Ағылшыншамен салыстырыңыз: абзацты басыңыз — түпнұсқа терезеде ашылады. Абзац астындағы EN түймесі оны мәтін ішінде көрсетеді.
Кіріспе
Streptomycetaceae бактериялар тұқымдасы – Actinomycetota класының және Streptomycetales монотиптік қатарының құрамына кіреді. Оған маңызды Streptomyces туысы жатады. Бұл көптеген антибиотиктердің, атап айтқанда стрептомициннің – туберкулезге қарсы қолданылған алғашқы антибиотиктердің бастапқы көзі болды.
Family of bacteria
Streptomycetaceae is a family of the class Actinomycetota, making up the monotypic order Streptomycetales. It includes the important genus Streptomyces. This was the original source of many antibiotics, namely streptomycin, the first antibiotic against tuberculosis.
Геномдық
Актиномицетоталь геномдарының тізбектелуі Стрептомицетальдар отряғына тән үш сақталған ерекше индельдерді (қосқандағы немесе жойылғандағы тізбек бөліктері) анықтауға әкелді. PBGD ферментінің құрамында барлық Streptomyces және Kitasatospora setae түрлерінде кездесетін, бірақ басқа Actinomycetota түрлерінде жоқ төрт аминқышқылынан тұратын қосымша бар. Сол сияқты, аденилат киназаның сақталған аймағында бір аминқышқылынан тұратын қосымша табылды, ол барлық Streptomyces түрлерінде және K. setae-да кездеседі, бірақ басқа Actinomycetota түрлерінде жоқ. Сонымен қатар, әртүрлі тізбектелген Streptomyces түрлерінде, бірақ K. setae-да кездеспейтін бес сақталған белок белгісі анықталды; алайда, K. setae-ның толық геномы әлі тізбектелмегендіктен, бұл белоктар K. setae-да болуы мүмкін. Бұдан өзге, барлық тізбектелген Streptomyces түрлерінде және K. setae-да кездесетін 11 сақталған белок анықталды. Бұл белоктар тек Streptomycetales отряғына тән деп есептеледі, сондықтан бұл топты Actinomycetota-ның қалған бөлігінен ажыратуға қолданылатын молекулалық маркерлерді ұсынады. Филогенетикалық ағаштар Catenulisporales отряғының Streptomycetales отряғымен тығыз байланысты екенін көрсетеді. Бұл тұжырымдаманы бір аминқышқылынан тұратын сақталған ерекше индель қолдайды, ол барлық Streptomycetales түрлерінде және Catenulisporales acidiphilia-да табылады, ал Catenulisporales acidiphilia – геномы толық тізбектелген жалғыз Catenulisporales түрі. Сонымен қатар, барлық Streptomycetales түрлерінде және C. acidiphilia-да кездесетін үш сақталған белок анықталды. Сақталған ерекше индель де, сақталған белоктар да Streptomycetales және Catenulisporales отряқтарының тығыз байланысты екенін көрсетеді.
Sequence alignments of actinomycetotal genomes have led to the identification of three conserved signature indels which are unique to the order Streptomycetales. The enzyme PBGD contains a four amino acid insertion which is present in all Streptomyces species and Kitasatospora setae, but not any other Actinomycetota. Similarly, a one amino acid insertion is present in a conserved region of adenylate kinase and is found in all Streptomyces species and K. setae, but is not found in any other Actinomycetota. Five conserved signature proteins have also been identified which are present in various sequenced Streptomyces species, but not in K. setae; however, as the complete genome of K. setae has not yet been sequenced, these proteins may be present in K. setae. Additionally, 11 conserved signature proteins have been identified which are found in all sequenced Streptomyces species and K. setae. These proteins are believed to be unique to the Streptomycetales order, thus provide molecular markers which can be used to distinguish this group from the rest of the Actinomycetota. Phylogenetic trees indicate that the order Catenulisporales is closely related to the order Streptomycetales. This inference is supported by a one amino acid conserved signature indel which is uniquely found in all Streptomycetales species and Catenulisporales acidiphilia, the only Catenulisporales species whose complete genome has been sequenced. Additionally, three conserved signature proteins have been identified which are found in all Streptomycetales species and C. acidiphilia. Both the conserved signature indel and the conserved signature proteins provide evidence that the orders Streptomycetales and Catenulisporales are closely related.