Y-хромосомасының STR маркерлері және генеалогиялық зерттеулер
List of Y-STR markers
Y-Хромосома ДНК сынағы: ДYS454, ДYS464 сияқты Y STR маркерлер криминалистикада & генеалогияда қолданылады. PowerPlex Y, Yfiler жиынтықтары туралы ақпарат.
Ағылшыншамен салыстырыңыз: абзацты басыңыз — түпнұсқа терезеде ашылады. Абзац астындағы EN түймесі оны мәтін ішінде көрсетеді.
Мазмұны
Кіріспе
Жоқ, төмендегі тізімдегі Y STR маркерлері сот-медициналық және генеалогиялық ДНК тестілеуде жиі қолданылады. DYS454 ең аз түрленетін, ал көп көшірмелі DYS464 – Y STR маркерлерінің ең түрленетіні болып табылады. Нөмірленген Y STR маркерлерінің Y хромосомасындағы орналасқан жері цитогенетикалық локализация арқылы шамамен анықталуы мүмкін. Мысалы, DYS449 Yp11.2 орнында орналасқан, яғни Y хромосомасының кішкентай қол сегментінің 1-тобының, 1-қосалқы тобының және 2-қосалқы қосалқы тобында DYS449 орналасқан. Сот-медициналық зертханалар көбінесе PowerPlex Y (Promega Corporation) және Yfiler (Applied Biosystems) жиынтықтарын пайдаланады, олар тиісінше 12 немесе 17 Y STR-ді зерттейді. Генеалогиялық ДНК-тестілеу зертханалары 700-ге дейін Y STR-ді зерттей алады.
None
The Y STR markers in the following list are commonly used in forensic and genealogical DNA testing. DYS454 is the least diverse, and multi copy marker DYS464 is the most diverse Y STR marker. The location on the Y chromosome of numbered Y STR markers can be roughly given with cytogenetic localization. For example, DYS449 is located at Yp11.2 meaning the Y chromosome, petit arm, band 1, sub band 1, sub sub band 2 DYS449. Forensic labs usually use PowerPlex Y (Promega Corporation) and Yfiler (Applied Biosystems) kits that examine 12 or 17 Y STRs, respectively. Genealogical DNA test labs examine up to 700 Y STRs.
Мутация деңгейі
Мутация деңгейі Chandler (2006) еңбегінде бағаланғандай, бір ұрпаққа шаққандағы көрсеткіштер. Мәлімделген қателіктер әдетте +/ 15-20% құрайды. Байқалған шежірелерден алынған баламалы бағалаулар (сондықтан сот-медициналық қолдану үшін барлық маркерлер қамтылмаған) Y хромосома гаплотипі анықтамалық деректер базасында да қолжетімді. Кейбір тринуклеотидтік маркерлердің мутация жылдамдығы кейбір қайталану ұзындықтарында басқаларына қарағанда әлдеқайда жоғары болуы мүмкін. Мысалы, DYS388 тринуклеотидінің өзгеруі көптеген гаплогруппаларда 11–13 мәндерін қабылдағанда, әдетте өте баяу болады. Бірақ J гаплогруппасында өзгерудің қарқыны мен жиілігі айтарлықтай жоғары, онда ол әдетте 14–18 мәндерін алады. Сол сияқты, DYS392 тринуклеотиді N және Q гаплогруппаларында "жедел" деп хабарланады, онда ол басқа топтарда сирек кездесетін 14–16 мәндерін қабылдайды.
Mutation rates are those per generation, as estimated in Chandler (2006). The quoted estimated errors are typically +/ 15 20%. Alternative estimates (for forensic use therefore not all markers are covered) from observed pedigrees are also available at the Y Chromosome Haplotype Reference Database. It appears that some trinucleotide markers may have much higher mutation rates at some repeat lengths than at others. For example, variation of the trinucleotide DYS388 is generally very slow in most haplogroups, when it takes the values 11–13. But there appears to be much greater variation and more rapid mutation in Haplogroup J, where it typically has values 14–18. Similarly the trinucleotide DYS392 is reported to be "fast" in haplogroups N and Q, where it takes values 14 16 which are rare in other groups.
Ескертпелер мен сілтемелер
Кейсер және тағы басқалар. (2004), Адамның Y хромосомалық микросателлиттерінің толық шолуы Am. J. Hum. Genet., 74 1183–1197. Ескерту: деректер тек онлайн қолжетімді.
Kayser et al. (2004), A Comprehensive Survey of Human Y Chromosomal Microsatellites Am. J. Hum. Genet., 74 1183–1197. NB online only data file