Введение
Транспортеры магния – это белки, которые обеспечивают транспорт магния через клеточную мембрану. Всем формам жизни необходим магний, однако молекулярные механизмы поглощения Mg2+ из окружающей среды и распределения этого жизненно важного элемента внутри организма до сих пор выясняются постепенно. АТФазная функция MgtA сильно зависит от кардиолипина и, как было показано, способна обнаруживать свободный магний в диапазоне мкМ.
У бактерий Mg2+ вероятно в основном поставляется белком CorA, а при его отсутствии – белком MgtE. У дрожжей начальное поглощение осуществляется посредством белков Alr1p и Alr2p, но на данном этапе единственным идентифицированным белком, распределяющим Mg2+ внутри клетки, является Mrs2p. У простейших был идентифицирован только один транспортер Mg2+ (XntAp). У метазоа были обнаружены гомологи белков Mrs2p и MgtE, а также две новые системы транспорта Mg2+ – TRPM6/TRPM7 и PCLN1. Наконец, у растений идентифицировано семейство гомологов Mrs2p вместе с другим новым белком AtMHX.
Эволюция
Эволюция транспорта Mg2+ оказалась довольно сложной. Белки, по-видимому, основанные на MgtE, присутствуют у бактерий и метазоа, но отсутствуют у грибов и растений, в то время как белки, по-видимому, связанные с CorA, обнаружены во всех этих группах. Два активных транспортных белка, присутствующих у бактерий, MgtA и MgtB, не проявляют гомологии в высших организмах. Также существуют системы транспорта Mg2+, которые встречаются только в высших организмах.
Типы
Существует большое количество белков, которые еще предстоит идентифицировать и которые транспортируют Mg2+. Даже в наиболее изученных эукариотах, дрожжах, Боррелли сообщил об Mg2+/H+ антипортере без ассоциированного белка, который, вероятно, локализован в аппарате Гольджи. По крайней мере, один крупный транспортер Mg2+ в дрожжах остается невыясненным – тот, который влияет на транспорт Mg2+ внутрь и наружу вакуоли дрожжей. В более высокоорганизованных многоклеточных организмах, по-видимому, многие белки, транспортирующие Mg2+, еще предстоит открыть. Транспортеры Mg2+, содержащие домен CorA (CorA, Alr-подобные и Mrs2-подобные), имеют схожий, но не идентичный спектр сродства к двухвалентным катионам. На самом деле, это наблюдение можно распространить на все транспортеры Mg2+, идентифицированные на сегодняшний день. Это сходство позволяет предположить, что основные свойства Mg2+ сильно влияют на возможные механизмы распознавания и транспорта. Однако это также указывает на то, что использование других ионов металлов в качестве трассеров для поглощения Mg2+ не обязательно даст результаты, сопоставимые со способностью транспортера транспортировать Mg2+. В идеале Mg2+ следует измерять напрямую. Поскольку 28Mg2+ практически недоступен, значительная часть старых данных потребует переинтерпретации с использованием новых инструментов для измерения транспорта Mg2+, если различные транспортеры будут сравниваться напрямую. Пионерская работа Колисека и Фрошауэра с использованием mag-fura 2 показала, что свободный Mg2+ может быть надежно измерен in vivo в некоторых системах. Вернувшись к анализу CorA с помощью этого нового инструмента, мы получили важную отправную точку для анализа новых систем транспорта Mg2+ по мере их открытия. Однако важно точно определять количество транспортера, присутствующего в мембране, если планируется сравнивать транспортные возможности. Эта бактериальная система также может оказаться полезной для анализа эукариотических белков транспорта Mg2+, но различия в биологических системах прокариот и эукариот должны учитываться в любом эксперименте.
Функция
Сравнение функций исследованных транспортных белков Mg2+ в настоящее время практически невозможно, несмотря на то, что эти белки изучались в различных биологических системах с использованием разных методологий и технологий. Обнаружение системы, в которой можно было бы напрямую сравнить все белки, стало бы значительным прорывом. Если бы удалось продемонстрировать функциональность этих белков в бактериях (S. typhimurium), то сочетание методов с использованием mag-fura 2, количественной оценки белка в оболочечной мембране и определения структуры белков (рентгеноструктурный анализ или крио-ЭМ) могло бы позволить установить основные механизмы, задействованные в распознавании и транспорте иона Mg2+. Однако, возможно, наиболее важным достижением была бы разработка методов, позволяющих измерять функцию белка в системе патч-клэмпа с использованием искусственных мембран.
