Тақырыптар

Протеиндік құрылым

Protein Structure · 63 мақала

  1. Протеин құрылымы: Альфа спираль

    Протеин құрылымы: α-спираль – ақуыздағы кең таралған, тұрақты бұралу. Аминқышқылдар тізбегінен оң жақ бұрылыспен құралады, 3.6 қалдықтан бір айналым.

    #657 · 10 мин оқу

  2. Белок құрылымдық мотиві: β-жапырақшасы

    Бұл мақалада бета-парақтар – ақуыз құрылымының маңызды элементі, олардың қалыптасуы, қасиеттері және Альцгеймер сияқты аурулардағы рөлі жайлы ақпарат бар.

    #1067 · 9 мин оқу

  3. Талшықты коллагеннің негізгі құрылымдық ерекшеліктері

    Коллагеннің үш спиральды құрылымы – негізгі екіншілік құрылым. Глицин, пролин, гидроксипролин аминқышқылдарынан тұрады. Тоқ тіні мен сіңірлерде кездеседі.

    #1715 · 2 мин оқу

  4. Ақуыздың біріншілік құрылымы: аминқышқылдарының тізбегі

    Протеиннің біріншілік құрылымы: аминқышқылдарының тізбегі, синтезі, ДНК-дан анықтау. Рибосомалар мен зертханада жасалуы туралы ақпарат.

    #5899 · 3 мин оқу

  5. Протеин құрылымының жергілікті екінші деңгейі

    Протеин құрылымы: α-спиральдар, β-парақтар, β-бұрылыстар. Полипептид тізбегінің кеңістіктік конформациясы, белок бүктелуінің аралық кезеңі.

    #6940 · 5 мин оқу

  6. Протеиннің үшіншілік құрылысы

    Протеиннің үшіншілік құрылымы – бұл оның үш өлшемді пішіні. Аминқышқыл тізбегінің өзара әрекеттесуі белоктың қасиеттерін анықтайды. Биология, химия.

    #7484 · 4 мин оқу

  7. Үлкен биомолекулалардың құрылымдық мәліметтерінің халықаралық базасы

    Протеиннің мәліметтер банкі (PDB) – әлемдік ашық қолжетімді, үлкен биологиялық молекулалардың 3D құрылымдық деректерінің базасы. Зерттеулерге көмектеседі!

    #23720 · 3 мин оқу

  8. Глобулярлы ақуыздар: құрылымы, қасиеттері және қызметі

    Глобулярлы ақуыздар: биохимиядағы дөңгелек пішінді, суда ерігіш протеиндер. Құрылымы, қасиеттері, және сфера протеиндер туралы толық ақпарат.

    #24858 · 3 мин оқу

  9. Трансмембрандық ақуыздардың топологиясын болжау әдістері

    Трансмембранды протеин топологиясы: құрылымы, N және C терминиалдары, базалар (Uniprot, TOPDB) және болжау әдістері. Биологиялық мембраналар зерттеуі.

    #51784 · 2 мин оқу

  10. Геномдық құрылымтану: протеин құрылымдарын зерттеудің жаңа тәсілдері

    Геномдық құрылымтану – геномдағы әрбір белоктың 3D құрылымын анықтау. Жоғары өнімділік, модельдеу және функцияны болжауға көмектеседі.

    #75218 · 6 мин оқу

  11. Ақуыз құрылымын болжау: Аминоқышқыл тізбегінен үш өлшемді құрылымды анықтау

    Прогнозирование структуры белка: предсказание 3D-структуры из аминокислотной последовательности. Важно для медицины, биотехнологий и CASP/CAMEO3D.

    #75830 · 17 мин оқу

  12. Протеин мен нуклеин қышқылының табиғи күйі

    Протеин мен нуклеин қышқылының дұрыс пішіні – биомолекуланың функционалдық, табиғи күйі. Құрылым деңгейлері, энергия азайту, денатурация туралы біліңіз.

