Фагемид: Плазмида мен фагтың біріккен құрылысы және биотехнологиядағы қолданысы
Phagemid
Фагемид – ДНК-вектор, біріктірген плазмида мен бактериофаг қасиеттерін. Биотехнологияда, фагтық дисплейде қолданылады. Совет ғалымдары ашты, 1984 жылы жарияланды.
Ағылшыншамен салыстырыңыз: абзацты басыңыз — түпнұсқа терезеде ашылады. Абзац астындағы EN түймесі оны мәтін ішінде көрсетеді.
Кіріспе
Фагемид немесе фазмид – бактериофаг және плазмид қасиеттерін біріктіретін ДНК-ға негізделген клондау векторы. Бұл векторлар плазмидтің көбею қайнағымен қатар, бактериофагтан алынған көбею қайнағын да қамтиды. Көбінесе қолданылатын плазмидтерден ерекшелігі, фагемид векторлары бактериофагтың капсидына қаптамалануға қабілетті, себебі олардың генетикалық тізбегі қаптамалау сигналын береді. Фагемидтер биотехнологияның түрлі салаларында қолданылады, мысалы, оларды молекулалық биологиядағы "фаг дисплейі" деп аталатын техникада пайдалануға болады. "Фагемид" немесе "фагемидтер" терминін (жаңа сөз) әлемдік ғылыми қауымға оларды тапқан, атаған және 1984 жылдың сәуір айында "Gene" журналында мақала жариялаған совет ғалымдарының тобы ұсынды. Содан кейін әлемдік қауымдастық бұл терминді қолдана бастады.
A phagemid or phasmid is a DNA based cloning vector, which has both bacteriophage and plasmid properties. These vectors carry, in addition to the origin of plasmid replication, an origin of replication derived from bacteriophage. Unlike commonly used plasmids, phagemid vectors differ by having the ability to be packaged into the capsid of a bacteriophage, due to their having a genetic sequence that signals for packaging. Phagemids are used in a variety of biotechnology applications; for example, they can be used in a molecular biology technique called "Phage Display". The term (and new word) "phagemid" or "phagemids" was offered to the world science community by a group of Soviet scientists, who discovered them, named them, and published the article in April 1984 in Gene magazine. After that, the world community started using this term.
Клондау векторының қасиеттері
Фагемид (плазмид + фаг) – f1 фагынан алынған репликацияның f1 бастау тегін қамтитын плазмид. Оны жіпшелі фаг M13-пен бірге клондау векторының бір түрі ретінде қолдануға болады. Фагемид плазмид ретінде көбейе алады, сонымен қатар вирустық бөлшектерде бір тізбекті ДНК ретінде қапталуы мүмкін. Фагемидтерде екі тізбекті репликация үшін репликация бастау тегі (ori) және бір тізбекті репликацияны және фаг бөлшектеріне қаптауды қамтамасыз ететін f1 ori бар. Нәтижесіндегі фаг бөлшектерінде фагемид ДНК-сы басым болады. F1 жіпшелі фаг инфекциясы үшін пилус болуы қажет, сондықтан фаг бөлшектерін жасау үшін F плазмиді немесе оның туындыларын қамтитын бактериялық қабылдаушылар ғана қолданылуы мүмкін. Циклдік тізбектеуді дамытуға дейін фагемидтер тізбектеу мақсатында бір тізбекті ДНК үлгісін жасау үшін қолданылды. Бүгінде фагемидтер сайтқа бағытталған мутагенез үшін үлгілерді жасау үшін де пайдалы. Жіпшелі фагтың өмірлік циклы мен құрылымдық ерекшеліктерінің егжей-тегжейлі сипаттамасы фагты көрсету технологиясының дамуына әкелді, онда пептидтер мен ақуыздардың кең ауқымы фагтың қабықша ақуыздарына біріктіріліп, вирус бетінде көрсетілуі мүмкін. Көрсетілген пептидтер мен полипептидтер фаг бөлшегі ішіндегі сәйкес кодтаушы ДНК-мен байланысты, сондықтан бұл техника ақуыз-ақуыз өзара әрекеттесуін және басқа лиганд/рецептор комбинацияларын зерттеуге қолайлы.
A phagemid (plasmid + phage) is a plasmid that contains an f1 origin of replication from an f1 phage. It can be used as a type of cloning vector in combination with filamentous phage M13. A phagemid can be replicated as a plasmid, and also be packaged as single stranded DNA in viral particles. Phagemids contain an origin of replication (ori) for double stranded replication, as well as an f1 ori to enable single stranded replication and packaging into phage particles. than the phagemid so that the resultant phage particles contain predominantly phagemid DNA. F1 Filamentous phage infection requires the presence of a pilus so only bacterial hosts containing the F plasmid or its derivatives can be used to generate phage particles. Prior to the development of cycle sequencing, phagemids were used to generate single stranded DNA template for sequencing purposes. Today phagemids are still useful for generating templates for site directed mutagenesis. Detailed characterisation of the filamentous phage life cycle and structural features lead to the development of phage display technology, in which a range of peptides and proteins can be expressed as fusions to phage coat proteins and displayed on the viral surface. The displayed peptides and polypeptides are associated with the corresponding coding DNA within the phage particle and so this technique lends itself to the study of protein protein interactions and other ligand/receptor combinations.