Кіріспе

Эукариоттық жасушаның цитоплазмасындағы мембраналар

Эндомебраналық жүйе эукариоттық жасушаның цитоплазмасында орналасқан әртүрлі мембраналардан (эндомебраналардан) құралған. Бұл мембраналар жасушаны функционалдық және құрылымдық бөлімдерге, яғни органельдерге бөледі. Эукариоттарда эндомембраналық жүйенің органелдеріне мыналар жатады: ядролық мембрана, эндоплазмалық тор, Гольги аппараты, лизосомалар, везикулалар, эндосомалар және плазмалық (клеткалық) мембрана, сондай-ақ басқалары. Жүйе дәлірек айтқанда, бір функционалдық және даму бірлігін құрайтын мембраналар жиынтығы ретінде сипатталады, олар тікелей байланысқан немесе везикулалар арқылы материал алмасады. Маңыздысы, эндомембраналық жүйе пластидтер мен митохондриялардың мембраналарын қамтымайды, бірақ олардың әрекеттерінен ішінара пайда болған болуы мүмкін (төменде қараңыз). Ядролық мембрана ядроның ішкі мазмұнын қоршап тұратын липидтік екі қабаттан тұрады. Эндоплазмалық тор (ЭТ) – өсімдік және жануар жасушаларының цитоплазмасына тармақталатын синтез және тасымалдау органелі. Гольги аппараты – молекулалардың басқа жасуша компоненттеріне жеткізілуі немесе жасушадан шығарылуы үшін жиналатын көп бөлімдерден тұратын құрылым. Вакуольдер, өсімдік және жануар жасушаларында кездеседі (өсімдік жасушаларында әлдеқайда ірі), жасушаның пішіні мен құрылымын сақтауға, сондай-ақ қоқымды заттарды жинауға жауапты. Везикула – заттарды сақтайтын немесе тасымалдайтын мембранамен оралған салыстырмалы түрде кішкентай қысқа. Жасуша мембранасы – жасушаға кіретін және одан шығатын заттарды реттейтін қорғаныш кедергісі. Сонымен қатар, тек саңырауқұлақтарда ғана кездесетін және гифа ұшының өсуімен байланысты "Шпицценкёрпер" деп аталатын органел бар. Прокариоттарда эндомембраналар сирек кездеседі, бірақ көптеген фотосинтездік бактерияларда плазмалық мембрана күшті бүктеліп, жасуша цитоплазмасының көп бөлігін жарық жинайтын мембрана қабаттары толтырады. Бұл жарық жинайтын мембраналар көк күкірт бактерияларында хлоросомалар деп аталатын жабық құрылымдарды құрауы мүмкін. Тағы бір мысал – Тиомаргарита түрлерінің, әсіресе T. magnifica-ның күрделі "пепин" жүйесі. Эндомембраналық жүйенің органелдері тікелей байланыс арқылы немесе мембрана сегменттерін везикулалар арқылы беру арқылы байланысты. Осы қарым-қатынастарға қарамастан, әртүрлі мембраналар құрылымы мен функциясы бойынша бірдей емес. Мембрананың қалыңдығы, молекулалық құрамы және метаболизмі тұрақты емес, мембрананың өмірлік циклі барысында бірнеше рет өзгеруі мүмкін. Мембраналардың біріктіретін негізгі ерекшелігі – липидтік екі қабат, оған екі жағынан немесе олардың арасынан белоктар бекітілген.

