Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Введение
Семейство бактерий Streptomycetaceae – это семейство класса Actinomycetota, образующее монотипический порядок Streptomycetales. Оно включает важный род Streptomyces. Именно из этого семейства впервые были получены многие антибиотики, в частности стрептомицин – первый антибиотик против туберкулеза.
Family of bacteria
Streptomycetaceae is a family of the class Actinomycetota, making up the monotypic order Streptomycetales. It includes the important genus Streptomyces. This was the original source of many antibiotics, namely streptomycin, the first antibiotic against tuberculosis.
Генемика
Выравнивание геномов актиномицетов привело к выявлению трех консервативных сигнатурных инделей, уникальных для порядка Streptomycetales. Фермент PBGD содержит вставку из четырех аминокислот, присутствующую во всех видах *Streptomyces* и *Kitasatospora setae*, но отсутствующую у других представителей Actinomycetota. Аналогично, в консервативной области аденилаткиназы обнаружена вставка из одной аминокислоты, которая встречается во всех видах *Streptomyces* и *K. setae*, но не встречается ни у одного другого представителя Actinomycetota. Также было идентифицировано пять консервативных сигнатурных белков, присутствующих в различных секвенированных видах *Streptomyces*, но отсутствующих у *K. setae*; однако, поскольку полный геном *K. setae* еще не секвенирован, эти белки могут присутствовать и у *K. setae*. Кроме того, выявлено 11 консервативных сигнатурных белков, встречающихся во всех секвенированных видах *Streptomyces* и *K. setae*. Считается, что эти белки уникальны для порядка Streptomycetales и могут служить молекулярными маркерами для отличия этой группы от остальных представителей Actinomycetota. Филогенетические деревья указывают на тесную связь между порядками Catenulisporales и Streptomycetales. Это подтверждается консервативной сигнатурной инделью из одной аминокислоты, которая уникально обнаружена во всех видах Streptomycetales и *Catenulisporales acidiphilia* – единственном виде Catenulisporales, полный геном которого был секвенирован. Кроме того, идентифицировано три консервативных сигнатурных белка, встречающихся во всех видах Streptomycetales и *C. acidiphilia*. И консервативная сигнатурная индель, и консервативные сигнатурные белки свидетельствуют о тесном родстве порядков Streptomycetales и Catenulisporales.
Sequence alignments of actinomycetotal genomes have led to the identification of three conserved signature indels which are unique to the order Streptomycetales. The enzyme PBGD contains a four amino acid insertion which is present in all Streptomyces species and Kitasatospora setae, but not any other Actinomycetota. Similarly, a one amino acid insertion is present in a conserved region of adenylate kinase and is found in all Streptomyces species and K. setae, but is not found in any other Actinomycetota. Five conserved signature proteins have also been identified which are present in various sequenced Streptomyces species, but not in K. setae; however, as the complete genome of K. setae has not yet been sequenced, these proteins may be present in K. setae. Additionally, 11 conserved signature proteins have been identified which are found in all sequenced Streptomyces species and K. setae. These proteins are believed to be unique to the Streptomycetales order, thus provide molecular markers which can be used to distinguish this group from the rest of the Actinomycetota. Phylogenetic trees indicate that the order Catenulisporales is closely related to the order Streptomycetales. This inference is supported by a one amino acid conserved signature indel which is uniquely found in all Streptomycetales species and Catenulisporales acidiphilia, the only Catenulisporales species whose complete genome has been sequenced. Additionally, three conserved signature proteins have been identified which are found in all Streptomycetales species and C. acidiphilia. Both the conserved signature indel and the conserved signature proteins provide evidence that the orders Streptomycetales and Catenulisporales are closely related.