Интегрированная нанолитровой системы для микрофлюидных анализов.
Integrated nanoliter system
Интегрированная нанолитровая система: точное измерение, смешение и разделение микрожидкостей. Применение в синтетической биологии и генетическом анализе.
Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Содержание
Введение
Интегрированная нанолитровая система – это измерительное, разделяющее и смешивающее устройство, способное измерять жидкости в объеме нанолитров, смешивать различные жидкости для получения конкретного продукта и разделять раствор на более простые составляющие. Все характеристики интегрированной нанолитровой системы специально разработаны для управления очень малыми объемами жидкости (именуемыми микрофлюидными растворами). Масштабируемость интегрированной нанолитровой системы зависит от типа метода обработки, на котором она основана (именуемого технологической платформой), при этом каждый метод обработки имеет свои преимущества и недостатки. Возможные области применения интегрированной нанолитровой системы включают контроль биологических жидкостей (именуемый синтетической биологией) и точное обнаружение изменений в клетках для генетических целей (например, анализ экспрессии генов в отдельных клетках), где уменьшенный масштаб напрямую влияет на результат и точность.
The integrated nanoliter system is a measuring, separating, and mixing device that is able to measure fluids to the nanoliter, mix different fluids for a specific product, and separate a solution into simpler solutions. All features of the integrated nanoliter system are specifically designed for controlling very small volumes of liquid (referred as microfluidic solutions). The integrated nanoliter system's scalability depends on what type of processing method the system is based on (refer as technology platform) with each processing method having its advantages and disadvantages. Possible uses for the integrated nanoliter system are in controlling biological fluids (refer as synthetic biology) and accurately detecting changes in cells for genetic purposes (such as single cell gene expression analysis) where the smaller scale directly influences the result and accuracy.
Особенности
Интегрированная нанолитровая система состоит из микрофабрикованных каналов для жидкости, нагревателей, датчиков температуры и флуоресцентных детекторов. Микрофабрикованные каналы для жидкости (по сути, очень маленькие трубки) служат основными транспортными структурами для любых жидкостей и местом, где происходят реакции в системе. Для протекания необходимых реакций требуется регулировка температуры. Поэтому нагреватели прикреплены к некоторым микрофабрикованным каналам для жидкости. Для контроля и поддержания необходимой температуры датчики температуры играют решающую роль в успешном протекании реакций. Для точного отслеживания жидкостей до и после реакции используются флуоресцентные детекторы для регистрации их перемещения в системе. Например, когда определенная жидкость проходит через определенную точку, где она вызывает или возбуждает излучение света, флуоресцентный детектор способен зарегистрировать это излучение и вычислить время, необходимое для достижения этой точки.
The integrated nanoliter system consists of microfabricated fluidic channels, heaters, temperature sensors, and fluorescence detectors. The microfabricated fluidic channels (basically very small pipes) act as the main transportation structures for any fluids as well as where reactions occur within the system. For the desired reactions to occur, the temperature needs to be adjusted. Therefore, heaters are attached to some microfabricated fluidic channels. To monitor and maintain the desired temperature, temperature sensors are crucial for successful and desired reactions. In order to accurately track the fluids before and after a reaction, fluorescence detectors are used for detecting the movements of the fluids within the system. For instance, when a specific fluid passes a certain point where it triggers or excites emission of light, the fluorescence detector is able to receive that emission and calculate the time it takes to reach that certain point.
Электрокинетическая манипуляция
Основным методом обработки для управления жидкостью на этой технологической платформе является капиллярный электрофорез, который основан на электрокинетическом явлении. Капиллярный электрофорез – эффективный метод управления жидкостями, поскольку заряженные частицы жидкости направляются управляемым электрическим полем внутри системы. Однако одним из недостатков данной методики является сильная зависимость управления частицами жидкости от их исходного заряда. Другой недостаток – возможность утечек жидкости внутри системы, возникающих из-за диффузии, которая зависит от размера частиц жидкости.
The main processing method for controlling the fluid under this technology platform is the capillary electrophoresis, which is an electrokinetic phenomena. Capillary electrophoresis is a great method for controlling fluids because the charged particles of the fluid are being directed by the controllable electric field within the system. However, a disadvantage of the technique is that the method of controlling the fluid's particles heavily depends on the particles' original charges. Another disadvantage is that the possible fluid "leaks" within the system. These "leaks" occur through diffusion which are dependent on the size of the fluid's particles.
Анализ экспрессии генов в одной клетке
Еще одно возможное применение интегрированной нанолитровой системы – анализ экспрессии генов в отдельных клетках. Одним из преимуществ использования интегрированной нанолитровой системы является ее способность более точно определять изменения экспрессии генов по сравнению с предыдущим методом микромассивов. Микроскопическая масштабируемость нанолитровой системы (от нанолитров до пиколитров) позволяет анализировать экспрессию генов на уровне отдельных клеток (около 1 пиколитра), в то время как микромассив анализирует изменения экспрессии генов, усредняя данные по большой группе клеток. Другим удобным и важным преимуществом интегрированной нанолитровой системы является возможность предварительного размещения всех необходимых биологических жидкостей в системе, путем хранения каждой жидкости в специализированной микрофабрикованной жидкостной сети. Интегрированная нанолитровая система удобна тем, что биологическими жидкостями управляет компьютер, в отличие от предыдущих систем, требовавших ручной загрузки каждой жидкости. Кроме того, интегрированная нанолитровая система важна для анализа экспрессии генов, поскольку "закрытая" конструкция системы во время работы предотвращает нежелательное влияние загрязнений на результаты анализа.
Another possible use of the integrated nanoliter system is in single cell gene expression analysis. One benefit of using the integrated nanoliter system is its capability to detect the changes of a gene expression more accurately than the previous technique of microarray. The nanoliter system's microscopic scalability (nanoliter to picoliter scale) allows it to analyze the gene expression at the single cell level (around 1 picoliter), while the microarray analyzes changes of the gene expression by averaging a large group of cells. Another convenient and important benefit is the integrated nanoliter system's capability of having all the necessary biological fluids in the system before operation by storing each biological fluid in a specific microfabricated fluidic network. The integrated nanoliter system is convenient because the biological fluids are all controlled by a computer compared to how previous systems required a manual loading of every biological fluid. The integrated nanoliter system is also important for the gene expression analysis because the analysis would not be undesirably influenced by contamination due to the "closed" system while in operation.