    #78818 · 2 мин оқу

  13. Нүклеотидтік немесе аминқышқылдық тізбек мотивтері

    Биологияда нуклеотид немесе аминқышқылдарының тізбек мотивтері – макромолекуланың қызметімен байланысты жиі кездесетін үлгілер. Гендердегі құрылымдық мотивтер.

    #99430 · 2 мин оқу

  14. Протеин құрылымын болжау бойынша халықаралық сынақ

    CASP: әсерлі ақуыз құрылымдарын болжау сынағы. Дүниежүзілік зерттеулер, нәтижелерді бағалау, әдістерді жетілдіру, ақуыз моделі.

    #102447 · 2 мин оқу

  15. Құрылымдық қатарластыру: Когнитивтік ғылым және молекулалық тізбектерді салыстыру

    Құрылымдық теңестіру: ақуыз құрылымдарын салыстыру, эволюциялық байланыстарды анықтау. Тізбектердегі ұқсастық аз болғанда тиімді әдіс.

    #104577 · 6 мин оқу

  16. Биомакромолекулалар құрылымын зерттеу саласы

    Структуралық биоинформатика: ақуыз, ДНК, РНК құрылымын зерттеу, болжау. Биологиялық макромолекулалардың 3D құрылымын талдау, функциясын анықтау.

    #104631 · 10 мин оқу

  17. Протеин қалыптасуының Левинталь парадоксы

    Лevinthal парадоксы: протеин қалай жылдам бүктеледі? Бұл ой-эксперимент протеин құрылымын есептеудегі қиындықтарды көрсетеді, энергия ландшафтының ролін ашады.

    #119269 · 2 мин оқу

  18. Ақуыз домендерінің құрылымдық жіктелу базасы

    SCOPe: Әсерлі ақуыз құрылымдарының дерекқоры. 87,224 құрылым, 4,919 отбасы. UC Berkeley толықтырып, жаңартып келеді. Биологиялық зерттеулерге көмектеседі.

    #140792 · 5 мин оқу

  19. Ақуыздағы спиральді құрылымдар

    Ақуыздағы спиральді құрылымдар: 2-7 альфа спиральдардан тұратын, ақуыз-ақуыз өзара әрекеттесуде маңызды. Құрылымды зерттеуге арналған құралдар бар.

    #159551 · 7 мин оқу

  20. Жаңадан жасалған Top7 протеінінің құрылымы мен қасиеттері

    Жаңа Top7 жасанды ақуызы: құрылымы мен қасиеттері есептеу арқылы жасалған. Дэвид Бейкер зертханасындағы ғылымтанушылардың жаңа табысы.

    #163788 · 1 мин оқу

  21. Аминқышқыш тізбегінің үш өлшемді құрылымы

    Протеин құрылымы: аминқышқылдар тізбегінің үш өлшемді құрылысы, полипептидтер, пептид байланысы, конденсатталу реакциясы. Биология, химия.

    #165666 · 9 мин оқу

  22. Биоақпараттағы тізбек логосы және консенсус логосы туралы

    Биоинформатикадағы тізбек логотипі – ДНК/РНК немесе белок тізбектеріндегі нуклеотидтердің сақталуын көрсететін графикалық бейне. Тізбектерді талдауға көмектеседі.

    #175131 · 1 мин оқу

  23. Ақуыз тізбегін анықтау әдістері

    Протеин тізбегін анықтау: аминқышқылдар реттілігін, масса-спектрометрия және Эдман деградациясы арқылы зерттеу. Әрі қарай оқу!

    #178145 · 11 мин оқу

  24. β-аминқышқылынан туындаған пептидтер классы

    Бета пептидтері – бұл дәстүрлі емес пептидтер, антибиотиктерге төзімділікпен күресу үшін зерттеледі. 1996 ж. Дитер Зеебах тобының жұмысы.

    #184765 · 2 мин оқу

  25. Прогнозирование структуры белка с помощью добровольных вычислений Predictor@home

    Predictor@home: BOINC жобасы ақуыз құрылымын болжауға көмектеседі. CASP сынағы, алгоритмдерді бағалау, Folding@home-мен үйлесімділік. Ақуызды зерттеу.

