Введение
Многие клеточные линии, широко используемые в биомедицинских исследованиях, были перерощены другими, более агрессивными клетками. Например, клеточные линии, считавшиеся линиями щитовидной железы, на самом деле оказались меланомами, предполагаемая ткань простаты – раком мочевого пузыря, а нормальные культуры матки – раком молочной железы. Это список клеточных линий, подвергшихся перекрестному заражению и переросших другими клетками. Оценки, основанные на скрининге клеточных линий лейкемии и лимфомы, показывают, что около 15% этих линий не соответствуют общепринятым представлениям об их происхождении. В настоящее время реализуется проект по идентификации и переименованию зараженных клеточных линий, чтобы избежать ошибок в исследованиях, вызванных ошибочной атрибуцией. Зараженные клеточные линии широко использовались в исследованиях без понимания их истинной природы. Например, большинство, если не все исследования эндотелия ECV 304 или мегакариоцитов DAMI на самом деле проводились на клетках карциномы мочевого пузыря и эритролейкемии соответственно. Таким образом, все исследования функций эндотелия или мегакариоцитов с использованием этих клеточных линий оказались ошибочными, служа скорее предостерегающим примером. Существует два основных пути заражения клеточной линии: обмен культурами клеток между исследовательскими группами; если образец загрязняется во время работы с ним и затем передается, последующие обмены клетками приведут к установлению контаминирующей популяции, хотя части исходной клеточной линии все еще могут быть аутентичными. Более серьезным является заражение на исходном этапе: при создании исходной клеточной линии некоторые контаминирующие клетки случайно попадают в культуру, где со временем перерастают желаемые клетки. Первоначальное тестирование в этом случае может указывать на подлинность и новизну клеточной линии, но на самом деле она исчезает вскоре после создания, и все образцы такой линии представляют собой контаминирующие клетки. Для определения точного момента заражения клеточной линии требуются длительные исследования. Случайная путаница клеточных линий может быть ошибочно принята за заражение, но обычно предполагается именно заражение. После обнаружения заражения клеточной линии она обычно больше не используется в исследованиях, требующих конкретного типа клеток, которым она, как считалось, является. Большинство зараженных клеточных линий утилизируются, однако иногда контаминирующие клетки приобретают новые характеристики (например, в результате мутации или вирусной трансфекции, как в случае производной HeLa Det98) и, таким образом, формируют новую клеточную линию, поэтому их не выбрасывают. Если есть подозрение на заражение клеточной линии, обычно проводится проверка ее подлинности. Широко распространенное загрязнение клеток HeLa впервые было выявлено Уолтером Нельсоном Рисом с помощью простого кариотипирования по Гиемзе под световым микроскопом. Этот метод хорошо работает для идентификации HeLa, поскольку эти клетки имеют характерные хромосомные аберрации. Новые клеточные линии как можно скорее после создания размножаются, распространяются и/или депонируются в специализированных учреждениях, таких как ATCC, чтобы минимизировать риск их загрязнения. Считается хорошей практикой периодически проверять клеточные линии, поддерживаемые в лабораторных условиях (т.е. не помещенные в долгосрочное хранение), на предмет заражения HeLa или другими распространенными контаминантами, чтобы обеспечить сохранение их качества и целостности.