Ранние исследования
В 1968 году Ласк описал ограничение роста бактерий (Escherichia coli) на средах с низким содержанием Mg2+, предположив, что бактериям необходим Mg2+ и они, вероятно, активно поглощают этот ион из окружающей среды. В следующем году та же группа и группа Silver независимо друг от друга описали поглощение и выведение Mg2+ в метаболически активных клетках E. coli, используя 28Mg2+. К концу 1971 года были опубликованы две статьи, описывающие влияние Co2+, Ni2+ и Mn2+ на транспорт Mg2+ в E. coli, Aerobacter aerogenes и Bacillus megaterium. В последнем значительном достижении перед клонированием генов, кодирующих транспортеры, было обнаружено, что существует вторая система поглощения Mg2+, демонстрирующая сходную аффинность и кинетику транспорта с первой системой, но обладающая иным диапазоном чувствительности к конкурирующим катионам. Эта система также подавлялась высокими внеклеточными концентрациями Mg2+.
.
Кора
Ген CorA и соответствующий ему белок являются наиболее тщательно изученной системой транспорта Mg2+ в любом организме. Большая часть опубликованной литературы о гене CorA исходит из лаборатории М. Э. Магуайра. Недавно группа Р. Швейена оказала значительное влияние на понимание транспорта Mg2+ посредством CorA. Ген был первоначально назван в честь кобальтоустойчивого фенотипа у E. coli, вызванного инактивацией гена. Было показано, что ген CorA присутствует у 17 граммотрицательных бактерий. С появлением большого количества полных последовательностей геномов прокартиот, было установлено, что CorA практически повсеместно распространен среди эубактерий, а также широко распространен среди архей. Локус CorA у E. coli содержит единственную открытую рамку считывания из 948 нуклеотидов, кодирующую белок из 316 аминокислот. Этот белок хорошо консервативен среди эубактерий и архей. Белки E. coli и S. typhimurium идентичны на 98%, но у более отдалённо родственных видов сходство снижается до 15–20%. Однако недавние данные свидетельствуют о том, что активность белка может регулироваться двухкомпонентной регуляторной системой PhoPQ. Этот сенсор реагирует на низкие внешние концентрации Mg2+ в процессе инфицирования S. typhimurium у человека. В условиях низкого внешнего содержания Mg2+ система PhoPQ подавляет функцию CorA, и ранее было показано, что транскрипция альтернативных транспортеров Mg2+ MgtA и MgtB активируется в этих условиях. На рисунке (не в масштабе) представлена первоначально опубликованная трансмембранная (ТМ) топология доменов белка CorA из S. typhimurium, который, как сообщалось, имеет три трансмембранных участка в C-концевом участке белка (показано синим цветом), как определено Smith et al. Доказательства того, что CorA действует как гомотетрамер, были опубликованы Warren et al. в 2004 году. В декабре 2005 года кристаллическая структура канала CorA была размещена в базе данных структур белков RSCB. Результаты показали, что белок имеет два ТМ-домена и существует как гомопентамер, что противоречит более ранним сообщениям. Перейдите по этой ссылке, чтобы увидеть структуру в 3D. Растворимые внутриклеточные части белка сильно заряжены, содержат 31 положительно заряженный и 53 отрицательно заряженных остатка. Напротив, ТМ-домены содержат только одну заряженную аминокислоту, которая, как было показано, не важна для активности транспортера. Эксперименты по мутагенезу показали, что механизм транспорта Mg2+ зависит от гидроксильных групп, выстилающих внутреннюю часть транспортного канала; также требуется мотив GMN (показан красным цветом). Прежде чем активность CorA могла быть изучена in vivo, все другие системы транспорта Mg2+ у бактериального хозяина должны были быть идентифицированы и инактивированы или удалены (см. ниже). Был сконструирован штамм S. typhimurium, содержащий