    #186453 · 1 мин оқу

  26. Жаңа ақуыз молекулаларын рационалды жобалау

    Жаңа протеин молекулаларын рационалды жобалау: құрылым, тізбектерді есептеу, де ново жобалау, протеиннің қайта жобалау әдістері. Протеин функциясын зерттеу.

    #231058 · 12 мин оқу

  27. Торлық ақуыздардың бүктелуі: Моделдеу және зерттеулер

    Латтице ақуыздары – ақуыз бүктелуін зерттеу үшін қолданылатын қарапайым модель. Есептеу күшін үнемдейді, бірақ проблема NP-толық болып қалады.

    #231529 · 2 мин оқу

  28. Ақуыз-ақуыз өзара әрекеттесулері мен құрылымдық байланыстар

    Ақуыз-ақуыз өзара әрекеттесулері: биохимиялық процестер, молекулалық машиналар құрамындағы рөлі, ауруларға байланысы. Зерттеулер мен ахуалдарды қарастырады.

    #286246 · 14 мин оқу

  29. Протеин құрылымының жоғарғы деңгейдегі элементтері

    Протеин құрылымы: Суперсекундырлық құрылымдар, α-спиральді түйреуіштер, протеин қалыптасуы. Биологиялық мақсаттарға арналған маңызды ақпарат!

    #287969 · 1 мин оқу

  30. Додекамерлі ақуыз құрылымы және интрагендік комплементация

    Додекамерлі ақуыз құрылымы, 12 суббірлікten тұрады. Көптеген топологиялар болғанымен, негізгілері: тетраэдрлік тримерлер & екі қатарлы гексамерлер.

    #304455 · 1 мин оқу

  31. Төртбұрышты құрылымды ақуыздар және олардың қасиеттері

    Төрттік құрылымды протеин: 4 суббірліктен тұрады. Гомотетрамерлер, гетеротетрамерлер, димерлер туралы ақпарат. Бұл байланыс негізінен ковалентті емес.

    #309874 · 1 мин оқу

  32. Ақуыздың жасуша ішіндегі орналасуын болжау

    Прогнозирование локализации белков в клетке: точное определение местоположения белка (ядро, ЭР, Гольджи и др.) для биоинформатики и разработки лекарств.

    #323435 · 3 мин оқу

  33. Молекулалық өзара әрекеттесуді есептеу моделі

    Молекулалық қарымқатынастың есептеулік модельдеуі: макромолекулалық байланыс, протеин-протеин және протеин-нүклеин қышқылдары доктеуі, құрылым болжау.

    #324667 · 5 мин оқу

  34. Құрылымы бекітілмеген ақуыздар

    Протеиндердің құрылымы: Ретсіз протеиндер (IDP) – тұрақты 3D құрылымы жоқ, бірақ маңызды биологиялық функцияларды атқаратын молекулалар. ДНК реттеу, жасуша сигналдау.

    #344151 · 12 мин оқу

  35. Ерітіндіде болжамды түрде жиырылатын тізбекті молекулалар

    Жұқыр молекулалар (фольдамерлер) – белоктар сияқты күрделі құрылымдарға өздігінен жиналатын, болжамды пішіндегі тізбектер. Химия, молекулалық құрастыру.

    #347779 · 3 мин оқу

  36. Карлос Симмерлинг: Құрылымдық биология және дәрі жасаудағы компьютерлік модельдеу инновациялары

    Карлос Симмерлинг – химия профессоры, Стэйт Юниверсити оф Нью-Йорк. Құрылымдық биология, белок құрылымын болжау, есептеу әдістері сарапшысы.

    #358918 · 2 мин оқу

  37. Протеин құрылымын болжау әдісі

    Протеин құрылымын болжау әдісі: протеин тізбектеу, белгілі құрылымдарға ұқсас, бірақ гомологтары жоқ ақуыздарды модельдеуге көмектеседі. Биологиялық зерттеулерге пайдалы.

