Кіріспе

Тіршіліктің жіктелу гипотезасы [[Файл:Тұрмыстың филогенетикалық ағашы 1990 LUCA. svg|thumb|upright=1.75|Карл Воуз және әріптестері 1990 жылы ұсынған, рРНК деректеріне негізделген филогенетикалық ағаш, бактерия, архея және эукариоталардың бөлінуін көрсетеді. Бұл жіктелімнің екі империя жүйесі және бес патшалық жіктелуі сияқты бұрынғы жіктелімдерден басты айырмашылығы – Археяның (бұрын "архебактерия" деп аталатын) бактериялардан толыққанды бөлек организмдер ретінде қарастырылуы. Эукариоталар археялардың кладасы ретінде қарастырылатындықтан, бұл жіктелім екі домендік жүйемен қайшылыққа түседі, ол организмдерді тек бактериялар мен археяларға бөледі.

Өмірбаян

Вуз 16S рРНК гендерінің айырмашылықтарына сүйене отырып, бактериялар, археялар және эукариоттардың әрқайсысы нашар дамыған генетикалық механизмі бар ата-тектен жеке пайда болды деп сараптады, оларға көбінесе прогенот деп аталады. Осы бастапқы туындау желілерін көрсету үшін ол әрқайсысын бірнеше түрлі патшалықтарға бөлінген домен ретінде қарастырды. Алғашқыда ол прокариоттарды Эубактерияларға (қазір Бактериялар) және Архебактерияларға (қазір Археялар) бөлді. Вуз бастапқыда "патшалық" терминін үш негізгі филогенетикалық топтаманы атау үшін қолданды, және бұл номенклатура 1990 жылы "домен" термині қабылданғанға дейін кеңінен қолданылды. Оған жасалған барлық сын-есім ғылыми деңгеймен ғана шектелмеді. Он жылдық еңбектің нәтижесінде олигонуклеотидтерді каталогқа енгізу оған "асау" деген бедел берді, ал 1997 жылы Science журналында жарияланған мақалада Вуз "Микробиологияның жаралы революционері" деп аталды. Қолдау деректерінің артуы ғылыми қауымдастықты 1980 жылдардың ортасына қарай Археяны қабылдауға итермеледі. Бүгінде өте аз ғалымдар біртұтас Прокаря тұжырымын қабылдайды.

Нишалар

Үш клетка түрінің әрқайсысы қайталама ерекшеліктерге немесе рөлдерге бейімделеді. Бактериялар, кем дегенде, қолайлы жағдайда ең қарқынды көбейеді. Археялар жоғары температура, қышқылдық, күкірт және т.б. сияқты экстремалды ортаға жылдам бейімделеді. Бұл әртүрлі тағамдық көздерді пайдалануға да қатысты. Эукариоттар адамдар сияқты көпжасушалы организмдердегідей, ынтымақтастық колонияларды құруға ең икемді. Шындығында, эукариоттың құрылымы әртүрлі клеткалардың қосылуынан пайда болған болуы мүмкін, нәтижесінде органеллалар қалыптасқан. Паракарион миожиненсис (incertae sedis) – бірегей мысал ретінде белгілі бір жасушалы организм. "Бұл организм прокариоттар мен эукариоттардан өзгеше тіршілік нысаны болып көрінеді", олардың екеуінің де белгілері бар.