Ағылшыншамен салыстырыңыз: абзацты басыңыз — түпнұсқа терезеде ашылады. Абзац астындағы EN түймесі оны мәтін ішінде көрсетеді.
Мазмұны
Кіріспе
Флуоресценттік бояулар отбасы
Family of fluorescent dyes
Alexa Fluor флуоресценттік бояулар отбасы – бұл қазір Thermo Fisher Scientific компаниясының бөлігі болып табылатын Molecular Probes компаниясы ойлап тапқан және Invitrogen тауарлық белгісімен сатылатын бояулар сериясы. Alexa Fluor бояулары көбінесе флуоресценттік микроскопияда және жасуша биологиясында жасушалар мен тіндерді белгілеу үшін қолданылады. Alexa Fluor бояуларын сигнал мен сезімталдықты арттыру үшін немесе басқа биомолекулаларға біріншілік антиденелерге немесе екіншілік антиденелерге тікелей қосуға болады. Alexa Fluor сериясының қоздыру және шығарылу спектрлері көрінетін спектрді қамтиды және инфрақызылға дейін созылады. Отбасының әрбір мүшесі олардың нанометрмен өлшенген максималды қоздыру ұзындығына сәйкес нөмірленеді.
The Alexa Fluor family of fluorescent dyes is a series of dyes invented by Molecular Probes, now a part of Thermo Fisher Scientific, and sold under the Invitrogen brand name. Alexa Fluor dyes are frequently used as cell and tissue labels in fluorescence microscopy and cell biology. Alexa Fluor dyes can be conjugated directly to primary antibodies or to secondary antibodies to amplify signal and sensitivity or other biomolecules. The excitation and emission spectra of the Alexa Fluor series cover the visible spectrum and extend into the infrared. The individual members of the family are numbered according roughly to their excitation maxima in nanometers.
Тарих
Ричард және Розария Хогландтар, Молекулалық зондтардың негізін қалаушылар, биологиялық зерттеулерде қолданылатын флуоресцентті бояуларды зерттеулерімен биология және химия салаларында кеңінен танымал. Молекулалық зондтар құрылған кезде мұндай өнімдер көбінесе коммерциялық түрде қол жетімді болмаған. Қазіргі кезде кеңінен қолданылатын көптеген флуоресцентті бояулар Молекулалық зондтардың зертханаларында ашылып, жасалған – Техас қызылы, Каскад көгі, Орегон жасылы, Марина көгі және Alexa Fluor отбасы сияқты бояулар. Олардың ең танымал өкілі – Alexa Fluor бояулар тобы, бұрынғы биологиялық флуоресцентті бояулардың қасиеттерін жақсарту және олардағы кейбір мәселелерді шешу мақсатымен әзірленген. Alexa Fluor бояуы Ричард және Розария Хогландтардың ұлы Алекс Хогландтың құрметіне аталған. 2003 жылы Молекулалық зондтар Invitrogen компаниясымен сатып алынды, ол Alexa Fluor отбасын жаңа бояулар қосып, спектрдегі жетіспейтін бөліктерді толтыру арқылы одан әрі кеңейтуге жұмыстанды. 2008 жылы Invitrogen және Alexa Fluor өнімдері Applied Biosystems компаниясымен біріккеннен кейін Life Technologies компаниясының құрамына кірді. 2014 жылы Life Technologies компаниясын Thermo Fisher Scientific сатып алды, ол Invitrogen атауын және брендін қайта жаңғыртып, Alexa Fluor өнімдерін қайтадан оның қанатына қосты.
