобасы (GO Fight Against Malaria) малярия мен дәріге төзімді туберкулезге (соның ішінде емдеуге жарамсыз ТДР туберкулезіне) қарсы тиімді бірнеше молекулаларды тапқанын хабарлады. Жоба сонымен қатар MRSA, филярия және бубондық обаға қарсы жаңа молекулаларды сынады. Осы молекулаларды емдеуге айналдыру үшін зертханалық сынақтар жалғасуда. GFAM миллиард түрлі доктау есептеулерін орындаған алғашқы жоба болды. 2015 жылдың қаңтар айында бір мақала жарияланды, ал тағы екеуі ұсынылуда. 2015 жылдың маусым айында жоба дәріге төзімді туберкулез штаммына қарсы табылған екі "жетістікке" бірнеше "аналогтар" синтезделгенін хабарлады, олардың ең жақсысы Mycobacterium tuberculosis өсімін тежейді және сүтқоректілердің жасушалары үшін салыстырмалы түрде уытты емес. Алайда, 2018 жылдың қазан айындағы жаңартуда зерттеу тобы олардың қазіргі дизайндарының ешқайсысы деңгей протеазасының ингибиторын жасауға мүмкіндік бермегенін хабарлады. 2013 жылдың маусым айында "Таза энергия жобасы" олардың қасиеттері сипатталған 2,3 миллионнан астам органикалық молекулалар туралы деректер базасын жариялады. Олардың 35 000 молекуласы қазіргі уақытта өндіріліп жатқан органикалық күн элементтерінен екі есе тиімдірек болуы мүмкін. Осы бастамаға дейін ғалымдар күн сәулесін электр энергиясына тиімді түрлендіретін көміртек негізіндегі аз ғана материалдарды білген. 2010 жылдың ақпан айында FightAIDS@Home жобасының ғалымдары СПИД-ке қарсы күрестегі дәрі-дәрмектердің жаңа класын жасауға мүмкіндік беретін екі қосылысты тапқандарын мәлімдеді. Бұл қосылыстар жаңадан табылған байланысу орындарында вирусқа жабысады, сондықтан "ағымдағы терапияны жақсарту, аурудың дәріге төзімді штамдарын емдеу және вирустың дәріге төзімділігінің дамуын баяулату үшін" пайдаланылуы мүмкін. 2015 жылдың шілдесінде Лейшманиозды емдеуге арналған дәрі-дәрмек іздеу жобасы WCG жұмыс топтары арқылы анықталған 100-ден астам аралықта ең жоғары тиімділігі бар 10 қосылысты сынақтан өткізгенін мәлімдеді. Олардың 10-ның 4-і in vitro сынақтарында "жағымды нәтижелер" көрсетті, ал біреуі "өте жағымды нәтиже" көрсетті. 2017 жылдың тамызында хомстерлердегі 4 қосылыстың in vivo сынағы жағымды нәтижелер көрсетті, бір қосылыс "бес хомстердің екеуіндегі зақымданулардың дерлік толықтай жазылуына" әкелді. Алайда, 2018 жылдың наурыз айындағы жаңартуда зерттеу тобы сыналған 10 қосылыстың ешқайсысының лейшманиозға қарсы жеткілікті белсенділігі жоқ екенін мәлімдеді. 2015 жылдың шілдесінде "Таза суды есептеу" жобасы "Nature Nanotechnology" журналында нанотүтіктерді тиімді пайдаланатын су сүзгісінің жаңа түрін сипаттайтын мақала жарияланғанын хабарлады. "Нанотүтіктер графен деп аталатын, бір атом қалыңдықтағы көміртек атомдарынан тұрады, олар кішкентай түтіктерге оралған, диаметрі бірнеше нанометр ғана, яғни адам шашының диаметрінен он мың есе кішкентай. Түтіктердің мөлшері су молекулаларының өтуіне мүмкіндік береді, бірақ үлкен патогендер мен ластаушы заттарды тоқтатады, суды тазартады". WCG-де жүргізілген симуляциялар нәтижесінде ғалымдар фонон деп аталатын табиғи дірілдердің белгілі бір түрлері, белгілі бір жағдайларда, нанотүтіктер арқылы су ағынының алдыңғы теориялық болжамдармен салыстырғанда 300% -дан астамға артуына әкелуі мүмкін екенін анықтады. 2015 жылдың сәуір айында "Шистосомаға жоқ деу" жобасының ғалымдары қосымша талдау жүргізілгенін және in vitro сынақтары үшін ең үміткер үш зат анықталғанын хабарлады. 2019 жылдың наурыз айында FightAIDS@Home зерттеушілері "HIV 1 ядролық құрастырылуы үшін маңызды жаңа интерсубұрыштық өзара әрекеттесу" және "потенциалды мақсатты ингибитор байланысу қалтасын анықтайтын" мақала жариялады. World Community Grid пайдаланып, 1,6 миллионнан астам қосылыс осы қалтаның 20 конфигурациясын бағыттап, зерттелді. Алдын ала нәтижелер бұл олардың антивирустық қосылыстар үшін ықтимал байланысу орны екенін көрсетеді. Осы қосылылдардың қосымша талдауы тәуелсіз зерттеу нысаны болып табылады.

