Ағылшыншамен салыстырыңыз: абзацты басыңыз — түпнұсқа терезеде ашылады. Абзац астындағы EN түймесі оны мәтін ішінде көрсетеді.
Мазмұны
Кіріспе
Bioclipse жобасы - Eclipse Rich Client Platform (RCP) негізінде химия және биоинформатика үшін Java негізделген, ашық бастапқы коды бар, визуалды платформа.
The Bioclipse project is a Java based, open source, visual platform for chemo and bioinformatics based on the Eclipse Rich Client Platform (RCP).
Туралы
Biclipse 2009 жылы скрипттік функционалдылыққа ие болды, ал 2021 жылы командалық жол нұсқасы болды. Кез-келген RCP қолданбасы сияқты, Bioclipse негізгі функционалдылық пен визуалды интерфейстерді Eclipse-тен мұра еткен плагин архитектурасын пайдаланады, мысалы көмек жүйесі, бағдарламалық жасақтама жаңартулары, артықшылықтар, платформааралық орналасу және т.б. Өзінің плагиндері арқылы Bioclipse химия және биоинформатика үшін функционалдылық пен қосымша функционалдылық беру үшін басқа, мүмкін меншік плагиндермен оңай кеңейтілетін кеңейту нүктелерін ұсынады.
Biclipse gained scripting functionality in 2009, and a command line version in 2021. Like any RCP application, Bioclipse uses a plugin architecture that inherits basic functionality and visual interfaces from Eclipse, such as help system, software updates, preferences, cross platform deployment etc. Via its plugins, Bioclipse provides functionality for chemo and bioinformatics, and extension points that easily can be extended by other, possibly proprietary, plugins to provide additional functionality.
Өнім
Bioclipse-тің тұрақтандырылған алғашқы нұсқасына химиялық-информациялық бэкендті қамтамасыз ету үшін химиялық даму жиынтығы (CDK) плагині, молекулаларды 3D-да бейнелеу үшін Jmol плагині және реттілікті талдау үшін BioJava плагині кіреді. Жақында StatET және OpenTox пайдаланатын R платформасы қосылды. Биоклипс - Proteochemometric Group, Dept. Бұл зерттеулер Еуропалық биоинформатика институтының Кристоф Штайнбек тобының және Лейден университетінің Аналитикалық химия кафедрасының Фармацевтикалық биоғылымдар кафедрасының, сонымен қатар Каролинска институты мен Маастрихт университеті сияқты басқа академиялық институттарда жасалған кеңейтулерді қамтиды. Бұл жобаны Халықаралық биоклипс қауымдастығы қолдауда.
The first stable release of Bioclipse includes a Chemistry Development Kit (CDK) plugin to provide a chemoinformatic backend, a Jmol plugin for 3D visualization of molecules, and a BioJava plugin for sequence analysis. Recently, the R platform, using StatET, and OpenTox were added. Bioclipse is developed as a collaboration between the Proteochemometric Group, Dept. of Pharmaceutical Biosciences, Uppsala University, Sweden, the Christoph Steinbeck Group at the European Bioinformatics Institute, and the Analytical Chemistry Department at Leiden University, but also includes extensions developed at other academic institutes, including the Karolinska Institutet and Maastricht University. The development is backed up by the International Bioclipse Association.
Bioclipse скрипт тілі
Bioclipse скрипт тілі (BSL) - скрипт ортасы, қазіргі уақытта JavaScript және Groovy негізделген. Ол жоғарыда айтылғандай, үшінші тарап кітапханаларының функционалдығын қамтитын менеджерлермен скрипт тілін кеңейтеді. Осылайша, бұл скрипттер Bioclipse-тегі талдауларды, мысалы, MyExperiment-те бөлісуге мүмкіндік береді. org. Bioclipse менеджерлер қолданатын негізгі деректер түрлерін анықтайды, бұл менеджерлер арасында ақпаратты пайдалануға мүмкіндік береді.
The Bioclipse Scripting Language (BSL) is a scripting environment, currently based on JavaScript and Groovy. It extends the scripting language with managers that wrap the functionality of third party libraries, as mentioned above. These scripts thus provide means to make analyses in Bioclipse sharable, for example, on MyExperiment. org. Bioclipse defines a number of core data types that managers support, allowing information to be used between these managers.