Кіріспе
Рибосомалық компонент. Пептидил трансфераза – аминоацилтрансфераза, сонымен қатар рибосоманың негізгі ферменттік функциясы, ол белок биосинтезі процесінде тРНК-ны пайдалана отырып, жанындағы аминқышқылдар арасында пептидтік байланыстарды түзетіп, пептидтік тізбектерді қалыптастырады. Пептидил трансфераза реакциясының субстраттары – екі тРНК молекуласы, олардың біреуі өсіп келе жатқан пептидтік тізбекті, ал екіншісі тізбекке қосылатын аминқышқылын ұстап тұрады. Пептидтік тізбек пен аминқышқылдар осы тРНК-лардың CCA 3'-ұшындағы O атомына эфирлік байланыс арқылы тиісті тРНК-ға бекітіледі. Пептидил трансфераза – ақуыз синтезінде полипептидтік тізбектің өсуі үшін аминқышқыл қалдықтарын қосуды катализдейтін фермент. Ол ірі рибосомалық бөлімшеде орналасқан, онда пептидтік байланыс түзетілуін катализдейді. Ол толығымен РНК-дан тұрады. Пептидил трансфераза орталығында рибосомаға байланысқан пептидил тРНК мен аминоацил тРНК-ның CCA ұштарының арасындағы сәйкестік оның осы реакцияларды катализдей алу қабілетіне әсер етеді. Бұл реакция нуклеофильдік орынбасу арқылы жүзеге асады. Аминоацил тРНК-ның амино тобы пептидил тРНК-ның терминалды карбоксил тобына шабуыл жасайды.
The peptidyl transferase is an aminoacyltransferase as well as the primary enzymatic function of the ribosome, which forms peptide bonds between adjacent amino acids using tRNAs during the translation process of protein biosynthesis. The substrates for the peptidyl transferase reaction are two tRNA molecules, one bearing the growing peptide chain and the other bearing the amino acid that will be added to the chain. The peptidyl chain and the amino acids are attached to their respective tRNAs via ester bonds to the O atom at the CCA 3' ends of these tRNAs. Peptidyl transferase is an enzyme that catalyzes the addition of an amino acid residue in order to grow the polypeptide chain in protein synthesis. It is located in the large ribosomal subunit, where it catalyzes the peptide bond formation. It is composed entirely of RNA. The alignment between the CCA ends of the ribosome bound peptidyl tRNA and aminoacyl tRNA in the peptidyl transferase center contribute to its ability to catalyze these reactions. This reaction occurs via nucleophilic displacement. The amino group of the aminoacyl tRNA attacks the terminal carboxyl group of the peptidyl tRNA.
Өмірбаян
Рибосомалық құрылымда үш байланыс орны бар: P орны, A орны және E орны. A орны – аминоацилдік орын, себебі A орнына аминоацилдік тРНК келіп түседі. Құрылымда A орнына эфирлік байланыс арқылы бекітілген аминқышқылының қалдығы және бос амин бар. P орнында, ол пептидилдік орын, бекітілген тРНК бар. Пептидил трансферазаның әрбір циклының басында P орнында өсіп келе жатқан пептидтік тізбегі бар тРНК-мен әрқашан басталатынын ескеру маңызды. Бұл орын алғаннан кейін аминоацилдік тРНК A орнына байланыса алады. Бұл 23S рРНК-ның A2451 және A2452 қалдықтарына әсер етеді және пептидтік байланыс түзлуын тежейді. Плеуромутилиндер де пептидил трансферазаға байланысады. Макролидті антибиотиктер рибосомалық транслокацияны тежеумен қатар пептидил трансферазаны да тежейді деп саналады.