World Community Grid recognizes companies and organizations as partners if they promote WCG within their company or organization. As of April 2021, WCG had 452 partners. Also, as part of its commitment to improving human health and welfare, the results of all computations completed on World Community Grid are released into the public domain and made available to the scientific community. This discovery, made with the support of the WCG volunteers, is a positive step towards a new treatment. The project has announced that it is seeking a collaboration with a pharmaceutical company in order to develop the compounds into treatments. Given the success of the project, the scientists have stated that they are already planning a follow up project which will focus on other pediatric cancers, possibly in collaboration with a newly formed Pan Asian oncology group, of which they are a founding member. As of July 2012, the Human Proteome Folding Project has published several papers using data from WCG. These include a paper on validation methods and a new database of protein structure and function predictions; a paper on the identification of proteins that regulate human processes; a paper on the analysis of the genomes from five plant families and their proteomes, for which WCG was used in the creation of over 29,000 protein structures; a paper on the proteome of Saccharomyces cerevisiae. The GO Fight Against Malaria project reported the discovery of several molecules that are effective against Malaria and Drug Resistant Tuberculosis (including TDR TB, for which there is no treatment available). The project also tested for new molecules against MRSA, Filariasis and Bubonic Plague. Laboratory testing continues in order to turn those molecules into possible treatments. GFAM was also the first project ever to perform a billion different docking calculations. A paper was published in January 2015, with two more pending submission. In June 2015, the project reported that of the two "hits" discovered against a drug resistant tuberculosis strain, several "analogs" have been synthesized, the best one of which inhibits the growth of Mycobacterium tuberculosis and is relatively non toxic to mammalian cells. However, in an October 2018 update, the research team reported that none of their current designs had produced a highly potent dengue protease inhibitor that could be tested in vivo. In June 2013, the Clean Energy Project published a database of over 2.3 million organic molecules which have had their properties characterized. Of these, 35,000 molecules have shown the potential to double the efficiency over organic solar cells currently being produced. Before this initiative, scientists knew of just a handful of carbon based materials that were able to convert sunlight into electricity efficiently. In February 2010, the FightAIDS@Home project scientists announced that they have found two compounds which make a potentially new class of AIDS fighting drugs possible. The compounds attach to the virus at newly discovered binding sites, and thus can be used to "enhance existing therapies, treat drug resistant strains of the disease, and slow the evolution of drug resistance in the virus." In July 2015, the Drug Search for Leishmaniasis project announced it had tested the top 10 compounds with highest predicted efficiency out of over 100 identified via WCG workunits. Of those 10, 4 showed "positive results" in in vitro testing, with one showing "an exceptionally promising result". In August 2017, in vivo testing of the 4 compounds on hamsters showed favourable results, with one compound inducing "an almost complete curing of the lesions in two out of five hamsters." However, in a March 2018 update, the research team announced none of the 10 tested compounds had sufficient anti leishmaniasis activity. In July 2015, the Computing for Clean Water project announced that a paper had been published in the Nature Nanotechnology journal describing a new type of water filter efficiently utilising nanotubes. "[The] nanotubes are made of single atom thick sheets of carbon atoms, called graphene, rolled up into tiny tubes, with diameters of just a few nanometers one ten thousandth the diameter of a human hair. The size of the tubes allows water molecules to pass through, but blocks larger pathogens and contaminants, purifying the water." By running simulations on WCG, the scientists discovered that certain kinds of natural vibrations called phonons, under specific conditions, can lead to more than 300% increased flow of water through the nanotubes, compared to previous theoretical predictions. In April 2015, the Say No To Schistosoma project scientists reported that subsequent analysis had been performed, and the three most promising candidate substances had been identified for in vitro testing. In March 2019, FightAIDS@Home researchers published a paper describing a "Novel Intersubunit Interaction Critical for HIV 1 Core Assembly" that "defines a Potentially Targetable Inhibitor Binding Pocket". Using World Community Grid, more than 1.6 million compounds were used to target 20 conformations of this pocket. Preliminary results suggest it to be a plausible binding site for antiviral compounds. Further analysis of these compounds are the subject of an independent study.