Richard and Rosaria Haugland, the founders of Molecular Probes, are well known in biology and chemistry for their research into fluorescent dyes useful in biological research applications. At the time that Molecular Probes was founded, such products were largely unavailable commercially. A number of fluorescent dyes that are now widely used were discovered and developed in the laboratories of Molecular Probes.—dyes such as Texas Red, Cascade Blue, Oregon Green, Marina Blue, and the Alexa Fluor family. The most famous of these, the Alexa Fluor family of dyes, were designed to improve upon properties of previously developed biological fluorescent dye families, and solve some of the issues that they possessed. The Alexa Fluor dyes were named after Alex Haugland, son of Richard and Rosaria Haugland. Molecular Probes was acquired in 2003 by Invitrogen, who worked to further expand the Alexa Fluor family by the addition of new dyes to fill gaps not covered in the emission spectrum. In 2008, Invitrogen and the Alexa Fluor product line became a part of the Life Technologies, after the Invitrogen merger with Applied Biosystems. In 2014, Life Technologies was acquired by Thermo Fisher Scientific, who revitalized the Invitrogen name and brand, bringing the Alexa Fluor product line back under it.
Бояулар мен химия
Алекса Фтор бояғыштары кумарин, родамин және цианин бояғыштарының жақсы белгілі отбасыларына, сондай-ақ ксантен отбасына (оның ішінде өнеркәсіптік стандарт болып табылатын флуоресцеин) сульфондау және қосымша химиялық модификациялар арқылы химиялық жолмен синтезделген. Сульфондау Alexa Fluor бояғыштарын теріс зарядталған және осылайша бастапқы бояғыштарына қарағанда көбірек гидрофильді және ерігіш етті; қосымша модификациялар бояғыштың өнімділігін жақсартуға бағытталған. Мысалы, флуоресцеиннің сульфондалған және басқаша химиялық модификацияланған түрі болып табылатын Alexa Fluor 488, флуоресцеин изотиоцианатының тез фотоағарту және pH-қа тәуелді флуоресценттік интенсивтілік сипаттамаларымен байланысты мәселелерді шешу үшін әзірленген.
The Alexa Fluor dyes were chemically synthesized through sulfonation and additional chemical modifications made to the well known families of coumarin, rhodamine, and cyanine dyes, and to the xanthene family (of which the fluorescein, an industry standard, is a part). Sulfonation made the product Alexa Fluor dyes negatively charged and thus more hydrophilic and soluble than their parent dyes; the additional modifications were aimed to improve dye performance in other areas. For example, Alexa Fluor 488, a sulfonated and otherwise chemically modified form of fluorescein, was designed to solve the well known issues of rapid photobleaching and pH dependent fluorescent intensity characteristic of the dye fluorescein isothiocyanate. Colour†Absorb(nm) Emit(nm)Alexa Fluor 350 Blue 346 442 410 19,000 — 405 Blue 401 421 1028 35,000 — 430 Green 434 541 702 15,000 — 488 Green 495 519 643 73,000 0.92— 500 Green 502 525 700 71,000 — 514 Green 517 542 714 80,000 — 532 Yellow 532 554 721 81,000 0.61— 546 Yellow 556 573 1079 112,000 0.79— 555 Orange 555 565 ~1250 155,000 0.1— 568 Orange 578 603 792 88,000 0.69— 594 Red 590 617 820 92,000 0.66— 610 Red 612 628 1172 144,000 — 633 Far red 632 647 ~1200 159,000 — 635 Far red 633 647 140,000 — 647 Far red 650 665 1155.06 270,000 0.33— 660 Near IR 663 690 ~1100 132,000 0.37— 680 Near IR 679 702 ~1150 183,000 0.36— 700 Near IR 702 723 ~1400 205,000 0.25— 750 Near IR 749 775 ~1300 290,000 0.12— 790 Near IR 782 805 ~1750 260,000 † = approximate colour of the emission spectrumε = extinction coefficient
