Введение
Система поиска по нескольким базам данных Entrez Global Query Cross Database Search System – это федеративная поисковая система или веб-портал, позволяющий пользователям осуществлять поиск по множеству отдельных баз данных в области наук о здоровье на веб-сайте Национального центра биотехнологической информации (NCBI). NCBI является частью Национальной медицинской библиотеки (NLM), которая, в свою очередь, является подразделением Национального института здоровья (NIH), входящего в состав Департамента здравоохранения и социальных служб США. Название "Entrez" (французское приветствие, означающее "Входите") было выбрано, чтобы отразить открытость доступа общественности к контенту, предоставляемому NLM. Entrez Global Query – это интегрированная система поиска и получения информации, обеспечивающая одновременный доступ ко всем базам данных с использованием единой строки запроса и пользовательского интерфейса. Entrez эффективно извлекает связанные последовательности, структуры и ссылки. Система Entrez может предоставлять данные о последовательностях генов и белков, а также карты хромосом. Некоторые учебники также доступны онлайн через систему Entrez.
The Entrez Global Query Cross Database Search System is a federated search engine, or web portal that allows users to search many discrete health sciences databases at the National Center for Biotechnology Information (NCBI) website. The NCBI is a part of the National Library of Medicine (NLM), which is itself a department of the National Institutes of Health (NIH), which in turn is a part of the United States Department of Health and Human Services. The name "Entrez" (a greeting meaning "Come in" in French) was chosen to reflect the spirit of welcoming the public to search the content available from the NLM. Entrez Global Query is an integrated search and retrieval system that provides access to all databases simultaneously with a single query string and user interface. Entrez can efficiently retrieve related sequences, structures, and references. The Entrez system can provide views of gene and protein sequences and chromosome maps. Some textbooks are also available online through the Entrez system.
Особенности
Первая страница Entrez по умолчанию обеспечивает доступ к глобальному поиску. Все базы данных, индексируемые Entrez, можно искать, используя одну строку запроса, поддерживающую булевы операторы и теги поисковых терминов для ограничения частей поискового запроса конкретными полями. Результатом является единая страница результатов, отображающая количество совпадений для поиска в каждой из баз данных, а также ссылки на фактические результаты поиска для данной базы данных. Entrez также предоставляет аналогичный интерфейс для поиска в каждой конкретной базе данных и для уточнения результатов поиска. Функция "Ограничения" позволяет пользователю сузить область поиска с помощью веб-формы. Функция "История" предоставляет нумерованный список недавно выполненных запросов. К результатам предыдущих запросов можно обращаться по номеру и комбинировать их с помощью булевых операторов. Результаты поиска можно временно сохранять в буфер обмена. Пользователи, имеющие учетную запись MyNCBI, могут сохранять запросы неограниченно долго и получать уведомления по электронной почте об обновлениях результатов поиска для сохраненных запросов по большинству баз данных. Entrez широко используется в области биотехнологии как справочный инструмент как для студентов, так и для профессионалов.
Доступ
В дополнение к использованию форм поисковой системы для запроса данных в Entrez, NCBI предоставляет Entrez Programming Utilities (eUtils) для более прямого доступа к результатам запросов. Доступ к eUtils осуществляется путем отправки специально сформированных URL-адресов на сервер NCBI и разбора XML-ответа. Ранее существовал также SOAP-интерфейс eUtils, который был прекращен в июле 2015 года.
История
В 1991 году Entrez был выпущен на CD-ROM. В 1993 году клиент-серверная версия программного обеспечения обеспечила подключение к Интернету. В 1994 году NCBI создал веб-сайт, и Entrez вошел в состав этой первой версии. В 2001 году был выпущен Entrez Bookshelf, а в 2003 году разработана база данных Entrez Gene.