Введение
Маркеры Y-STR из следующего списка обычно используются в судебно-медицинской и генеалогической ДНК-диагностике. DYS454 является наименее вариабельным, а многокопийный маркер DYS464 – наиболее вариабельным маркером Y-STR. Расположение пронумерованных Y-STR-маркеров на Y-хромосоме может быть приблизительно определено с помощью цитогенетической локализации. Например, DYS449 расположен в Yp11.2, что означает Y-хромосома, малая рука, полоса 1, подполоса 1, подподполоса 2 – DYS449. Судебно-медицинские лаборатории обычно используют наборы PowerPlex Y (Promega Corporation) и Yfiler (Applied Biosystems), которые анализируют соответственно 12 или 17 Y-STR. Лаборатории генеалогического ДНК-тестирования исследуют до 700 Y-STR.
The Y STR markers in the following list are commonly used in forensic and genealogical DNA testing. DYS454 is the least diverse, and multi copy marker DYS464 is the most diverse Y STR marker. The location on the Y chromosome of numbered Y STR markers can be roughly given with cytogenetic localization. For example, DYS449 is located at Yp11.2 meaning the Y chromosome, petit arm, band 1, sub band 1, sub sub band 2 DYS449. Forensic labs usually use PowerPlex Y (Promega Corporation) and Yfiler (Applied Biosystems) kits that examine 12 or 17 Y STRs, respectively. Genealogical DNA test labs examine up to 700 Y STRs.
Уровень мутаций
Частота мутаций указана за поколение, согласно оценкам, представленным в Chandler (2006). Приведенные оценки погрешностей обычно составляют +/- 15-20%. Альтернативные оценки (предназначенные для использования в судебной экспертизе, поэтому не охватывают все маркеры), основанные на наблюдаемых родословных, также доступны в базе данных Y-хромосомных гаплотипов. Кажется, что для некоторых тринуклеотидных маркеров частота мутаций может значительно различаться в зависимости от длины повтора. Например, вариация тринуклеотида DYS388 обычно протекает очень медленно в большинстве гаплогрупп при значениях 11–13. Однако в гаплогруппе J наблюдается гораздо большая вариабельность и более высокая скорость мутаций, где значения обычно находятся в диапазоне 14–18. Аналогично, сообщается, что тринуклеотид DYS392 является "быстрым" в гаплогруппах N и Q, где он принимает значения 14–16, которые редки в других группах.
Примечания и ссылки
Кайзер и др. (2004), Всесторонний обзор микросателлитов Y-хромосомы человека. Am. J. Hum. Genet., 74, 1183–1197. NB – данные доступны только в онлайн-файле.