Many cell lines that are widely used for biomedical research have been overgrown by other, more aggressive cells. For example, supposed thyroid lines were actually melanoma cells, supposed prostate tissue was actually bladder cancer, and supposed normal uterine cultures were actually breast cancer. This is a list of cell lines that have been cross contaminated and overgrown by other cells. Estimates based on screening of leukemia lymphoma cell lines suggest that about 15% of these cell lines are not representative of what they are usually assumed to be. A project is currently underway to enumerate and rename contaminated cell lines to avoid errors in research caused by misattribution. Contaminated cell lines have been extensively used in research without knowledge of their true character. For example, most if not all research on the endothelium ECV 304 or the megakaryocyte DAMI cell lines has in reality been conducted on bladder carcinoma and erythroleukemia cells, respectively. Thus, all research on endothelium or megakaryocyte specific functions utilizing these cell lines has turned out to be misguided, serving more of a warning example. There are two principal ways a cell line can become contaminated: cell cultures are often exchanged between research groups; if, during handling, a sample gets contaminated and then passed on, subsequent exchanges of cells will lead to the contaminating population being established, although parts of the supposed cell line are still genuine. More serious is contamination at the source: during establishment of the original cell line, some contaminating cells are accidentally introduced into the cultures, where they in time outgrow the desired cells. The initial testing, in this case, still suggested that the cell line is genuine and novel, but in reality, it has disappeared soon after being established and all samples of such cell lines are actually the contaminant cells. It requires lengthy research to determine the precise point where cell lines have become contaminated. A mix up rated as contamination could in reality be a simple confusion of two cell lines, but usually contamination is assumed. After a cell line has been discovered to be contaminated, they are usually never used again for research demanding the specific type of cell line they are assumed to be. Most contaminated cell lines are discarded, however sometimes contaminant cells have acquired novel characteristics (e. g., by mutation or viral transfection, for example the HeLa derivate Det98) and thus constitute a novel lineage after all, so are not thrown away. If a cell line is thought to be contaminated, it is usually tested for authenticity. The widespread contamination of HeLa cells was initially recognized by Walter Nelson Rees using simple Giemsa stain karyotyping under a light microscope. This technique works well in recognizing HeLa because these cells have distinctive chromosome aberrations. Novel cell lines are proliferated and distributed and/or deposited at a safekeeping institution such as the ATCC as soon as possible after establishment, to minimize the odds that the line becomes spoiled by contamination. It is considered good practice to periodically check cell lines maintained under laboratory conditions (i. e., not placed in long term storage) for contamination with HeLa or other common contaminants, to ensure that their quality and integrity are maintained.
Списки зараженных клеточных линий
Этот список, содержащий 488 клеточных линий, был последний раз обновлен 1 декабря 2016 года. Cellosaurus также поддерживает список "проблемных" клеточных линий. Список динамически генерируется на основе всех клеточных линий в базе данных, имеющих комментарий, содержащий ключевые слова "Проблемная клеточная линия". По состоянию на 2017 год список содержит 757 записей. Если вид не указан в отдельных строках следующих таблиц, вид, указанный в таблице, относится как к предполагаемому, так и к фактическому типу клеток. Клеточные линии, помеченные как "Виртуальные" в таблице ниже, являются известными случаями контаминации в источнике; эти клеточные линии вымерли или никогда не существовали. Случаи, когда наличие незагрязненных линий известно или вызывает серьезные подозрения, отмечены как "Существующие".
Загрязненные человеческие клеточные линии