функциональный ген CorA, но не содержащий MgtA и MgtB (см. также ниже), и проанализирована кинетика поглощения транспортера. Этот штамм показал почти нормальную скорость роста на стандартных средах (50 мкМ Mg2+), но удаление всех трех генов создало бактериальный штамм, требующий 100 мМ внешнего Mg2+ для нормального роста, хотя с более низкими аффинностями (Km) и скоростями (Vmax), чем для Mg2+ (см. таблицу). Значения Km для Co2+ и Ni2+ значительно выше, чем ожидаемые в нормальной клеточной среде, поэтому маловероятно, что транспортная система CorA опосредует поглощение этих ионов в естественных условиях. Гексааммин кобальта(III), Co(III)Hex, является ковалентно связанным (нелабильным) аналогом первой гидратационной оболочки для нескольких двухвалентных катионов, включая Mg2+. Радиус молекулы Co(III)Hex составляет 244 пм, что очень близко к радиусу 250 пм первой гидратационной оболочки Mg2+. Этот аналог является мощным ингибитором транспортной системы CorA, более сильным, чем Mg2+, Co2+ или Ni2+. Дополнительная сила ингибирования Co(III)Hex может быть связана с блокировкой транспортного канала из-за неспособности белка «дегидратировать» субстрат. Также было показано, что Co(III)Hex не транспортируется в клетки. Хотя ни один из генов не требуется для патогенности, белок MgtB повышает долгосрочную выживаемость патогена в клетке. Гены также повышаются in vitro, когда концентрация Mg2+ падает ниже 50 мкМ (Snavely et al., 1991a). Хотя белки имеют значения Km, аналогичные CorA, и скорость транспорта примерно в 10 раз меньше, гены могут быть частью системы извлечения Mg2+. Chamnongpol и Groisman (2002) приводят доказательства того, что роль этих белков может заключаться в компенсации инактивации белка CorA регулоном PhoPQ, и ни один из генов не проявляет сходства с CorA. Белки MgtA и MgtB имеют 75% сходства (50% идентичны), хотя, по-видимому, MgtB был приобретен посредством горизонтального переноса генов как часть Salmonella Pathogenicity Island 3. Экспериментально определена ТМ-топология белка MgtB, показывающая, что белок имеет десять ТМ-спиралей, с терминалями белка в цитоплазме (см. рисунок). MgtA присутствует в широко различающихся бактериях, но встречается не так часто, как CorA, в то время как распространение MgtB, по-видимому, довольно ограничено. Гипотез относительно необычного распространения не предлагалось. Рисунок, адаптированный из Smith et al. (1993b), показывает экспериментально определенную мембранную топологию белка MgtB в S. typhimurium. ТМ-домены показаны светло-синим цветом, а ориентация в мембране и положение N- и C-терминалей указаны. Рисунок не приведен в масштабе. Хотя белки MgtA и MgtB очень похожи, они демонстрируют некоторые незначительные различия в активности. MgtB очень чувствителен к температуре, теряя всю активность (в отношении транспорта Mg2+) при температуре 20 °C. Для определения физиологической функции этих белков потребуются дальнейшие эксперименты.
). MgtA is present in widely divergent bacteria, but is not nearly as common as CorA, while MgtB appears to have a quite restricted distribution. No hypotheses for the unusual distribution have been suggested. The figure, adapted from Smith et al. (1993b), shows the experimentally determined membrane topology of the MgtB protein in S. typhimurium. The TM domains are shown in light blue and the orientation in the membrane and the positions of the N and C termini are indicated. The figure is not drawn to scale. While the MgtA and MgtB proteins are very similar, they do show some minor differences in activity. MgtB is very sensitive to temperature, losing all activity (with regard to Mg2+ transport) at a temperature of 20 °C. Further experiments will be required to define the physiological function of these proteins.
