Введение

Механизм передачи программ экспрессии генов при клеточном делении. Букмаркирование (также "генное букмаркирование" или "митотическое букмаркирование") – это потенциальный механизм передачи программ экспрессии генов через клеточное деление. Во время митоза транскрипция генов подавляется, и большинство факторов транскрипции удаляются из хроматина. Термин "букмаркирование" проводит аналогию между транскрипцией и чтением книги. Пауза в транскрипции во время митоза подобна закрытию книги. "Молекулярные закладки" – это факторы, обеспечивающие возобновление транскрипции в упорядоченном виде в новообразовавшихся клетках после митоза (когда книга вновь открывается). Закладки соответствуют следующим критериям:

в какой-то момент до начала митоза промоторы генов, находящихся в транскрипционно-компетентном состоянии, становятся каким-либо образом "помеченными",
эта "пометка" сохраняется как в процессе, так и после митоза, и
пометка передает "память" об экспрессии генов, предотвращая митотическое компактирование ДНК в данном локусе или способствуя повторной сборке транскрипционных комплексов на промоторе, или и тому, и другому.

Заметка в качестве выборочного поддержания открытого состояния хроматина

Термин "букмаркировка" изначально был введен для описания сохранения некоторой структуры промоторов генов во время митоза. В последнее время доступность генома во время интерфазы и митоза была напрямую сравнена в масштабе всего генома. Хотя промоторы генов, как правило, сохраняются лучше, чем дистальные регуляторные элементы, наблюдается значительная вариабельность в отдельных участках.

Закладка методом метилирования ДНК, модификации гистонов после трансляции и вариантов гистонов

Некоторые паттерны модификации гистонов и присутствие определенных вариантов гистонов на ДНК остаются неизменными во время митоза и потенциально могут служить своего рода метками. Паттерны метилирования ДНК обычно сохраняются и также могут выполнять функцию меток.