Кіріспе
Нуклеин қышқылының тізбектерін немесе полимерлерін синтездейтін ферменттер класы. Биохимияда полимераза – полимерлердің немесе нуклеин қышқылының ұзын тізбектерін синтездейтін фермент (EC 2.7.7.6/7/19/48/49). ДНК полимеразасы және РНК полимеразасы ДНҚ және РНК молекулаларын құрастыру үшін қолданылады, олар ДНҚ матрицасының тізбегін негіздік жұптасу арқылы немесе РНК-ны жартылай сатылық көшіру арқылы көшіреді. Термофильді бактерия Thermus aquaticus-тан (Taq) алынған ДНК полимеразасы (PDB 1BGX, EC 2.7.7.7) молекулалық биологияның маңызды әдісі – полимераза тізбектік реакциясында қолданылады. Полимераза матрицаға тәуелді немесе матрицаға тәуелсіз болуы мүмкін. Поли А полимеразасы – матрицаға тәуелсіз полимеразаның мысалы. Терминалдық дезоксинуклеотидил трансферазаның матрицаға тәуелді және матрицаға тәуелсіз әрекеттері бар екені белгілі.
In biochemistry, a polymerase is an enzyme (EC 2.7.7.6/7/19/48/49) that synthesizes long chains of polymers or nucleic acids. DNA polymerase and RNA polymerase are used to assemble DNA and RNA molecules, respectively, by copying a DNA template strand using base pairing interactions or RNA by half ladder replication. A DNA polymerase from the thermophilic bacterium, Thermus aquaticus (Taq) (PDB 1BGX, EC 2.7.7.7) is used in the polymerase chain reaction, an important technique of molecular biology. A polymerase may be template dependent or template independent. Poly A polymerase is an example of template independent polymerase. Terminal deoxynucleotidyl transferase also known to have template independent and template dependent activities.
Құрылымы бойынша
Полимеразалар көбінесе екі суперотбасыға бөлінеді: "оң қол" қатпар және "қос пси-бета баррель" (жиі "қос баррель" деп аталады) қатпар. Алғашқысы ДНҚ полимеразаларының және вирус бірлік полимеразаларының дерлік барлығында кездеседі; олар сақталған "ладонь" доменімен сипатталады. Екіншісі барлық көпбөлімді РНҚ полимеразаларында, cRdRP-де және археяларда табылған "D отбасы" ДНҚ полимеразаларында байқалады. "X" отбасы ДНҚ полимераза бетамен ұсынылған, оның "ладонь" пішіні нашар, кейде ол басқа суперотбасы деп есептеледі. Примазалар көбінесе екі категорияның біріне де жатпайды. Бактериялық примазалар әдетте Toprim доменін қамтиды және топоизомеразалармен және митохондриялық геликаза "twinkle"-мен байланысты. Архея және эукариоталық примазалар байланыссыз АЭП отбасын құрайды, бұл полимераза ладонімен байланысты болуы мүмкін. Дегенмен, екі отбасы да геликазалардың бір жиынтығымен байланысты.
Primases generally don't fall into either category. Bacterial primases usually have the Toprim domain, and are related to topoisomerases and mitochondrial helicase twinkle. Archae and eukaryotic primases form an unrelated AEP family, possibly related to the polymerase palm. Both families nevertheless associate to the same set of helicases.