Ашық пандемиялар - COVID-19

2020 жылдың 1 сәуірінде IBM OpenPandemics COVID-19 жариялады. Жобаның мақсаты – COVID-19 пандемиясына себепші болып табылатын ауыр тыныс алу синдромы коронавирусы 2 (SARS-CoV-2) үшін мүмкін емдеу жолдарын анықтау. WCG бұрынғыдай, атап айтқанда FightAIDS@Home жобаларында серіктес болған Scripps Research институтымен ынтымақтаса жұмыс істейді. Жоба процессорлар (CPU) мен графикалық процессорларда (GPU) жұмыс істейді және болашақ пандемияларға қарсы емдеуді жылдам іздеуге барлық ғалымдарға көмектесетін, жылдам жауап беретін, ашық кодты құралды жасауға да септігін тигізеді. Жоба 2020 жылдың 14 мамырында іске қосылды.

Қатерлі ісік белгілерін картаға түсіру

Қатерлі ісік маркерлерін карталау (2013 жылдың 8 қарашасында іске қосылды). Жобаның мақсаты – әртүрлі қатерлі ісік түрлерімен байланысты маркерлерді анықтау және мыңдаған сау және қатерлі ісікпен ауырған пациенттердің тіндерінен алынған миллиондаған деректерді талдау. Бұл өкпе, жұмыртқа безі, простата, бүйрек безі және сүт безі қатерлі ісіктерін қамтиды. Осы әртүрлі деректерді салыстыру арқылы зерттеушілер әртүрлі қатерлі ісіктерге тән маркерлердің үлгілерін анықтап, оларды әртүрлі нәтижелермен, соның ішінде түрлі емдеу әдістеріне жауап берумен байланыстыруды көздейді. Жоба 4 түрлі қатерлі ісікке бағытталған, алғашқы назар өкпе қатерлі ісігіне беріледі, содан кейін жұмыртқа безі, простата қатерлі ісігі және саркома зерттеледі.

Туберкулезді тоқтатуға көмектесу

Help Stop TB туберкулезбен күресуге көмектесу мақсатымен 2016 жылдың наурыз айында іске қосылды. Бұл ауру, қазіргі қолданыстағы емдерге төзімділік қасиетін дамытып келе жатқан бактериядан туындайды. Аталған жобаның есептеулері бактерияның қорғаныш қабығындағы миколь қышқылдарына бағытталған, бұл молекулалардың қалай әрекет ететінін симуляциялап, бактерияны қорғау механизмін жақсырақ түсінуге мүмкіндік береді.

Балалық шақтағы қатерлі ісікке қарсы күрес

2017 жылдың қаңтар айында іске қосылған Smash Childhood Cancer жобасы, балалық шақтағы қатерлі ісікке қарсы күреске көмек көрсету жобасының нәтижелерін пайдаланып, балалық шақтағы тағы да басқа қатерлі ісіктерге қарсы әсер ететін препараттарды іздеуге бағытталған. 2020 жылдың наурыз айында доктор Акира Накагавара зейнетке шыққаннан кейін, жобаның бас зерттеушісі Smash Childhood Cancer командасының алғашқы мүшелерінің бірі болған доктор Годфри Чанға ауысты. Бұған қоса, PRDM14 және Fox01 жаңа зерттеу нысандары ретінде қосылды. Остеопонтин ақуызын тежеушінің моделі құрылды.

Африка жауын-шашын жобасы

Africa Rainfall Project (2019 жылдың қазан айында іске қосылды) жауын-шашын модельдеуді жақсарту үшін World Community Grid есептеу қуатын, The Weather Company деректерін және басқа да деректерді пайдаланады, бұл Сахара аймағынан оңтүстік Африкадағы фермерлерге егін өнімдерін табысты өсіруге көмектеседі. Есептеулерге жұмылдырылатын жедел жадтың (RAM) көлемі 1-ден 16 гигабайтқа дейін.

Адамның протеомын бүктеу 1-кезең

World Community Grid-те іске қосылған алғашқы жоба – Адам протеомын бүктеу жобасы, немесе HPF1, оның мақсаты – адам протеиндерінің құрылымын болжау. Жоба 2004 жылғы 16 қарашада басталды. Оны Жүйелер биологиясы институтының Ричард Бонно әзірлеген. Жоба желілік есептеулерді пайдаланып, әрбір протеин үшін Розетта бағасы арқылы ықтимал құрылымдарды шығарды. Осы болжамдардың негізінде зерттеушілер көптеген протеиндердің қызметін болжауға үміттенеді. Адам протеиндерін жақсырақ түсіну адам ауруларын емдеу жолында маңызды рөл атқаруы мүмкін. Бұл жоба бойынша есептеулер 2006 жылғы 18 шілдеде ресми түрде аяқталды. HPF1-дің ашытқы бөлігіне қатысты зерттеу нәтижелері жарияланды.