Предполагаемая клеточная линия Существует? Предполагаемый тип клетки Реальная клеточная линия Реальный тип клеток Ссылка Cellosaurus 207 Существует пре-B клеточный лейкоз REH или CCRF CEM пре-B клеточный или T клеточный лейкоз CVCL K034 2474/90 Виртуальная карцинома желудка HT 29 карцинома толстой кишки CVCL M629, CVCL M627 2957/90 Виртуальная карцинома желудка HT 29 карцинома толстой кишки CVCL D101 AO Виртуальная амнион HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL D631 ARH 77 Существует? лейкоз плазматических клеток неизвестно вирус Эпштейна-Барр трансфицированный B-клеточный лимфобластоид CVCL 1072 AV3 Виртуальная амнион HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL 1904 BCC1/KMC Виртуальная базальноклеточная карцинома HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL A033 BE 13 Виртуальная T-клеточная лейкемия PEER T-клеточная лейкемия Drexler et al. (2003) CVCL 1081 BJA B Существует лимфома Беркитта REH пре-B клеточная лейкемия Drexler et al. (2003) CVCL 5711 BLIN 1, 1E8 Виртуальная пре-B клеточная лейкемия NALM 6 пре-B клеточная лейкемия Drexler et al. (2003) CVCL 8173 BM 1604 Виртуальная карцинома предстательной железы DU 145 карцинома предстательной железы CVCL 1968 BrCa 5 Виртуальная карцинома молочной железы HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL D280 BT 20 Существует карцинома молочной железы HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL 0178 CaMa (cl 15) Виртуальная карцинома молочной железы неизвестно клетки лабораторной мыши/золотистого хомяка CVCL 1T14 CaOV Виртуальная карцинома яичников HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL M091 CaVe Виртуальная карцинома желудка HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL 8444 Chang liver печень HeLa аденокарцинома шейки матки; Lacroix (2008) CVCL 0238 CHB Виртуальная астроцитома неизвестно клетки глии лабораторной крысы? CVCL 1R45 CMP, CMPII C2 Виртуальная аденокарцинома кишечника HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL D297 CVCL L115 CO (COLE) Виртуальная болезнь Ходжкина CCRF CEM T-клеточная лейкемия CVCL J653 COLO 818 Виртуальная меланома COLO 800 меланома CVCL 1998 D18T Виртуальная синовиальная клетка HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL 8669 DAMI Виртуальная мегакариоцитарная лейкемия HEL эритролейкемия MacLeod et al. (1997a, b) CVCL 4360 DAPT Виртуальная пилоцитарная астроцитома HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL D279 Detroit 6 (Det6) Виртуальный костный мозг стегна HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL 2436 Detroit 30A (Det30A) Виртуальная карцинома асцита HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL 8674 Detroit 98 (Det98), Det98/AG,Det98/AH 2, Det98/AHR Виртуальный костный мозг стегна HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL 8188 DD Виртуальная злокачественная гистиоцитоз K 562 терминальная ХМЛ Drexler et al. (2003) CVCL J651 EB33 Виртуальная простата HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL 8344 ECV 304 Виртуальный нормальный эндотелий T 24 карцинома мочевого пузыря Dirks et al. (1999); Lacroix (2008) CVCL 2029 EH Виртуальная волосатоклеточная лейкемия HK волосатоклеточная лейкемия Drexler et al. (2003) CVCL L804 ElCo Виртуальная карцинома молочной железы HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL 8686 EPLC 32M1 Виртуальная карцинома легких HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL 8193 EPLC 65H Виртуальная карцинома легких HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL 8194 ESP1 Виртуальная спорадическая лимфома Беркитта HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL 8351 EU 1 Виртуальная пре-B клеточная лейкемия REH пре-B клеточная лейкемия Drexler et al. (2003) CVCL 8857 EU 7 Виртуальная T-клеточная лейкемия CCRF CEM T-клеточная лейкемия Drexler et al. (2003) CVCL 8865 EUE Виртуальная подкожная ткань плода HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL 7262 EVLC2 Виртуальная трансфицированная эндотелия пупочной вены неизвестно неэндотелиальная? Unger et al. (2002) CVCL 8687 F2 4E5 Виртуальный эпителий тимуса SK HEP 1 карцинома печени CVCL A040 F2 5B6 Виртуальный эпителий тимуса SK HEP 1 карцинома печени CVCL A041 F255A4 Виртуальная HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL 8688 FL Виртуальная амнион HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL 1905 FQ, RB, RY, SpR Виртуальная болезнь Ходжкина селезенка OMK 210 почки ночной обезьяны с тремя полосами CVCL L984, CVCL L985, CVCL U964, CVCL L986 G 11 Виртуальная карцинома молочной железы HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL U962 GHE Виртуальная