МГТЭ
В двух статьях описывается MgtE, четвертый белок поглощения Mg2+ у бактерий, не связанный с MgtA/B или CorA. Рисунок (справа), адаптированный из Smith et al. (1995), указывает ориентацию в мембране и положения N- и C-концов. Эта фигура не выполнена в масштабе. Структура этого транспортера недавно была определена методом рентгеновской кристаллографии. Ген MgtE был впервые идентифицирован Smith et al. (1995) при скрининге на белки, подобные CorA, у бактерий, и комплементирует дефицитный по поглощению Mg2+ штамм S. typhimurium MM281 (corA mgtA mgtB), восстанавливая рост дикого типа на стандартных средах. Это сместило акцент на поглощение металлических катионов, показав, что дрожжи поглощают катионы со следующей серией сродства: Mg2+, Co2+, Zn2+ > Mn2+ > Ni2+ > Ca2+ > Sr2+. Кроме того, было предположено, что транспорт различных катионов осуществляется посредством одной и той же транспортной системы – ситуация, очень похожая на ту, что наблюдается у бактерий. В 1998 году MacDiarmid и Gardner окончательно идентифицировали белки, ответственные за наблюдаемый фенотип катионного транспорта в Saccharomyces cerevisiae, на основании исследований мутагенеза, что сделало TM-топологию этих белков более похожей на топологию CorA (см. рисунок). Также Alr1p содержит консервативный мотив GMN на внешнем конце TM 2 (TM 2') и мутация метионина (M) в этом мотиве в лейцин (L) привела к потере транспортной способности. Локализация Alr1p наблюдалась как интернализация и деградация в вакуоли в ответ на внеклеточные катионы. Mg2+ при очень низких внеклеточных концентрациях (100 мкМ; < 10% содержания Mg2+ в стандартной среде) и Co2+ и Mn2+ при относительно высоких концентрациях (> 20× стандартная среда) индуцировали изменение локализации белка Alr1p, и эффект зависел от функциональной убиквитинации, эндоцитоза и вакуолярной деградации. Salih et al., в подготовке. Кинетика поглощения Mg2+ Alr1p была исследована методами электрофизиологии на целых клетках дрожжей, что позволяет предположить, что несколько систем внутри дрожжей транспортируют Mg2+ в хранилища. Этот внутренний транспорт, вероятно, маскирует процесс поглощения. Экспрессия ALR1 в S. typhimurium без генов поглощения Mg2+ может быть альтернативой, но, как отмечалось ранее, необходимо учитывать эффекты гетерологичной системы экспрессии.
МНР2
Ген MNR2 кодирует белок, тесно связанный с белками Alr, но включает консервативные особенности, определяющие отдельную подгруппу белков CorA в геномах грибов, что указывает на отличную роль в гомеостазе Mg2+. Как и в случае мутанта alr1, рост мутанта mnr2 был чувствителен к условиям дефицита Mg2+, однако у мутанта mnr2 наблюдалось накопление большего количества Mg2+, чем у штамма дикого типа в этих условиях. Эти фенотипы позволяют предположить, что Mnr2 может регулировать хранение Mg2+ внутриклеточного компартмента. В соответствии с этой интерпретацией, белок Mnr2 был локализован на мембране вакуоли – внутреннего компартмента, участвующего в хранении избытка минеральных питательных веществ у дрожжей. Непосредственная роль Mnr2 в транспорте Mg2+ была предложена на основании наблюдения, что повышенная экспрессия Mnr2, которая перенаправляла часть белка Mnr2 на клеточную поверхность, также подавляла потребность в Mg2+ у двойного мутантного штамма alr1 alr2. Мутация mnr2 также изменяла накопление других двухвалентных катионов, что позволяет предположить, что эта мутация может увеличивать экспрессию генов Alr или активность белка. Недавние работы, клонированные и секвенированные Wiesenberger et al. (1992), показали, что Mrs2p не был идентифицирован как предполагаемый транспортер Mg2+ до Bui et al. (1999). Было показано, что транспорт Mg2+ непосредственно опосредован Mrs2p еще до клонирования гена Haynes et al. (2002).) и человеческими транспортными белками растворенных веществ SLC24 (K+ зависимый Na+/Ca2+ обмениватель). XntAp в равной степени похож на белковые семейства SLC8 и SLC24 по аминокислотной последовательности, но предсказанная TM-топология больше напоминает SLC24, хотя сходство в лучшем случае слабое, а родство – очень отдаленное. TM-домены показаны светло-синим цветом, домены α1 и α2 – зеленым. Указана ориентация в мембране и положение N- и C-концов, а рисунок не выполнен в масштабе. Зависимые от Mg2+ токи, переносимые XntAp, кинетически напоминают токи канального белка и имеют порядок селективности ионов Mg2+ > Co2+, Mn2+ > Ca2+ – серию, также очень похожую на CorA.
