Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Содержание
Введение
Мотив связывания АТФ – это последовательность примерно из 250 аминокислотных остатков в первичной структуре белка, связывающего АТФ. Этот мотив связан со структурой и/или функцией белка. АТФ – это молекула энергии, которая может выступать в роли кофермента, участвующего во множестве биологических реакций. АТФ эффективно взаимодействует с другими молекулами посредством связывающего участка. Участок связывания АТФ – это среда, в которой АТФ каталитически активирует фермент и, в результате, гидролизуется до АДФ. Связывание АТФ вызывает конформационные изменения в ферменте, с которым оно взаимодействует. Генетическое и функциональное сходство таких мотивов демонстрирует микроэволюцию: белки, скорее всего, использовали существующую последовательность связывания из других ферментов, а не разрабатывали ее независимо. Участки связывания АТФ, которые могут представлять собой АТФ-связывающий мотив, встречаются во многих белках, требующих энергии (от АТФ), таких как активные мембранные транспортеры, субъединицы микротрубочек, белки жгутиков, а также различные гидролитические и протеолитические ферменты.
An ATP binding motif is a 250 residue sequence within an ATP binding protein’s primary structure. The binding motif is associated with a protein’s structure and/or function. ATP is a molecule of energy, and can be a coenzyme, involved in a number of biological reactions. ATP is proficient at interacting with other molecules through a binding site. The ATP binding site is the environment in which ATP catalytically actives the enzyme and, as a result, is hydrolyzed to ADP. The binding of ATP causes a conformational change to the enzyme it is interacting with. The genetic and functional similarity of such a motif demonstrates micro evolution: proteins have co opted the same binding sequence from other enzymes rather than developing them independently. ATP binding sites, which may be representative of an ATP binding motif, are present in many proteins which require an input of energy (from ATP), such sites as active membrane transporters, microtubule subunits, flagellum proteins, and various hydrolytic and proteolytic enzymes.
Первичная последовательность
Короткие мотивы, участвующие в связывании АТФ, — это мотивы Уокера, Уокер А, также известный как P-петля, и Уокер В, а также мотив C и переключающий мотив.
The short motifs involving ATP binding are the Walker motifs, Walker A, also known as the P loop, and Walker B, as well as the C motif and switch motif.
Уокер Мотив
У участка Уолкера А есть первичная аминокислотная последовательность, или буква может обозначать любую аминокислоту.
The Walker site A has a primary amino acid sequence of or The letter can represent any amino acid.
Мотив ходока Б
Первичная аминокислотная последовательность сайта Уолкера B имеет вид , где обозначает любую гидрофобную аминокислоту. Ввиду разнообразия аминокислот, которые могут входить в первичную последовательность как сайта Уолкера А, так и сайта Уолкера B, не изменяющиеся аминокислоты в последовательности обладают высокой степенью консервации. Мутация любой из этих аминокислот может повлиять на связывание АТФ или нарушить каталитическую активность фермента.
The primary amino acid sequence of the Walker B site is , in which represents any hydrophobic amino acid. Due to the variety of different amino acids that can be used in the primary sequence, of both the Walker site A and B, the non variant amino acids within the sequence are highly conserved. A mutation of any of these amino acids will affect the binding ATP or interfere with the catalytic activity of the enzyme.