    #364161 · 5 мин оқу

  38. Ақуыз құрылымын зерттеу жобасы: Rosetta@home

    Rosetta@home – BOINC платформасындағы әйелдердің денсаулығы, Альцгеймер және малярия сияқты ауруларды зерттейтін ерікті есептеу жобасы. Протеин құрылымын болжайды.

    #372980 · 15 мин оқу

  39. Биоақпараттамадағы мотивтерді тану матрицалары

    Биоинформатика: Мотивтерді талдау үшін қолданылатын позициялық салмақ матрицалары (PWM) туралы ақпарат. ДНК, РНҚ тізбектеріндегі үлгілерді анықтауға көмектеседі.

    #396554 · 2 мин оқу

  40. Протеин контакт карталары және құрылымдық анализ әдістері

    Протеин контакт картасы: аминқышқылдары арасындағы қашықтықты 2D матрица түрінде көрсетеді. 3D құрылымды қарапайымдайды, айналуға төзімді.

    #398889 · 5 мин оқу

  41. Молекулалық геометрияны есептеудегі Ішкі Координаталық Механика

    Молекула құрылымын болжауға арналған ICM бағдарламасы туралы біліңіз. Ішкі координаттар, пептидтер модельдеу, дәрілік дизайн және құрылымдық биология.

    #410647 · 1 мин оқу

  42. Протеин құрылымдарындағы атомдық қашықтықтың RMSD өлшемі

    Протеин құрылымын салыстырудағы RMSD: атомдар аралық орташа қашықтық өлшемі. Биоинформатикада маңызды, құрылымдық өзгерістерді анықтауға көмектеседі.

    #428180 · 2 мин оқу

  43. Протеин отбасылары, домендері және функционалдық орталықтар базасы

    InterPro – ақуыз отбасылары, домендері мен функционалдық орталықтардың базасы. Жаңа ақуыз тізбектерін анықтауға көмектеседі, геномдық зерттеулерде маңызды.

    #436821 · 4 мин оқу

  44. Ақуыз-ақуыз өзара әрекеттесуін болжау әдістері

    Ақуыз-ақуыз өзара әрекеттесуін болжау: биоинформатика, құрылымдық биология, жолдарды зерттеу, кешендерді модельдеу. Әдістері мен зерттеулері туралы ақпарат.

    #437849 · 7 мин оқу

  45. Макромолекулалардың конформациялық өзгерістері

    Макромолекулалардың форма өзгеруі: биохимиядағы маңызды процесс. Қоршаған орта факторларының, pH, температураның әсерінен туындайды. Ферменттердегі ролі.

    #441370 · 2 мин оқу

  46. Протеин домендері, отбасылары және функционалдық орталықтар базасы PROSITE

    PROSITE – ақуыздық домендер, отбасылар және функционалдық орталар туралы дерекқор. Swiss Prot ақуыз аннотациясымен байланысты, 1988 жылдан бері қолданылады.

    #454563 · 1 мин оқу

  47. PSORT

    #466172 · 1 мин оқу

  48. Protein pKa calculations

    #468105 · 3 мин оқу

  49. Beta barrel

    #471622 · 4 мин оқу

  50. Biomolecular structure

    #473447 · 3 мин оқу

  51. Nucleic acid structure prediction

    #473448 · 2 мин оқу

  52. Turn (biochemistry)

    #477290 · 2 мин оқу

  53. Beta bulge

    #479055 · 2 мин оқу

  54. Polyproline helix

    #479064 · 4 мин оқу

  55. Beta helix

    #479082 · 1 мин оқу

  56. 310 helix

    #480166 · 2 мин оқу

  57. Beta-propeller

    #480651 · 3 мин оқу

  58. Dead-end elimination

    #485366 · 4 мин оқу

  59. Self-consistent mean field (biology)

    #487398 · 1 мин оқу

  60. Thermostability

    #499159 · 4 мин оқу

  61. Protein–ligand docking

    #503963 · 4 мин оқу

  62. Accessible surface area

    #509212 · 1 мин оқу

  63. Ankyrin repeat

    #510853 · 3 мин оқу