Кіріспе
Аскорбат пероксидаза ферменті (немесе L аскорбат пероксидаза, APX немесе APEX) - L аскорбат + H2O2 дегидроаскорбат + 2 H2O химиялық реакциясын катализдейтін фермент. Гема пероксидазалары биологияда әр түрлі, әдетте органикалық субстраттардың H2O2-ге тәуелді тотығуын катализациялайды. Бұл фермент оксидоредуктазалар тұқымдасына жатады, атап айтқанда, пероксидті акцептор ретінде (пероксидазалар) әсер ететін ферменттер. Бұл ферменттер класының жүйелі атауы - L аскорбат:сутек переоксиді оксидоредуктазасы. Басқа кең таралған атауларға L аскорбин қышқылы пероксидаза, L аскорбин қышқылына тән пероксидаза, аскорбат пероксидаза және аскорбин қышқылы пероксидаза жатады. Бұл фермент аскорбат пен альдараттың метаболизміне қатысады.
Ascorbate peroxidase (or L ascorbate peroxidase, APX or APEX) is an enzyme that catalyzes the chemical reaction
L ascorbate + H2O2 dehydroascorbate + 2 H2O
It is a member of the family of heme containing peroxidases. Heme peroxidases catalyse the H2O2 dependent oxidation of a wide range of different, usually organic, substrates in biology. This enzyme belongs to the family of oxidoreductases, specifically those acting on a peroxide as acceptor (peroxidases). The systematic name of this enzyme class is L ascorbate:hydrogen peroxide oxidoreductase. Other names in common use include L ascorbic acid peroxidase, L ascorbic acid specific peroxidase, ascorbate peroxidase, and ascorbic acid peroxidase. This enzyme participates in ascorbate and aldarate metabolism.
Шолу
Аскорбаттан тәуелді пероксидаза белсенділігі алғаш рет 1979 жылы, пероксидаза белсенділігінің тұңғыш рет қара шаян өсімдіктерінде байқалғанынан 150 жылдан астам уақыт өткеннен кейін және цитохром с пероксидаза ферментінің жақын туыстығының ашылғанына 40 жыл толғаннан кейін хабарланды. Пероксидазалар үш түрге (I, II және III сынып) бөлінеді: аскорбат пероксидазалар I сыныптағы пероксидаза ферменттері болып табылады. АПХ-тар өсімдіктерде, балдырларда және кейбір цианобактерияларда аскорбаттың H2O2 тәуелді тотығу процесін катализациялайды. APX цитохром c пероксидазамен жоғары дәйектілікте, бұл да I класты пероксидаза ферменті. Физиологиялық жағдайларда реакцияның тікелей нәтижесі - моногидроаскорбат радикалы моногидроаскорбат редуктаза (моногидроаскорбат редуктаза (NADH)) ферменті арқылы аскорбатқа қайтадан қайталанады. Редуктазаның жоқтығында екі монодегидроаскорбат радикалдар дегидроаскорбин қышқылы мен аскорбатқа тез арада теңшелмейді. APX глютатион аскорбатының интегралдық компоненті болып табылады.
Субстрат ерекшелігі
APX ферменттері электрон доноры ретінде аскорбатқа жоғары ерекшелік көрсетеді, бірақ көпшілік APX-тер III класты пероксидазаларға (мысалы, қарақұмық пероксидазасына) тән басқа да органикалық субстраттарды, кейбір жағдайларда аскорбатпен салыстырмалы жылдамдықпен тотықтайды. Бұл ферментті APX ретінде анықтау оңай емес дегенді білдіреді, бірақ әдетте аскорбат үшін ерекше белсенділік басқа субстраттарға қарағанда жоғары болған кезде қолданылады. APX тұқымдасының кейбір белоктарында аскорбатпен байланысатын амин қышқылдары қалдықтары жоқ, бұл олардың аскорбаттан басқа молекулаларды тотықтыруы мүмкін екенін көрсетеді.
Құрылымдық ақпарат
1995 жылы бұршақ цитозолы APX құрылымы туралы баяндалды. Соя цитозольді АПХ- ның физиологиялық субстрат - аскорбатпен және басқа да бірқатар субстраттармен байланысуы белгілі. 2007 жылдың аяғына қарай, 12 құрылымдар осы ферменттер класы үшін PDB қосылу кодтарымен шешілді , , , , , , , және .
Ұяшықтық бейнелеудегі қолдану
Тұқымдық APX және соялық APX және олардың мутанттары (APEX, APEX2) жасушалық бейнелеу үшін электронды микроскопиялық зерттеулерде қолданылды.