MRS2
Биоинформатический поиск в базах данных последовательностей выявил один гомолог гена MRS2 дрожжей у широкого спектра метазоев. Был проведен обзор исследований генов TRP, а второй обзор Монтелла (2003) посвящен исследованиям генов TRPM. Семейство ионных каналов TRPM представлено во всех метазоях. Белки TRPM6 и TRPM7 весьма необычны, поскольку содержат как домен ионного канала, так и домен киназы (рис. 1.7), роль которых является предметом наиболее ожесточенных дискуссий. Однако в присутствии TRPM6 ряд сродства транспортируемых катионов помещает Mg2+ выше Ca2+. Различия в зарегистрированной проводимости были обусловлены паттернами экспрессии этих генов. TRPM7 экспрессируется во всех исследованных типах клеток, в то время как TRPM6 демонстрирует более ограниченный паттерн экспрессии. Неудачный выбор экспериментальной системы Voets et al. (2004) привел к заключению о том, что TRPM6 является функциональным транспортером Mg2+. Однако последующие работы Chubanov et al. (2004) и Montell et al. (2002) показали,
Ген Claudin 16 был клонирован Simon et al. (1999). Паттерн экспрессии гена был определен с помощью RT-PCR и оказался очень четко локализованным в непрерывном участке почечной трубки, простирающемся от толстой нисходящей ветви мозгового вещества до дистальной извитой трубки, что укрепляет связь между геном и поглощением Mg2+.
Растения
Современные знания о молекулярных механизмах транспорта Mg2+ в растениях весьма ограничены, и лишь в трех публикациях сообщается о молекулярных основах транспорта Mg2+ у растений. Эти значения имеют физиологическое значение, поскольку несколько мембран в растениях поддерживают ΔΨ в этом диапазоне. Однако автору было сложно воспроизвести эти результаты из-за видимой "гибели" ооцитов, содержащих белок AtMRS2 11, и поэтому к этим результатам следует относиться с осторожностью. Транспортер AtMRS2 10 был проанализирован с использованием анализа поглощения радиоактивного трассера. То, как регулируется транспорт Mg2+ этим белком, не было установлено. Наблюдалось прохождение тока через белок в обоих направлениях, но для транспорта Mg2+ наружу требовался "цитоплазматический" pH 5,5, что не встречается в растительных клетках в нормальных условиях. Помимо транспорта Mg2+, Shaul et al. (1999) также показали, что этот белок способен транспортировать Zn2+ и Fe2+, но не сообщали о способности белка транспортировать другие двухвалентные катионы (например, Co2+ и Ni2+) или его чувствительности к ингибированию гексааммин-комплексом кобальта(III). Детальная кинетика транспорта Mg2+ для AtMHX не определена. Однако продемонстрированы физиологические эффекты. Когда растения A. thaliana были трансформированы конструкциями сверхэкспрессии гена AtMHX под контролем промотора CaMV 35S, растения накапливали белок и проявляли фенотип некротических поражений на листьях, что, по мнению авторов, вызвано нарушением нормальной функции вакуоли, учитывая их наблюдение о том, что общее содержание Mg2+ (или Zn2+) в трансгенных растениях не изменилось. Изображение адаптировано из работ Shaul et al. (1999) и Quednau et al. (2004), и в сочетании с анализом с использованием HMMTOP, на рисунке представлена компьютерная модель предсказанной топологии мембраны белка AtMHX у Arabidopsis thaliana. На данный момент представленная топология следует рассматриваться как предварительную гипотезу. ТМ-домены показаны светло-голубым цветом, указана ориентация в мембране и положение N- и C-концов, а рисунок не выполнен в масштабе. Домены α1 и α2, показанные зеленым цветом, достаточно гидрофобны и могут быть внедрены в мембрану.