Введение

Бактериальные белки

Флагеллины – это семейство белков, присутствующих в бактериях, имеющих жгутики, которые выстраиваются в полый цилиндр, формируя нить жгутика. Масса флагеллина в среднем составляет около 40 000 дальтон. Флагеллины являются основным компонентом бактериальных жгутиков и играют решающую роль в бактериальной подвижности. Ген, кодирующий флагеллин, имеет разные названия у разных видов бактерий, например, flaA (у Helicobacter pylori), fliC, fljB. Он транспортируется через центр нити к её кончику, где спонтанно полимеризуется, становясь частью нити. У E. coli он разворачивается во время транспортировки флагелярным шапероном FliS. Нить состоит из одиннадцати меньших "протофиламентов", девять из которых содержат флагеллин в L-образной форме, а два других – в R-образной форме. Спиральные N- и C-концы флагеллина формируют внутреннее ядро белка флагеллина и отвечают за его способность полимеризоваться в нить. Средние остатки формируют внешнюю поверхность жгутиковой нити. Хотя концы белка довольно схожи у всех бактериальных флагеллинов, средняя часть сильно варьируется и может отсутствовать у некоторых видов. Домены флагеллина нумеруются от спирального ядра (D0/D1) к внешней стороне (D2, …); при анализе аминокислотной последовательности D0/D1 располагаются на обоих концах. Белки, структурно подобные флагеллину, встречаются и в других частях жгутика, таких как крючок (flgE; …), стержень у основания и колпачок на вершине. Средняя часть флагеллина E. coli (и родственных видов), D3, имеет бета-листовую структуру и, по-видимому, поддерживает стабильность жгутика.

В растениях

Кроме того, известно, что последовательность из 22 аминокислот (flg22) консервативной N-концевой части флагеллина активирует защитные механизмы растений. Восприятие флагеллина у Arabidopsis thaliana осуществляется через киназу, подобную рецептору, FLS2 (FLAGELLIN SENSING 2). При обнаружении flg22, FLS2 быстро связывается с BAK1 (BRI1-ассоциированная киназа 1) для инициирования передачи сигнала посредством взаимной трансфосфорилирования их киназных доменов. Как флагеллин, так и УФ-С действуют сходным образом, увеличивая гомологичную рекомбинацию, что было продемонстрировано Molinier et al. в 2006 году. Помимо этого соматического эффекта, они обнаружили, что он распространяется и на последующие поколения растений. Митоген-активированные протеинкиназы (MAPK) выступают в качестве нисходящих сигнальных молекул, в конечном итоге приводящих к иммунитету, индуцированному PAMP, при котором более 900 генов повышают или понижают свою экспрессию под воздействием flg22. Предварительная стимуляция синтетическим пептидом flg22 привела к усилению устойчивости к бактериальным вторженцам.