Кіріспе
Кішкентай, әдетте кодтамайтын РНК молекуласы. Кішкентай РНК (sRNA) – 200 нуклеотидтен кем полимерлі РНК молекулалары, және әдетте кодтамайды. РНК-ны үнсіздендіру осы молекулалардың жиі функциясы болып табылады, ең көп таралған және жақсы зерттелген мысалы – РНК-ның араласуы (RNAi), онда эндогендік микроРНК (miRNA) немесе экзогендік кіші араласатын РНК (siRNA) комплементарлық хабаршы РНК-ның ыдырауына себеп болады. Басқа кішкентай РНК кластары да анықталды, соның ішінде пиви-интерактивті РНК (piRNA) және оның кіші түрі – қайталанумен байланысты кіші интерференциялық РНК (rasiRNA). Кішкентай РНК "өздігінен РНК-ны үнсіздендіре алмайды, және осы міндетті орындау үшін ол РНК-протеин кешенінің ядросын құрауы керек, ол РНК-мен шақырылған үнсіздендіру кешені (RISC) деп аталады, әсіресе Аргонавт ақуызымен бірге". Кішкентай РНК бірнеше әдістер арқылы анықталды немесе секвенирленді, соның ішінде микроРНК секвенирлеу арқылы бірнеше секвенирлеу платформаларында тікелей, немесе геномдық секвенирлеу және талдау арқылы жанама түрде. miРНК-ны анықтау адам ауруларын анықтауда, мысалы, сүт безі қатерлі ісігі және қөптеген склероз сияқты жағдайларда бағаланды. Кішкентай РНК-ны бағалау белгілі бір зерттеулер үшін пайдалы, өйткені оның молекулаларын "кітапхана дайындау алдында фрагменттеудің қажеті жоқ". Пиви-интерактивті РНК (piRNA) кіші араласатын РНК (siRNA) кішкентай ядролық РНК (snRNA), сонымен қатар U РНК кішкентай ядролық РНК (snoRNA) кішкентай рДНК-дан алынған РНК (srRNA) tРНК фрагменті (tRF) Y РНК-дан алынған кішкентай РНК (ysRNA).
Small RNA (sRNA) are polymeric RNA molecules that are less than 200 nucleotides in length, and are usually non coding. RNA silencing is often a function of these molecules, with the most common and well studied example being RNA interference (RNAi), in which endogenously expressed microRNA (miRNA) or exogenously derived small interfering RNA (siRNA) induces the degradation of complementary messenger RNA. Other classes of small RNA have been identified, including piwi interacting RNA (piRNA) and its subspecies repeat associated small interfering RNA (rasiRNA). Small RNA "is unable to induce RNAi alone, and to accomplish the task it must form the core of the RNA–protein complex termed the RNA induced silencing complex (RISC), specifically with Argonaute protein". Small RNA have been detected or sequenced using a range of techniques, including directly by MicroRNA sequencing on several sequencing platforms, or indirectly through genome sequencing and analysis. Identification of miRNAs has been evaluated in detecting human disease, such as breast cancer. Multiple sclerosis. Evaluating small RNA is useful for certain kinds of study because its molecules "do not need to be fragmented prior to library preparation". Piwi interacting RNA (piRNA)
small interfering RNA (siRNA)
small nuclear RNA (snRNA), also commonly referred to as U RNA
small nucleolar RNA (snoRNA)
small rDNA derived RNA (srRNA)
tRNA fragment (tRF)
Y RNA derived small RNA (ysRNA)
Өсімдіктерде
Өсімдіктердегі алғашқы белгілі функция Арабидопсис түрінің мутанттарында анықталған. Атап айтқанда, РНК-ға тәуелді РНК полимераза және DICER-ге ұқсас өндіріс функцияларының әлсіреу мутацияларында. Бұл кемшілік, шын мәнінде, Арабидопсистің Heterodera schachtii және Meloidogyne javanica-ға қарсы тұру қабілетін арттырды. Сол сияқты, азайтылған аргонавт функциясы бар мутанттар – ago1 25, ago1 27, ago2 1, сондай-ақ ago1 27 және ago2 1 мутанттарының біріктірілген комбинациялары Meloidogyne incognita-ға қарсы жоғары төзімділік көрсетті. Барлығы бірге, бұл нематодалардың паразиттік тіршілігінің өсімдіктердің өзіндік шағын РНК-ларына қатты тәуелді екенін көрсетеді.