Қатерлі ісікпен күресуге көмектеседі

Help Defeat Cancer жобасы емдеудің ең тиімді жолдарын анықтау үшін дәрігерлердің мүмкіндіктерін арттыруға көмектеседі. Бұл жоба 2006 жылдың 20 шілдесінде іске қосылды.

Геномды салыстыру

"Геномды салыстыру" жобасын Бразилияның "Фиокруз" ғылыми-зерттеу институты демеушілік етеді.

1-кезең

Help Cure Muscular Dystrophy жобасын Décrypthon басқарады, ол French Muscular Dystrophy Association, French National Center for Scientific Research және IBM арасындағы ынтымақтастық нәтижесінде құрылған. 1-кезең 2006 жылдың 19 желтоқсанында басталды. Бұл жоба Grid MP клиентін пайдаланатын қолданушыларға ғана қолжетімді болды, сондықтан BOINC қолданушылары оған қатыса алмады.

Денгеге қарсы дәрілерді бірге табу

"Денгеге қарсы дәрілерді бірге табу" жобасы Техас және Чикаго университеттерінің ғалымдарының қолдауымен жүзеге асырылды және екі кезеңде өтеді. 1-кезең 2007 жылдың 21 тамызында басталды және 2008 жылдың шілдесінде аяқталды. 2-кезең 1-кезеңнен өткен үміткерлерді іріктеу үшін күрделі есептеулерді қажет ететін бағдарламаны пайдаланады. 2-кезеңнен өткен дәрі-дәрмек үміткерлері зертханада сынақтан өтеді.

Дүниежүзілік дәмді күріш

"Дүниеге пайдалы күріш" жобасын Вашингтон университетінің Рам Самудраланың есептеу биологиясы зерттеу тобы жүзеге асырды. Жоба 2008 жылдың 12 мамырында басталды және 2010 жылдың 6 сәуірінде аяқталды. 2010 жылдың 13 сәуірінде World Community Grid ресми түрде "Дүниеге пайдалы күріш" жобасы 2010 жылдың 6 сәуірінде аяқталғанын хабарлады.

Таза энергия жобасы

"Таза энергия" жобасын Гарвард университетінің химия және химиялық биология кафедрасының ғалымдары қолдау көрсетуде. "Таза энергия" жобасының миссиясы – жаңа буын күн батареялары және кейін энергия сақтау құрылымдары үшін жаңа материалдар табу болып табылады. Зерттеушілер молекулалық механика және электрондық құрылым есептеулерін қолданып, келесі буын күн элементтеріне айналатын молекулалардың оптикалық және тасымалдау қасиеттерін болжауда. 1-кезең 2008 жылдың 5 желтоқсанында басталды және 2009 жылдың 13 қазанында аяқталды. 2-кезең 2010 жылдың 28 маусымында басталды. Олардың нәтижелері Energy & Environmental Science журналына ұсынылды.

Балалық шақтағы қатерлі ісікпен күресуге көмектесу

Help Fight Childhood Cancer жобасы (2009 жылдың 13 наурызында іске қосылды). Help Fight Childhood Cancer жобасының мақсаты – балаларда ең көп кездесетін қатты ісіктердің бірі – нейробластомамен байланысты үш нақты белокты тежеуге болатын дәрілерді табу. Бұл дәрілерді анықтау, химиялық терапиямен бірге қолданылғанда, ауруды емдеу мүмкіндігін арттыруға ықпал етеді.

Гриппке қарсы вирустық препараттарды іздеу

Гриппке қарсы вирустық препараттарды іздеу жобасын доктор Стэн Ватович және оның зерттеу тобы Техас университетінің медициналық бөлімшесінде (Гальвестон, Техас, АҚШ) қаржылай қолдауда. Жоба 2009 жылдың 5 мамырында басталды және 2009 жылдың 22 қазанында аяқталды. "Гриппке қарсы вирустық препараттарды іздеу" жобасының 1-кезеңі 2009 жылдың 22 қазанында аяқталды. Қазір зерттеушілер 1-кезеңнің нәтижелерін пост-өңдеуден өткізіп, 2-кезеңге дайындалып жатыр.

