Charles David Allis

Введение

Чарльз Дэвид Аллис (22 марта 1951 - 8 января 2023) - американский молекулярный биолог, профессор Джой и Джек Фишман в Рокфеллеровском университете. Он также был руководителем лаборатории хроматиновой биологии и эпигенетики и профессором в Три институциональной программе MDPhD (другие два учреждения - Мемориальный центр рака Слоан-Кеттеринг и медицина Уилла Корнелла).

Ранние годы и образование

Аллис родилась и выросла в Цинциннати, штат Огайо. Его отец был градостроителем, а мать учительницей начальной школы. В 1969 году поступил в Университет Цинциннати, специализировался на биологии. Он получил свой первый опыт фундаментальных исследований в старшем (или четвертом) году бакалавра наук. Этот опыт привлек его к исследованиям, и он пошёл в Университет Индианы в Блумингтоне для аспирантуры. Он получил степень магистра в 1975 году и докторскую степень три года спустя под руководством Энтони Маховальда. Аллис вернулся в Университет Рочестера в 1995 году, а два года спустя стал профессором биологии Мари Курран Уилсон и Джозеф Чемберлен Уилсон. В 1998 году Аллис поступил в отделение биохимии и молекулярной генетики в Медицинскую школу Университета Вирджинии. В 2003 году он присоединился к Рокфеллеровскому университету в качестве профессора Джоя и Джека Фишмана и руководителя лаборатории биологии и эпигенетики хроматина. Биология хроматина в то время не была популярной темой; также не было использования цилированных организмов. Это был первый случай, когда гистон ацетилтрансферазы были связаны с активацией транскрипции ДНК, подтвердив гипотезу Винсента Олфри в 1960-х годах о том, что ацетилирование гистонов регулирует транскрипцию. После этого первоочередного доклада Аллис продолжил исследование ацетилирования гистонов, обнаружив больше гистон ацетилтрансфераз, включая TAF1 (часть фактора транскрипции TFIID, необходимой для инициирования транскрипции). Аллис также разветвлял исследования фосфорилирования и метилирования гистонов. Он связал фосфорилирование гистонов с митозом и стимуляцией митогена и установил синергетическую связь между фосфорилированием гистонов и ацетилированием. Он также определил роль метилирования в лизине 9 гистона H3, идентифицировал SET-домен, содержащий белки, как гистон метилтрансферазы, и обнаружил, что повсеместное присутствие гистонов регулирует метилирование гистонов. В 2000 году Аллис и Брайан Страл предложили "гипотезу гистонового кода", согласно которой транскрипция ДНК в значительной степени регулируется модификациями гистонов. Позже Аллис (вместе с Томасом Дженувейн) явно связал гистонный код с эпигенетикой и признал клиническое значение модификаций гистонов, особенно при раковых заболеваниях. В последние годы его внимание обратилось к "онкогистонам", которые являются гистонами с мутациями, которые искажают нормальные модификации гистонов, приводя к раку.

Allis was born and raised in Cincinnati, Ohio. His father was a city planner and his mother an elementary school teacher. He entered the University of Cincinnati in 1969, majoring in biology. He had his first experience of basic research in his senior (or fourth) year of Bachelor of Science. The experience attracted him to research, and he went to Indiana University Bloomington for graduate studies. He graduated with an MSc in 1975 and a PhD three years later, under the supervision of Anthony Mahowald. Allis returned to the University of Rochester in 1995, and became the Marie Curran Wilson and Joseph Chamberlain Wilson Professor of Biology two years later. In 1998, Allis went to the Department of Biochemistry and Molecular Genetics at the University of Virginia School of Medicine. He joined the Rockefeller University in 2003 as the Joy and Jack Fishman Professor and Head of the Laboratory of Chromatin Biology and Epigenetics. Chromatin biology at the time was not a popular topic; nor was the use of ciliated organisms. This was the first time that histone acetyltransferases were connected to DNA transcription activation, verifying Vincent Allfrey's hypothesis in the 1960s that histone acetylation regulates transcription. Following this seminal report, Allis continued studying histone acetylation, discovering more histone acetyltransferases, including TAF1 (part of the transcription factor TFIID needed to initiate transcription). Allis also branched off to researching histone phosphorylation and histone methylation. He linked histone phosphorylation to mitosis and mitogen stimulation, and established a synergistic relationship between histone phosphorylation and acetylation. He also determined the role of methylation at lysine 9 of histone H3, identified SET domain containing proteins as histone methyltransferase, and found that histone ubiquitylation regulates histone methylation. In 2000, Allis and Brian Strahl proposed the "histone code hypothesis", which states that DNA transcription is largely regulated by histone modifications. Later, Allis (together with Thomas Jenuwein) explicitly associated the histone code with epigenetics, and recognized the clinical significance of histone modifications, especially in cancers. In more recent years, his attention turned to "oncohistones", which are histones with mutations that distort normal histone modifications, leading to cancers.