Введение
В 2003 году финал Кубка УЕФА Интертото выиграли "Шальке 04", "Вильярреал" и "Перужа". Все три команды вышли в Кубок УЕФА.
Первый этап
Эта игра была объявлена недействительной УЕФА из-за инцидента с фанатами на стадионе с дымовой бомбой, брошенной на поле. Вторая игра в одиночку определила результат матча.
Ответный матч
22 в совокупности, Пашинг выиграл по правилу голь на выезде. Лиерс выиграл 7 на 1. Победа выиграла 72 в общей сложности. 3 на 3 в совокупности, Партизан выиграл по правилу голь в гостях. 3 на 3 в совокупности, Брно выиграл по правилу голь на выезде. Копер выиграл 32 в совокупности. Örgryte IS выиграл 41 в общей сложности. 3 на 3 в совокупности, Гьёр выиграл по правилу голь на выезде. Марек Дупница выиграл 5 на 4 в совокупности. Шамрок Роверс выиграл 3 на 1. 22 в совокупности, "Тампере Юнайтед" выиграл по правилу голь в гостях. Сутжеска выиграла 4 на 1. Глория Бистрица выиграла 62 в совокупности. OFK Beograd выиграл 53 в совокупности. Уил выиграл 2 на 1. Тобол выиграл 51 в совокупности. ZTS Dubnica выиграла 71 в совокупности. Dacia Chișinău выиграла 51 в совокупности. 2 на 2 в совокупности, Слобода Тузла выиграла в пенальти. Шахтиор Солигорск выиграл 8 на 1. "Альянс" выиграл со счетом 2-1.
Ответный матч
"Альянс" выиграл 1 - 0 в общем зачете. 4 на 4 в совокупности, Ницца выиграла по правилу голь на выезде. Словачко выиграл 4 на 3. 2 на 2 в совокупности, "Расинг де Сантандер" выиграл по правилу голь на выезде. Слован Либерец выиграл со счётом 4 - 0. Брно выиграло 4 на 3. Бреша выиграла 32 в совокупности. Вольфсбург выиграл 3 на 1. Cibalia выиграла 53 в совокупности. Тобол выиграл 30 в совокупности. Уил выиграл 4 на 3 в общем зачете. Пашинг выиграл 32 в совокупности. Лиерс выиграл 52 в совокупности. Тампере Юнайтед выиграл 10 в общем зачете. Dacia Chișinău выиграла 50 в совокупности. 3 на 3 в совокупности, Копер выиграл по правилу голь на выезде.
Ответный матч
Пашинг выиграл 40 в общем зачете. Перуджа выиграла 4 - 0 в общем зачете. Копер выиграл 5 на 4 в совокупности. Нант выиграл 5 на 3. Вердер Бремен выиграл 1 - 0 в общем зачете. Вильярреал выиграл 3 на 1. Брно выиграло 5 на 4 в совокупности. "Шальке 04" выиграл со счетом 3-1. Слован Либерец выиграл 31 в совокупности. Вольфсбург выиграл со счетом 3:0. Cibalia выиграла 21 в совокупности. "Херенвиен" выиграл со счетом 5-1.
Ответный матч
"Херенвиен" выиграл со счетом 2-1. Вольфсбург выиграл 8 на 1. "Шальке 04" выиграл со счетом 2:1. Пашинг выиграл 51 в общем зачете. Перуджа выиграла 1 - 0 в общем зачете. Вильярреал выиграл 3 на 1.
Ответный матч
"Шальке 04" выиграл со счетом 2:0. Перуджа выиграла со счетом 3:0. Вильярреал выиграл 2 на 1.