2-кезең

World Community Grid және Decrypthon қолдаған зерттеушілер, AFM (Француз бұлшықет дистрофиясы қауымдастығы), CNRS (Француз ұлттық ғылыми зерттеу орталығы), Universite Pierre et Marie Curie және IBM арасындағы серіктестік арқылы 2200-ден астам белоктың белок-белок өзара әрекеттесуін зерттеді, олардың құрылымы белгілі, әсіресе нейромышекес ауруларында маңызды рөл атқаратын белоктарға назар аударылды. 2-кезең 2009 жылдың 12 мамырында басталды.

Бұлшықет дистрофиясын емдеуге көмектесу жобасының 2-кезеңі бірінші кезеңнің нәтижелері талданғаннан кейін басталды. 2-кезең BOINC платформасында іске асырылды.

Таза су үшін есептеу

Таза су үшін есептеу (2010 жылдың 20 қыркүйегінде іске қосылды). 2014 жылдың 25 сәуірінде жоба ғалымдары мақала жарияланғанда қуантарлық нәтижелерді хабарлайтындарын және WCG бойынша жұмыс аяқталғанын мәлімдеді.

Шистозомаға " жоқ " деп жауап беріңіз

Шистозомаға жоқ деңіздер (2012 жылдың 22 ақпанында іске қосылды). 2015 жылдың сәуірінде қосымша талдау жүргізіліп, ең перспективалы үш кандидат зат ин витро сынақтарына іріктелінді. Жоба 2012 жылдың 17 сәуірінде басталды.

Еболаны бірге жеңеміз

Outsmart Ebola Together – Эбола вирусына қарсы күресте қолданылатын химиялық қосылыстарды табуға көмектесу мақсатындағы Скриппс зерттеу институтымен бірлескен жоба. Ол 2014 жылдың 3 желтоқсанында бастау алды. Жобаның мақсаты – вирустың өмірлік циклының маңызды кезеңдерін, оның белгілі бір ақуыздарымен жоғары байланысқа түсетін дәрілерді анықтау арқылы тоқтату. Екі нысана бар: вирустың адам жасушаларын жұқтыру үшін пайдаланатын беттік ақуызы және түрлі функцияларды орындау үшін пішінін өзгертетін «трансформатор» ақуыздары. Жоба 2018 жылдың 6 желтоқсанында ресми түрде аяқталды.

OpenZika (ашық тілде)

OpenZika 2016 жылы 18 мамырда Зика вирусына қарсы күреске көмектесу үшін іске қосылды. Жоба Зика вирусының денеде тірі қалуы және таралуы үшін қолданылатыны саналатын белоктарға бағытталған, бұл денге қызуы және сары қызу сияқты ұқсас аурулардан алынған мәліметтерге негізделген. Осы мәліметтер зерттеушілерге Зикаға қарсы препарат әзірлеуге көмектеседі. Жоба 2019 жылдың 13 желтоқсанында ресми түрде аяқталды.

FightAIDS@Home (Қорытынды)

FightAIDS@Home (19 қараша 2005 ж. бастау алды) Бұл мақалада осы күнге дейінгі нәтижелер негізінен болашақ FightAIDS@Home есептеулерінің тиімділігін жақсарту үшін қолданылатыны түсіндіріледі.

FightAIDS@Home 2-ші кезең

FightAIDS@Home 2-ші кезеңі (30 қыркүйек 2015 жылы басталды) 1-ші кезеңнің нәтижелерін жан-жақты қарастырып отыр. Жобаның алғашқы тәжірибелерінде екі мақсаты бар: симуляция архитектурасы дұрыс жұмыс істеп, сенімді нәтижелер беруі, сондай-ақ BEDAM және AutoDock екеуін бірге қолдану, BEDAM немесе AutoDock-ті жеке қолданудан жақсы нәтижелер беруі керек.

Микробиомиялық иммунитет жобасы

Микробиомдық иммунитет жобасы (2017 жылдың тамызында басталды) – адам денесінде және оның бетінде орналасқан бактериялардағы ақуыздарды зерттеу; адам микробиомасы, ол шамамен 3 миллион жеке бактериялық геннен тұрады. Бактериялардың гендерін зерттеу арқылы олардың әрқайсысының пішінін анықтауға болады, ал әрбір физикалық пішін бактериялардың атқаратын қызметін анықтайды. Ынтымақтастықта жұмыс істейтін институттарға Калифорния университеті (Сан-Диего), MIT және Гарвардтың Брод институты, сондай-ақ Саймонс қорының Flatiron институты кіреді.