Сигналы нацеливания белков в пероксисомы: PTS1, PTS2 и mPTS.
Peroxisomal targeting signal
Сигналы PTS: узнаваемые аминокислотные последовательности для транспортировки белков в пероксисомы. Роль рецепторов в локализации и биохимическом таргетинге.
Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Введение
Признаваемая последовательность аминокислот
Recognizable amino acid sequence
В биохимическом направлении белков пероксисомальный сигнальный признак (PTS) – это участок пероксисомального белка, который распознается и связывается рецепторами. Он определяет локализацию белков, содержащих этот мотив, в пероксисоме.
In biochemical protein targeting, a peroxisomal targeting signal (PTS) is a region of the peroxisomal protein that receptors recognize and bind to. It is responsible for specifying that proteins containing this motif are localised to the peroxisome.
Обзор
Все пероксисомальные белки синтезируются в цитоплазме и должны быть направлены в пероксисому. Первый этап этого процесса – связывание белка с рецептором. Затем рецептор направляет комплекс к пероксисоме. Рецепторы распознают и связываются с областью пероксисомального белка, называемой пероксисомальным сигналом нацеливания, или PTS. Пероксисомы состоят из матрицы, окруженной специфической мембраной. Большинство пероксисомальных матричных белков содержат короткую последовательность, обычно из трех аминокислот в крайнем карбоксильном конце белка, которая служит в качестве PTS. Прототипическая последовательность (существует множество вариаций) – серин-лизин-лейцин (SKL в однобуквенном коде аминокислот). Этот мотив и его вариации известны как PTS1, а рецептор называется рецептором PTS1. Было установлено, что рецептор PTS1 кодируется геном PEX5. PEX5 импортирует свернутые белки в пероксисому, перемещаясь между пероксисомой и цитозолем. PEX5 взаимодействует с большим количеством других белков, включая Pex8p, 10p, 12p, 13p, 14p. Некоторые пероксисомальные матричные белки имеют другую, менее консервативную последовательность в своих аминотерминальных областях. Этот сигнал PTS2 распознается рецептором PTS2, кодируемым геном PEX7. "PEX" относится к группе генов, которые были идентифицированы как важные для синтеза пероксисом. Числовые обозначения, такие как PEX5, обычно относятся к порядку, в котором они были впервые обнаружены. Для белков, предназначенных для пероксисомальной мембраны, используется отдельный мотив, называемый "mPTS", который определен хуже и может состоять из разрозненных субдоменов. Одним из них обычно является кластер основных аминокислот (аргининов и лизинов) в петле белка (то есть между трансмембранными доменами), обращенной к матрице. Рецептор mPTS является продуктом гена PEX19.
All peroxisomal proteins are synthesized in the cytoplasm and must be directed to the peroxisome. The first step in this process is the binding of the protein to a receptor. The receptor then directs the complex to the peroxisome. Receptors recognize and bind to a region of the peroxisomal protein called a peroxisomal targeting signal, or PTS. Peroxisomes consist of a matrix surrounded by a specific membrane. Most peroxisomal matrix proteins contain a short sequence, usually three amino acids at the extreme carboxy tail of the protein, that serves as the PTS. The prototypic sequence (many variations exist) is serine lysine leucine ( SKL in the one letter amino acid code). This motif, and its variations, is known as the PTS1, and the receptor is termed the PTS1 receptor. It was found that the PTS1 receptor is encoded by the PEX5 gene. PEX5 imports folded proteins into the peroxisome, shuttling between the peroxisome and cytosol. PEX5 interacts with a large number of other proteins, including Pex8p, 10p, 12p, 13p, 14p. A few peroxisomal matrix proteins have a different, and less conserved sequence, at their amino termini. This PTS2 signal is recognized by the PTS2 receptor, encoded by the PEX7 gene. "PEX" refers to a group of genes that were identified as being important for peroxisomal synthesis. The numerical attributions, such as PEX5, generally refer to the order in which they were first discovered. A distinct motif is used for proteins destined for the peroxisomal membrane called the "mPTS" motif, which is more poorly defined and may consist of discontinuous subdomains. One of these usually is a cluster of basic amino acids (arginines and lysines) within a loop of protein (i. e., between membrane spans) that will face the matrix. The mPTS receptor is the product of PEX19.