Кіріспе
PSORT - бұл жасушалардағы белоктардың орналасу орындарын болжау үшін қолданылатын биоинформатика құралы. Ол амин қышқылының реттілігі мен оның шығу тегі таксонының (мысалы, грам-негативті бактериялар) ақпаратын кіріс ретінде алады. Содан кейін ол белгілі ақуыздарды сұрыптау сигналдарының әртүрлі реттілік ерекшеліктері үшін сақталған ережелерді қолдану арқылы кіріс реттілігін талдайды. Сонымен қатар, әрбір үміткерлік жерде кіріс ақуыздың орналасу мүмкіндігін қосымша ақпаратпен бірге көрсетеді. Бұл құралды қолданатын зерттеушілер белгілі бір дәрежеде ақылға қонымды түрде белоктың жасушаның қай жеріне орналасуы мүмкін екенін болжауға болады. Бұл протеиндерді жасуша машинасы белгілеп, сигналдық пептидті тізбекті (пошталық мекен-жайға ұқсас) таниды және протеинді тиісті орынға жылжытады. Сигналдық пептид көбінесе мақсатқа жеткеннен кейін бөлінеді. PSORT белгілі сигналдық пептидтік тізбектерді пайдаланады, олар қандай кіріс тізбекінің локализацияны тудыратындығын талдау және болжау үшін қолданылады. Белоктың орналасуы маңызды, өйткені ол белоктың атқаратын рөлін қолдайды. Мысалы, каталаз ферменттері (пероксидті су мен оттегіні айналдыратын ақуыздар) пероксисомаға орналасады деп күтуге болады, өйткені бұл пероксид белсенділігі жоғары аймақ. Сигналдық пептидті тізбекті және GFP экспрессиясы арқылы визуалды локализацияны талдау арқылы бұл рөлді растайтын берік дәлелдер алынды. Бағдарламаны Жапонияның Токио университетінің Медициналық ғылымдар институтының Адам геномы орталығының докторы Кента Накай жазды және оны барлық пайдаланушылар тегін пайдалана алады.