Тұжырымдаманың тарихы

Липидтердің көпшілігі ашытқыда эндоплазмалық ретикулумда, липидтік бөлшектерде немесе митохондрияда синтезделеді, ал липид синтезі плазмалық мембранада немесе ядролық мембранада өте аз немесе мүлдем болмайды. Сфинголипидтердің биосинтезі эндоплазмалық ретикулумда басталады, бірақ Гольги аппаратында аяқталады. Сүтқоректілердегі жағдай да ұқсас, бірақ пероксисомалардағы эфирлі липидтердің биосинтезінің алғашқы бірнеше қадамы басқаша. Сондықтан, басқа субклеткалық органеллаларды қоршап тұратын әртүрлі мембраналар липидтерді синтез орындарынан тасымалдау арқылы құрылуы керек. Дегенмен, липид тасымалы органелла биогенезінің орталық процесі екені анық болса да, липидтердің жасушалар арқылы қалай тасымалданатынының механизмдері әлі де толыққанды түсініксіз. 1974 жылы Морре мен Молленгауэр жасуша ішіндегі мембраналар өзінің құрамдас бөліктері арасында материал алмасатын біртұтас жүйе құрайтыны туралы алғашқы ұсынысты жасады. Бұл ұсыныс әртүрлі липид мембраналарының жасушада қалай жиналатынын түсіндіру мақсатымен жасалды, осы мембраналар липид синтезі орындарынан липид ағыны арқылы жиналады. Мембраналар мен везикулалардың үздіксіз жүйесі арқылы липид ағыны идеясы, әртүрлі мембраналардың цитозол арқылы май қышқылдары мен стеролдар сияқты еркін липидтік компоненттерді тасымалдау арқылы қалыптасқан тәуелсіз құрылымдар болуына балама болды. Липидтердің цитозол арқылы тасымалдануы және үздіксіз эндомембраналық жүйе арқылы липид ағыны бір-бірін жоққа шығаратын процестер емес, және екеуі де жасушаларда жүруі мүмкін. Сыртқы ядролық мембрана эндоплазмалық ретикулум мембранасымен үздіксіз байланысқан, және осы құрылым сияқты, бетінде бекітілген рибосомаларға ие. Сыртқы мембрана ішкі ядролық мембранамен де үздіксіз байланысқан, өйткені екі қабат ядролық қабықты тесіп өтетін, ядролық порлар деп аталатын көптеген кішкентай тесіктерде біріктірілген. Бұл порлардың диаметрі шамамен 120 нм және молекулалардың ядро мен цитоплазма арасындағы өтуін реттейді, кейбіреулеріне мембранадан өтуге мүмкіндік береді, ал басқаларына жол бермейді. Ядролық порлар жоғары трафик аймағында орналасқандықтан, олар жасуша физиологиясында маңызды рөл атқарады. Сыртқы және ішкі мембраналар арасындағы кеңістік перинуклеарлық кеңістік деп аталады және эндоплазмалық ретикулумның люменімен байланысқан. Ядролық қабықтың құрылымын аралық жіпшелер желісі (ақуыз жіпшелері) анықтайды. Бұл желі ядролық ламина деп аталатын тор тәрізді қабатқа ұйымдастырылған, ол хроматинмен, интегралды мембрана ақуыздарымен және ядроның ішкі беті бойындағы басқа ядролық компоненттермен байланысады. Ядролық ламина ядроның ішіндегі материалдарға ядролық порға жетуге және митоз кезінде ядролық қабықтың ыдырауына, сондай-ақ процестің соңында оның қайта құрастырылуына көмектеседі деп есептеледі.

