Кіріспе
Энзимдердің онлайн-дерекқоры BRENDA (The Comprehensive Enzyme Information System) – энзимдердің ең толық жиынтығын қамтитын ақпараттық жүйе. Бұл IUBMB жіктемесі бойынша сараланған ферменттер туралы молекулалық және биохимиялық ақпаратты қамтитын электрондық ресурс. Әрбір жіктелген фермент оның катализдейтін биохимиялық реакциясы бойынша сипатталады. Тиісті реагенттердің (яғни субстраттар мен өнімдердің) кинетикалық қасиеттері егжей-тегжейлі түрде сипатталған. BRENDA алғашқы ғылыми әдебиеттен қолмен алынған ферменттерге қатысты деректерді және мәтіндік талдау сияқты автоматты ақпаратты іздеу әдістері арқылы алынған қосымша деректерді қамтиды. Ол деректерге қолайлы және кеңейтілген қол жеткізуді қамтамасыз ететін веб-базалық пайдаланушы интерфейсін ұсынады.
BRENDA (The Comprehensive Enzyme Information System) is an information system representing one of the most comprehensive enzyme repositories. It is an electronic resource that comprises molecular and biochemical information on enzymes that have been classified by the IUBMB. Every classified enzyme is characterized with respect to its catalyzed biochemical reaction. Kinetic properties of the corresponding reactants (that is, substrates and products) are described in detail. BRENDA contains enzyme specific data manually extracted from primary scientific literature and additional data derived from automatic information retrieval methods such as text mining. It provides a web based user interface that allows a convenient and sophisticated access to the data.
Тарих
BRENDA 1987 жылы Брауншвейгтегі бұрынғы Германияның биотехнология ғылыми-зерттеу орталығында (қазіргі Гельмгольц инфекцияны зерттеу орталығында) құрылды және бастапқыда кітаптар сериясы ретінде жарық көрді. Оның атауы бастапқыда BRaunschweig ENzyme DAtabase деген сөздердің бас әріптерінен құралған. 1996-2007 жылдар аралығында BRENDA Кёльн университетінде орналасқан. Сол жерде BRENDA жалпыға қолжетімді ферменттер туралы ақпарат жүйесіне айналды. 2007 жылы BRENDA Брауншвейгке қайта оралды. Қазіргі уақытта BRENDA Брауншвейгтегі BRICS (Брауншвейг жүйелік биологиясының интеграцияланған орталығы) -да күтіліп, одан әрі дамытылуда. 2018 жылы BRENDA биологиялық және биомедициналық зерттеулер үшін, сондай-ақ биологиялық деректерді ұзақ мерзімді сақтау үшін маңызды ELIXIR негізгі дерек ресурсына енгізілді.
Жаңартулар
BRENDA деректерінің маңызды жаңартылуы жылына екі рет жасалады. Мазмұны жаңартылумен қатар, BRENDA дерекқорына пайдаланушы интерфейсінің жақсартулары да қосылады.
Қолжетімділік
BRENDA-ны пайдалану ақысыз. BRENDA Creative Commons лицензиясының (CC BY 4.0) талаптарымен реттеледі.