Ағылшыншамен салыстырыңыз: абзацты басыңыз — түпнұсқа терезеде ашылады. Абзац астындағы EN түймесі оны мәтін ішінде көрсетеді.
Мазмұны
Кіріспе
AEBSF немесе 4 (2 аминоэтил) бензенсульфонил фторид хлоридті суда еритін, молекулалық массасы 239,5 Да болатын серин протеаза ингибиторы. Ол химоторипсин, калликрейн, плазмин, тромбин және трипсин сияқты протеаздарды тежейді. Белгілілігі ингибитор PMSF- ге ұқсас, алайда AEBSF төмен pH- да тұрақты. Әдетте 0, 1 - 1,0 мМ қолданылады. AEBSF (Pefabloc SC компаниясының Pentapharm компаниясынан сатылады) алғаш рет 1993 жылы биохимияда қолданылуы туралы хабарланды, ал серин протеазаларын тежеу және ацетилгидролазалар сияқты протеаза емес ферменттер үшін 1990 жылдардың ортасында кеңінен қолданыла бастады.
AEBSF or 4 (2 aminoethyl)benzenesulfonyl fluoride hydrochloride is a water soluble, irreversible serine protease inhibitor with a molecular weight of 239.5 Da. It inhibits proteases like chymotrypsin, kallikrein, plasmin, thrombin, and trypsin. The specificity is similar to the inhibitor PMSF, nevertheless AEBSF is more stable at low pH values. Typical usage is 0.1 1.0 mM. AEBSF (marketed as Pefabloc SC from the company Pentapharm) was first reported for use in biochemistry in 1993, and came into common use for the inhibition serine proteases and of non protease enzymes such as acetylhydrolases in the mid 1990s.
Әрекет ету механизмі
AEBSF серин қалдықтарының гидроксилін ковалентті түрде өзгертуге бағытталған, онда ол әр өзгертілген қалдыққа қосымша 183.0354 Da қосылуына әкеледі, бірақ тирозин, лизин, гистидин және N терминалды амино тобы сияқты мақсаттан тыс қалдықтар туралы да хабарланған. Бұл мақсаттан тыс қалдықтардың оңтайландырылмаған протоколдарда өзгеру жиілігінің едәуір болуына байланысты кейбір пайдаланушылар AEBSF-ті өте сезімтал протеомика қолданбалары үшін қолданбауды және оның орнына жаңа (және салыстырмалы түрде тұрақсыз) PMSF-ті пайдалануды ұсынады. AEBSF және PMSF екеуі де сульфонил фторидтері және сульфонилдендіруші заттар. Сульфонил фторидтері белсенді орынның серин қалдықтарының гидрокси тобымен реакцияға келіп, сульфонил ферментінің туындысын құрайды. Бұл туынды, жоғары рН-ден басқа жағдайларда, ұзақ уақыт бойы тұрақты болуы мүмкін.
AEBSF is targeted to covalently modify the hydroxyl of serine residues, where it causes an additional 183.0354 Da to be added to each modified residue, but other off target residues such as tyrosine, lysine, histidine, and the protein N terminal amino group, have also been reported. Due to the substantial frequency of modification of these off target residues in unoptimized protocols, some users recommend not using AEBSF for highly sensitive proteomics applications, and instead recommend using fresh (and comparatively unstable) PMSF. Both AEBSF and PMSF are sulfonyl fluorides and are sulfonylating agents. Sulfonyl fluorides act by reacting with the hydroxy group of the active site serine residue to form a sulfonyl enzyme derivative. This derivative may be stable for long periods of time except at high pH.
Холестеринді реттеу зерттеулерінде қолдану
AEBSF 1-орынның протеазасын (S1P) ингибициялау қабілеті күшті болғандықтан холестеринді реттеуші гендерді сипаттауға бағытталған зерттеулерде кеңінен қолданылады. Бұл серин протеазасы Голги аппаратында орналасқан, стерильді реттеуші элементті байлайтын белоктарды (SREBP) белсендіреді. S1P-ті селективті ингибициялау арқылы AEBSF-ті SREBP ингибициясының төменгі сатыдағы нәтижесін және оның холестеринді реттеуге әсерін сипаттауға пайдалануға болады.
AEBSF is extensively used in studies aiming to describe cholesterol regulatory genes due to its potent ability to inhibit Site 1 protease (S1P). This serine protease, located in the Golgi apparatus, is responsible for activating the sterol regulatory element binding proteins (SREBP). By selectively inhibiting S1P, AEBSF can be used to characterize the downstream result of SREBP inhibition and its influence on cholesterol regulation.