Эндоплазмалық торша

Эндоплазмалық тор (ЭТ) – ядролық қабықтың кеңейтілген бөлігі болып табылатын, мембраналық синтез және тасымалдау органелі. Эукариоттық жасушалардағы жалпы мембрананың жартысынан астамын ЭТ құрайды. ЭТ бір-бірімен байланысқан деп есептелетін, жалпақталған қаптар мен тармақталған түтікшелерден тұрады, сондықтан ЭТ мембранасы бір ішкі кеңістікті қамтитын үздіксіз жамылғы құрайды. Бұл жоғары икемделген кеңістік ЭТ люмені деп аталады және ЭТ цистерналық кеңістігі деп те аталады. Люмен жасушаның жалпы көлемінің шамамен он пайызын құрайды. Эндоплазмалық тор мембранасы молекулаларды люмен мен цитоплазма арасында таңдап тасымалдауға мүмкіндік береді, ал ядролық қабықшаға байланысқандықтан, ядро мен цитоплазма арасында канал қамтамасыз етеді. ЭТ жасушаның ішінде және сыртында қолданылатын биохимиялық қосылыстарды өндіруде, өңдеуде және тасымалдауда орталық рөл атқарады. Оның мембранасы – жасушаның көптеген органелдерінің барлық трансмембраналық ақуыздары мен липидтерінің өндіріс орны, оның ішінде ЭТ-нің өзі, Гольджи аппараты, лизосомалар, эндосомалар, секреторлық везикулалар және плазмалық мембрана. Сонымен қатар, жасушадан шығатын барлық ақуыздар, сондай-ақ ЭТ, Гольджи аппараты немесе лизосомалар үшін арналған ақуыздар бастапқыда ЭТ люменіне жеткізіледі. Осылайша, эндоплазмалық тордың люменінің цистерналық кеңістігінде кездесетін көптеген ақуыздар басқа жерлерге жол жүзінде уақытша ғана болады. Дегенмен, басқа ақуыздар люменде тұрақты болып қалады және эндоплазмалық торда тұратын ақуыздар деп аталады. Бұл арнайы ақуыздар белгілі бір аминоқышқылдар тізбегінен тұратын арнайы тоқтату сигналын қамтиды, ол оларды органельде ұстап тұруға мүмкіндік береді. Эндоплазмалық торда тұратын маңызды ақуыздың мысалы – BiP деп аталатын шаперон ақуызы, ол дұрыс құрастырылмаған немесе өңделмеген басқа ақуыздарды анықтайды және оларды соңғы пункттеріне жібермейді. ЭТ ақуыздардың котрансляциялық сұрыпталуына қатысады. ER сигналдық тізбегін қамтитын полипептидті ақуыздың өндірісін тоқтататын сигналды тану бөлшегі таниды. SRP жаңа пайда болған ақуызды ЭТ мембранасына жеткізеді, онда ол мембраналық канал арқылы босатылады және трансляция жалғасады. ЭТ-нің құрылымы мен функциясы бойынша ерекшеленетін екі бөлек, бірақ байланысқан аймағы бар: тегіс ЭТ және қабырғалы ЭТ. Қабырғалы эндоплазмалық тор цитоплазмалық бетін рибосомалар жауып тұрғандықтан осылай аталады, бұл оған электронды микроскоп арқылы қарағанда дөңгелек көрініс береді. Тегіс ЭТ тегіс көрінеді, өйткені оның цитоплазмалық бетінде рибосомалар жоқ.

Тегіс ER функциялары

Ұяшықтардың басым көпшілігінде тегіс ER аймақтары сирек кездеседі және көбінесе жартылай тегіс, жартылай дөрекі болады. Олар кейде ауыспалы ER деп аталады, себебі олар ER шығу орындарын қамтиды, олардан жаңа синтезделген ақуыздар мен липидтерді тасымалдайтын көпіршіктер Голги аппаратына тасымалдау үшін бүршіктеп шығады. Дегенмен, кейбір арнайы жасушаларда тегіс ER көп мөлшерде болады және қосымша функцияларды атқарады. Осы арнайы жасушалардың тегіс ER липидтер синтезі, көмірсулар метаболизмі және дәрі-дәрмектер мен улардың залалсыздандырылуы сияқты әртүрлі метаболикалық процестерде қатысады. Дөрекі ER секреторлық ақуыздарды жасаумен қатар, ақуыздар мен фосфолипидтердің қосылуы арқылы өсетін мембраналарды да жасайды. Рибосомалардан өсетін мембраналық ақуыздарға арналған полипептидтер ER мембранасына енгізіліп, гидрофобтық бөліктерімен оның ішінде тұрақтандырылады. Дөрекі ER өз мембраналық фосфолипидтерін де өндіреді; ER мембранасына енгізілген ферменттер фосфолипидтерді құрастырады. ER мембранасы кеңейеді және тасымалдаушы көпіршіктер арқылы эндомембраналық жүйенің басқа компоненттеріне берілуі мүмкін. ER-ден жіберілген, ақуыздарды қамтитын көпіршіктер Голги аппаратында одан әрі өңделіп, содан кейін жасушадан секрецияға немесе жасушаның басқа бөліктеріне тасымалдауға дайындалады. Голги аппаратының ферменттермен қапталған кеңістігі арқылы ақуыздардың саяхаты кезінде әртүрлі өзгерістер болуы мүмкін. Гликопротеиндердің көмірсулар бөлігін өңдеу және синтездеу ақуыз өңдеуде жиі кездеседі. Голги аппараты қант мономерлерін алып тастап, оларды алмастырады, нәтижесінде көптеген олигосахаридтер түзіледі. Голги ақуыздарды өңдеуден басқа, макромолекулаларды да өндіреді. Өсімдік жасушаларында Голги пектиндер мен өсімдік құрылысына қажетті басқа полисахаридтерді синтездейді. Өңдеу процесі аяқталғаннан кейін, Голги аппараты өнімдерін сұрыптап, жасушаның әртүрлі бөліктеріне жібереді. Бұл үшін Голги ферменттері молекулалық идентификациялық таңбалар немесе белгілер қосады. Барлық нәрсе ұйымдастырылғаннан кейін, Голги аппараты өз өнімдерін транс бетінен бүршіктеп шығатын көпіршіктер арқылы жібереді.

