Введение

Класс ферментов, синтезирующих цепи нуклеиновых кислот или полимеров.

В биохимии полимераза – это фермент (EC 2.7.7.6/7/19/48/49), который синтезирует длинные цепи полимеров или нуклеиновых кислот. ДНК-полимераза и РНК-полимераза используются для сборки молекул ДНК и РНК соответственно, копируя цепь-матрицу ДНК посредством взаимодействия комплементарных оснований или РНК посредством полуконсервативной репликации. ДНК-полимераза из термофильной бактерии *Thermus aquaticus* (Taq) (PDB 1BGX, EC 2.7.7.7) используется в полимеразной цепной реакции – важной методике молекулярной биологии. Полимераза может быть шаблон-зависимой или шаблон-независимой. Поли(А)-полимераза является примером шаблон-независимой полимеразы. Терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза также обладает как шаблон-зависимой, так и шаблон-независимой активностью.

По структуре

Полимеразы обычно разделяют на два суперсемейства: с "правой рукой" и с "двойным пси-бета-барелем" (часто просто "двойным барелем"). Первое встречается почти во всех ДНК-полимеразах и почти во всех вирусных полимеразных субъединицах; они характеризуются консервативным доменом "ладонь". Второе встречается во всех многосубъединичных РНК-полимеразах, в cRdRP и в ДНК-полимеразах "семейства D", обнаруженных у архей. "Семейство X", представленное ДНК-полимеразой бета, имеет лишь смутное очертание "ладони" и иногда рассматривается как отдельное суперсемейство. Примазы обычно не попадают ни в одну из этих категорий. Бактериальные примазы обычно содержат домен Toprim и связаны с топоизомеразами и митохондриальной геликазой twinkle. Примазы архей и эукариот формируют неродственное семейство AEP, возможно, связанное с "ладонью" полимеразы. Тем не менее, оба семейства взаимодействуют с одним и тем же набором геликаз.