Ағылшыншамен салыстырыңыз: абзацты басыңыз — түпнұсқа терезеде ашылады. Абзац астындағы EN түймесі оны мәтін ішінде көрсетеді.
Мазмұны
Кіріспе
Скатчард теңдеуі – молекулалық биологияда лигандқа қатысты рецептордың байланысу қабілеті мен байланысу орындарының санын есептеуге қолданылатын теңдеу. Ол американдық химик Джордж Скатчардтың құрметіне аталған.
The Scatchard equation is an equation used in molecular biology to calculate the affinity and number of binding sites of a receptor for a ligand. It is named after the American chemist George Scatchard.
Теңдеу
Осы мақалада [RL] рецептор-лиганд кешенінің концентрациясын, [R] бос рецептордың концентрациясын және [L] бос лигандтың концентрациясын көрсетеді (сол сияқты рецептор мен лигандтың жалпы концентрациясы тиісінше [R]+[RL] және [L]+[RL] болады). n әрбір рецептор молекуласындағы лигандқа арналған байланыс орындарының саны болсын, ал рецепторға байланысқан лигандтардың орташа саны болсын. Kd лиганд пен рецептор арасындағы диссоциация тұрақтысын білдірсін. Скатчард теңдеуі былай беріледі:
Throughout this article, [RL] denotes the concentration of a receptor ligand complex, [R] the concentration of free receptor, and [L] the concentration of free ligand (so that the total concentration of the receptor and ligand are [R]+[RL] and [L]+[RL], respectively). Let n be the number of binding sites for ligand on each receptor molecule, and let represent the average number of ligands bound to a receptor. Let Kd denote the dissociation constant between the ligand and receptor. The Scatchard equation is given by
/[L] және мәндерін графикке түсіргенде, Скатчард графигіндегі түзудің еңісі 1/Kd-ға тең, ал x осіндегі қиылысу нүктесі лиганд байланыс орындарының саны n-ге тең болады.
By plotting /[L] versus , the Scatchard plot shows that the slope equals to 1/Kd while the x intercept equals the number of ligand binding sites n.
n лигандтардың жалпы жағдайы
Лигандқа тәуелсіз байланатын n байлау орны бар рецептор үшін, әрбір байлау орнының орташа толуы [L]/(Kd + [L]) құрайды. Осылайша, барлық n байлау орнын ескерсек, әрбір рецепторға орташа есеппен ligands саны байланады, және осыдан Скатчард теңдеуі туындайды.
For a receptor with n binding sites that independently bind to the ligand, each binding site will have an average occupancy of [L]/(Kd + [L]). Hence, by considering all n binding sites, there will
ligands bound to each receptor on average, from which the Scatchard equation follows.
Әдістеменің қиындықтары
Скатчард әдісі қазіргі кезде байланыс деректеріне параметрлерді тікелей бейімдейтін компьютерлік бағдарламалардың қолжетімділігіне байланысты аз қолданылады. Математикалық тұрғыдан алғанда, Скатчард теңдеуі ферменттік реакция деректерінен кинетикалық қасиеттерді шығару үшін қолданылатын Эди-Хофсти әдісімен байланысты. Беттік плазмондық резонанс және изотермиялық титрациялық калориметрия сияқты байланысты өлшеудің көптеген қазіргі заманғы әдістері компьютерлік итерациялық әдістермен жаһандық түрде бейімделетін қосымша байланыс параметрлерін ұсынады.
The Scatchard method is less used nowadays because of the availability of computer programs that directly fit parameters to binding data. Mathematically, the Scatchard equation is related to Eadie Hofstee method, which is used to infer kinetic properties from enzyme reaction data. Many modern methods for measuring binding such as surface plasmon resonance and isothermal titration calorimetry provide additional binding parameters that are globally fit by computer based iterative methods.