астроцитома T 24 карцинома мочевого пузыря CVCL 8199 Girardi heart сердце HeLa аденокарцинома шейки матки; Lacroix (2008) CVCL 2254 GM01312 миелома неизвестно вирус Эпштейна-Барр трансфицированный B-клеточный лимфобластоид Drexler et al. (2003) CVCL J111 GM01500 миелома неизвестно вирус Эпштейна-Барр трансфицированный B-клеточный лимфобластоид Drexler et al. (2003) CVCL D870 GREF X Виртуальный миофибробласт печени неизвестно клеточная линия лабораторной крысы CVCL 7667 HAEND ангиосаркома печени неизвестно неэндотелиальная? Unger et al. (2002) CVCL 8690 hAG Виртуальная аденоматоидная зоба T 24 карцинома мочевого пузыря CVCL 8223 HBC Виртуальная инфильтративная протоковая карцинома неизвестно клеточная линия крысы CVCL M630 HBT3, HBT E, HBT 39b Виртуальная карцинома молочной железы HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL D281, CVCL M746, CVCL J652 HCE Виртуальная карцинома шейки матки HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL M619 HEK Виртуальная эмбриональная почка HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL M624 HEK/HRV трансфицированная эмбриональная почка HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL M625 HEL R66 Виртуальная эмбриональная легкая линия клеток гриве CVCL 1R39 HEp 2 Виртуальная эпидермоидная карцинома гортани HeLa аденокарцинома шейки матки Chen (1988); Lacroix (2008) CVCL 1906 HIMeg 1 Существует? ХМЛ HL 60 миелобластная лейкемия Drexler et al. (2003) CVCL 8439 HKB 1 Виртуальная болезнь Ходжкина неизвестно неизвестно Drexler et al. (2003) CVCL 5290 HMV 1 Виртуальная меланома HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL 8233 HPB ALL Существует T-клеточная лейкемия Jurkat T-клеточная лейкемия Drexler et al. (2003) CVCL 1820 HPB MLT Виртуальная T-клеточная лейкемия HPB ALL T-клеточная лейкемия Drexler et al. (2003) CVCL 7959 hPTC Виртуальная папиллярная карцинома щитовидной железы неизвестно клеточная линия домашней свиньи CVCL 8224 HS 445 Болезнь Ходжкина неизвестно вирус Эпштейна-Барр трансфицированный B-клеточный лимфобластоид Drexler et al. (2003) CVCL 0761 HS Sultan Виртуальная множественная миелома плазмацитома Jijoye Эндемичная лимфома Беркитта Drexler et al. (2001) CVCL 2516 HuK°39 Виртуальная почка HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL 8283 HuT Виртуальная фибросаркома производная линия клеток 8387 HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL M861 IM 9 Множественная миелома неизвестно вирус Эпштейна-Барр трансфицированный B-клеточный лимфобластоид; Lacroix (2008) CVCL 1305 IMC 2 Виртуальная карцинома верхней челюсти HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL 8245 Intestine 407 (INT 407) Виртуальный эпителий кишечника HeLa аденокарцинома шейки матки; Lacroix (2008) CVCL 1907 J96 Виртуальная лейкемическая кровь HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL 3990 J111 Виртуальная моноцитарная лейкемия HeLa аденокарцинома шейки матки; Lacroix (2008) CVCL 2965 JHC Виртуальная плацента HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL M093 JHT Виртуальная трансфицированная плацента HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL M620 JOSK I, K, M, S Виртуальная моноцитарная лейкемия U 937 гистиоцитарная лимфома CVCL 2082, CVCL 81411, CVCL 2083, CVCL 8142 K051 Существует? миелобластная лейкемия K 562 терминальная ХМЛ Drexler et al. (2003) CVCL 3000 Karpas 45 Существует T-клеточная лейкемия неизвестно неизвестно CVCL 1326 KB Виртуальная оральная карцинома HeLa аденокарцинома шейки матки; Lacroix (2008) CVCL 0372 KBM 3 Существует моноцитарная лейкемия HL 60 миелобластная лейкемия Drexler et al. (2003) CVCL A425 KE 37 Существует T-клеточная лейкемия CCRF CEM T-клеточная лейкемия CVCL 1327 KM 3 Существует? пре-B клеточная лейкемия REH пре-B клеточная лейкемия CVCL 0011 KMS 21 BM Существует? миелома неизвестно неизвестно Drexler et al. (2003) CVCL 2991 KPB M15 Виртуальная терминальная ХМЛ KYO 1 терминальная ХМЛ Drexler et al. (2003) CVCL 5308 KP P1 Виртуальная карцинома предстательной железы HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL D283 L132 Виртуальный эпителий эмбриона легких HeLa аденокарцинома шейки матки; Lacroix (2008) CVCL 1908 L 540 Существует болезнь Ходжкина CCRF CEM T-клеточная лейкемия Drexler et al. (2003) CVCL 1362 L 591 Существует? болезнь Ходжкина неизвестно вирус Эпштейна-Барр трансфицированный B-клеточный лимфобластоид Drexler et al. (2003) CVCL 1867 LED Ti карцинома шейки матки HeLa аденокарцинома шейки матки CVCL 8438 LR10.6 ...