Вакуолалар

Вакуольдер, везикулалар сияқты, жасуша ішіндегі мембранамен байланысқан қапшықтар болып табылады. Олар везикулалардан ірілеу және олардың нақты функциясы әртүрлі. Вакуольдердің жұмыс істеу принциптері өсімдік және жануар вакуольдерінде өзгеше. Өсімдік жасушаларында вакуольдер жасушаның жалпы көлемінің 30-90%-ын құрайды. Көптеген жетілген өсімдік жасушалары тонопласт деп аталатын мембранамен оралған бір үлкен орталық вакуольді қамтиды. Өсімдік жасушаларының вакуольдері жасушаның қоректік заттары мен қалдықтарын сақтау бөлімшелері ретінде қызмет етеді. Бұл молекулалар сақталатын ерітінді жасуша шырыны деп аталады. Жасушаға түс беретін пигменттер кейде жасуша шырынында орналасады. Вакуольдер жасушаның көлемін де арттыра алады, ол су қосылғанда ұзарады, сондай-ақ тургор қысымын (жасуша қабырғасының құлауын болдырмайтын осмостық қысымды) реттейді. Жануар жасушаларының лизосомалары сияқты, вакуольдердің де қышқыл pH деңгейі бар және гидролиттік ферменттерді қамтиды. Вакуольдердің pH деңгейі жасушада гомеостаздық процестерді жүзеге асыруға мүмкіндік береді. Мысалы, жасуша ортасындағы pH төмендеген кезде, цитозолге ағын түсетін H+ иондарын цитозолдың pH деңгейін тұрақты ұстау үшін вакуольге беруге болады. Жануарларда вакуольдер экзоцитоз және эндоцитоз процестерінде қатысады. Эндоцитоз – заттардың жасушаға сіңірілуі, ал экзоцитоз – заттардың жасушадан жасушадан тыс кеңістікке шығарылуы. Сіңірілетін материал плазмалық мембранамен қоршалады, содан кейін вакуольге беріледі. Эндоцитоздың екі түрі бар: фагоцитоз (жасушалардың жеуі) және пиноцитоз (жасушалардың ішуі). Фагоцитоз кезінде жасушалар бактериялар сияқты ірі бөлшектерді жұтады. Пиноцитоз – бұл осыған ұқсас процесс, бірақ сіңірілетін заттар сұйық күйде болады.

Бәлелшектер

Везикулалар – молекулаларды әртүрлі бөлімдер арасында тасымалдауға мүмкіндік беретін, мембранамен жабық шағын тасымалдаушы бірліктер. Көптеген везикулалар эндоплазмалық торда құралған мембраналарды Гольги аппаратына, содан кейін Гольги аппаратынан әртүрлі орындарға жеткізеді. Везикулалардың әртүрлі типтері бар, әрқайсысының өзгеше белок құрамы болады. Көбінесе олар мембрананың белгілі бір аймақтарынан пайда болады. Везикула мембранадан бүршіккен кезде, оның цитозольді бетінде нақты белоктар болады. Везикулаға баратын әрбір мембрананың цитозольді бетінде маркер болады. Бұл маркер везикуладағы, мембранаға беттесетін белоктармен сәйкес келеді. Везикула мембрананы тапқан соң, олар бірігіп кетеді. Везикулалардың үш түрі белгілі: клатринмен қапталған, COPI және COPII қапталған везикулалар. Әрқайсысы жасушада әртүрлі функцияларды атқарады. Мысалы, клатринмен қапталған везикулалар Гольги аппараты мен плазмалық мембрана арасында заттарды тасымалдайды. COPI және COPII қапталған везикулалар ER мен Гольги аппараты арасындағы тасымалдау үшін жиі қолданылады. Егер лизосома жарылса, цитозолдың бейтарап pH болғандықтан, бөлінетін ферменттер тым белсенді болмайды. Бірақ, көптеген лизосомалар зақымданса, жасуша өзін-өзі қорыту нәтижесінде жойылуы мүмкін. Лизосомалар фагоцитоз деп аталатын процесте (грекше phagein – жеу және kytos – ыдыс, бұл жерде жасушаға қатысты) вакуольмен бірігіп, ішкі жасушалық қорытуды жүзеге асырады және ферменттерін вакуольге шығарады. Осы процестің арқасында қанттар, аминқышқылы және басқа мономерлер цитозолға өтіп, жасуша үшін қоректік заттарға айналады. Лизосомалар гидролиттік ферменттерін автофагия деп аталатын процесте жасушаның ескірген органеллаларын қайта өңдеу үшін пайдаланады. Лизосома басқа органелланы жұтып алып, оның ферменттерін пайдаланып, жұтылған материалды ыдыратады. Содан алынған органикалық мономерлер цитозолға қайта пайдалану үшін қайтарылады. Лизосоманың соңғы функциясы – автолиз арқылы жасушаның өзін қорыту.