Түс† Абсорбция (нм) Эмиссия (нм) Alexa Fluor 350 Көк 346 442 410 19,000 — 405 Көк 401 421 1028 35,000 — 430 Жасыл 434 541 702 15,000 — 488 Жасыл 495 519 643 73,000 0.92— 500 Жасыл 502 525 700 71,000 — 514 Жасыл 517 542 714 80,000 — 532 Сары 532 554 721 81,000 0.61— 546 Сары 556 573 1079 112,000 0.79— 555 Қызғылт сары 555 565 ~1250 155,000 0.1— 568 Қызғылт сары 578 603 792 88,000 0.69— 594 Қызыл 590 617 820 92,000 0.66— 610 Қызыл 612 628 1172 144,000 — 633 Жақын қызыл 632 647 ~1200 159,000 — 635 Жақын қызыл 633 647 140,000 — 647 Жақын қызыл 650 665 1155.06 270,000 0.33— 660 Жақын ИК 663 690 ~1100 132,000 0.37— 680 Жақын ИК 679 702 ~1150 183,000 0.36— 700 Жақын ИК 702 723 ~1400 205,000 0.25— 750 Жақын ИК 749 775 ~1300 290,000 0.12— 790 Жақын ИК 782 805 ~1750 260,000 † = эмиссия спектрінің шамамен түсі ε = жойылмау коэффициенті
The Alexa Fluor dyes were chemically synthesized through sulfonation and additional chemical modifications made to the well known families of coumarin, rhodamine, and cyanine dyes, and to the xanthene family (of which the fluorescein, an industry standard, is a part). Sulfonation made the product Alexa Fluor dyes negatively charged and thus more hydrophilic and soluble than their parent dyes; the additional modifications were aimed to improve dye performance in other areas. For example, Alexa Fluor 488, a sulfonated and otherwise chemically modified form of fluorescein, was designed to solve the well known issues of rapid photobleaching and pH dependent fluorescent intensity characteristic of the dye fluorescein isothiocyanate. Colour†Absorb(nm) Emit(nm)Alexa Fluor 350 Blue 346 442 410 19,000 — 405 Blue 401 421 1028 35,000 — 430 Green 434 541 702 15,000 — 488 Green 495 519 643 73,000 0.92— 500 Green 502 525 700 71,000 — 514 Green 517 542 714 80,000 — 532 Yellow 532 554 721 81,000 0.61— 546 Yellow 556 573 1079 112,000 0.79— 555 Orange 555 565 ~1250 155,000 0.1— 568 Orange 578 603 792 88,000 0.69— 594 Red 590 617 820 92,000 0.66— 610 Red 612 628 1172 144,000 — 633 Far red 632 647 ~1200 159,000 — 635 Far red 633 647 140,000 — 647 Far red 650 665 1155.06 270,000 0.33— 660 Near IR 663 690 ~1100 132,000 0.37— 680 Near IR 679 702 ~1150 183,000 0.36— 700 Near IR 702 723 ~1400 205,000 0.25— 750 Near IR 749 775 ~1300 290,000 0.12— 790 Near IR 782 805 ~1750 260,000 † = approximate colour of the emission spectrumε = extinction coefficient
Басқа бояулармен салыстыру
Alexa Fluor сериясындағы бояулар бастапқы бояуларға (флюоресцеин, родамин сияқты) қарағанда pH сезімталдығы төмен және фототұрақтылығы жоғары. Олар осы бояулардың синтезі негізінде алынған. Бұл бояулар желісінің әрбір мүшесінің жойылу коэффициенттері белгілі (кестеге қараңыз), бірақ кванттық шығымдылығы мен өмір сүру мерзімі белгісіз. Жарықтығын салыстыру да көбінесе жақсы нәтиже береді. Басқа коммерциялық өнімдер Alexa Fluor бояулар желісінің жекелеген мүшелеріне балама ұсынады. Басқа бояулармен салыстырулар қолданылған жағдайлар мен әдістерге байланысты тұрақсыз және одан да "наздық" болуы мүмкін. Мұндай салыстырулар қолданылатын жағдайлар мен техникаға, сондай-ақ бояудың қажетті көрсеткіштеріне (сигнал, фон, тұрақтылық) қарай қарастырылуы керек.
The Alexa Fluor series dyes are less pH sensitive and more photostable than the original dyes (fluorescein, rhodamine, etc.) from which they were synthesized. While extinction coefficients of each member of this line of dyes are known (see table), quantum yields and life times are not. Brightness comparisons are also generally favorable. Other commercial product lines provide alternatives to individual members of the line of Alexa Fluor Dyes. Comparisons with other dyes are less consistent, and also even more "delicate", depending on the conditions and techniques used. Such comparisons should be considered, depending on the conditions and techniques used, and the dye performance (signal, background, stability) needed.