Ағылшыншамен салыстырыңыз: абзацты басыңыз — түпнұсқа терезеде ашылады. Абзац астындағы EN түймесі оны мәтін ішінде көрсетеді.
Мазмұны
Кіріспе
Кинурениназа немесе L-кинуренин гидролазы (KYNU) – кинурениннің (Kyn) антранил қышқылына (Ant) ыдырауын катализдейтін PLP-ге тәуелді фермент. Ол сондай-ақ 3-гидроксикинуренинге (3-гидроксиантранилатты түзу үшін) және кейбір басқа (3-арилкарбонил) аланиндерге де әсер ете алады. Адамдарда 2-ші хромосомада орналасқан KYNU генімен кодталған бір кинурениназа ферменті өндіріледі. KYNU – Trp катаболизмі және триптофаннан (Trp) NAD кофакторларының биосинтезі жолының бір бөлігі. Кинурениназа келесі реакцияны катализдейді: L-кинуренин + H2O ↔ антранилат + L-аланин.
Kynureninase or L Kynurenine hydrolase (KYNU) is a PLP dependent enzyme that catalyses the cleavage of kynurenine (Kyn) into anthranilic acid (Ant). It can also act on 3 hydroxykynurenine (to produce 3 hydroxyanthranilate) and some other (3 arylcarbonyl) alanines. Humans express one kynureninase enzyme that is encoded by the KYNU gene located on chromosome 2. KYNU is part of the pathway for the catabolism of Trp and the biosynthesis of NAD cofactors from tryptophan (Trp). Kynureninase catalyzes the following reaction:
L kynurenine + H2O ↔ anthranilate + L alanine
Құрылымы
Кинурениназа аспартат аминтрансферазалар суперотбасының V кластық, құрылымдық жағынан гомологты пиридоксал 5'-фосфатқа (PLP) тәуелді ферменттері тобына жатады. Бүгінгі күнге дейін адам кінурениназасының екі құрылымы рентген сәулелерінің дифракциясы арқылы 2,0 және 1,7 Å ажыратымдылықпен анықталды. Аминоқышқылдардың қырық пайызы альфа-спиральдарда, ал он екі пайызы бета-парақтарда орналасқан. Кинуренин субстратын белсенді орынға орналастыру (докинг) Asn 333 және His 102 қалдықтарының субстратты байланыстыруға қатысатынын көрсетеді.
Kynureninase belongs to the class V group of aspartate aminotransferase superfamily of structurally homologous pyridoxal 5' phosphate (PLP) dependent enzymes. To date, two structures of human kynureninase have determined by X ray diffraction with resolutions of 2.0 and 1.7 Å. Forty percent of the amino acids are arranged in an alpha helical and twelve percent are arranged in beta sheets. Docking of the kynurenine substrate into the active site suggests that Asn 333 and His 102 are involved in substrate binding.
Функция
KYNU реакциясында PLP Cβ-Cγ байланысын үзуге көмектеседі. Реакция трансаминация реакциясымен бірдей қадамдардан өтеді, бірақ таутомерленген Шифф негізін гидролиздейтін болмайды. Ұсынылған реакция механизмі таутомерленген 3hKyn PLP Шифф базасының карбонил көміртегіне (Cγ) ферменттік нуклеофилдің шабуылын қамтиды. Бұдан кейін Cβ-Cγ байланысы үзіліп, ацилденген фермент аралық қосылысы және таутомерленген Ala PLP аддукты түзіледі. Ацилденген ферменттің гидролизі 3hAnt-тің пайда болуына әкеледі.
In KYNU reaction, PLP facilitates Cβ Cγ bond cleavage. The reaction follows the same steps as the transamination reaction but does not hydrolyze the tautomerized Schiff base. The proposed reaction mechanism involves an attack of an enzyme nucleophile on the carbonyl carbon (Cγ) of the tautomerized 3hKyn PLP Schiff base. This is followed by Cβ Cγ bond cleavage to generate an acyl enzyme intermediate together with a tautomerized Ala PLP adduct. Hydrolysis of the acyl enzyme then yields 3hAnt.