Шпиценекер

Шпиццекорпер – тек саңырауқұлақтарда ғана кездесетін эндомембраналық жүйенің құрамдас бөлігі және гифа ұшының өсуімен байланысты. Ол – жасуша қабырғасының құраушыларын қамтитын мембранамен шектелген көпіршіктердің жиынтығынан тұратын, фазалық қара дене болып табылады. Шпиццекорпер Гольджи аппараты мен жасуша мембранасы арасындағы осы құраушылардың жиналу және шығарылу ортасы ретінде қызмет етеді. Шпиццекорпер жылдам қозғалып, алға жылған сайын жаңа гифа ұшының өсуін қамтамасыз етеді. Жасушаның плазмалық мембранасы көптеген функцияларды атқарады. Оларға – жасушаға қоректік заттарды тасымалдау, қалдықтардың шығуына мүмкіндік беру, жасушаға қажетсіз материалдардың енуін болдырмау, қажетті заттардың жасушадан шығуына жол бермеу, цитозольдің pH деңгейін сақтау және цитозольдің осмостық қысымын тұрақтандыру кіреді. Бұл функцияларды іске асыру үшін кейбір материалдарды өткізіп, ал кейбіреулерін өткізбейтін тасымалдау ақуыздары қолданылады. Бұл ақуыздар АТФ гидролизі арқылы материалдарды концентрация градиентіне қарсы сорғылайды.

Эволюция

Эндомембраналық жүйенің пайда болуы эукариоттардың өзінің пайда болуымен және эукариоттардың митохондрияның эндосимбиотикалық тегінен пайда болуымен байланысты. Эндомембраналық жүйенің пайда болуын түсіндіру үшін көптеген модельдер ұсынылды (шолу үшін қараңыз). Ең соңғы тұжырымдамаға сәйкес, эндомембраналық жүйе эндосимбиотикалық митохондрияның бөліп шығарған сыртқы мембраналық везикулаларынан (көпіршікшелерінен) пайда болған және қабылдаушы прокариоттың инвагинацияларының (қатпарларының) ішінде жабылып қалған (бұл өз кезегінде эндосимбионтты жұтудың нәтижесі). Эндомембраналық жүйенің пайда болуына қатысты бұл OMV (сыртқы мембраналық везикулалар) негізделген модель қазіргі таңда эукариоттардың пайда болуында ең аз жаңалықтарды қажет етеді және митохондрияның жасушаның басқа құрылымдарымен көптеген байланыстарын түсіндіреді. Қазіргі уақытта бұл "іштен сыртқа" гипотезасы (альфапротеобактериялар, митохондрияның ата-тегі, асгардаархеонның мембраналық бүгілулерімен (блебтерімен) қамтылған, ал кейіннен бүгілулер бірігіп, эндомембраналық жүйеге айналатын инвагинацияларды (қатпарларды) қалдырған) "сырттан ішке" гипотезасынан (эндамембраналық жүйе археялық мембрананың ішіндегі инвагинациялардан (қатпарлардан) пайда болды деген болжам) басымдыққа ие.