Кіріспе
Грам-теріс бактериялар тобы Enterobacterales – Грам-теріс, спора түзбайтын, факультативті анаэробты, таяқша тәрізді бактериялардың Гаммапротеобактериялар класына жататын тобы. Бұл топтың типтік туысы – Enterobacter. Топтың құрамында кең, әртүрлі түрлер бар, олар ерекше экологиялық орталарда тіршілік етеді және әртүрлі биохимиялық қасиеттерге ие. Топтың көптеген туыстары адам қызметіне маңызды әсер етеді, мысалы, патогенді түрлері Escherichia coli, Salmonella enterica және Yersinia pestis, сондай-ақ Dickeya, Pectobacterium, Brenneria, Erwinia және Pantoea туыстарына жататын фитопатогендер ауыл шаруашылығына зиян келтіреді. Түрлердің көп саны және биохимиялық қасиеттерінің алуан түрлілігі осы топты және оның кіші топтарын сипаттауды өте қиын етті. Бұл топты анықтау және жіктеу негізінен 16S рРНК геномдық тізбектеріне сүйенді, ол төмен ажырату қабілетіне ие және қолданылған алгоритм мен организм штаммына байланысты әртүрлі нәтижелер береді. Бұған қоса, осы талдаулар «Enterobacteriales» тобының полифилетикалық тармақталуын, яғни бөлек кіші топтарға бөлінуін көрсетті. 2016 жылы «Enterobacteriales» тобын Enterobacterales деп қайта жіктеу ұсынылды және типтік туысы Прокариоттар номенклатурасының халықаралық кодексіне сәйкес Enterobacter болып өзгертілді.
Enterobacterales is an order of Gram negative, non spore forming, facultatively anaerobic, rod shaped bacteria with the class Gammaproteobacteria. The type genus of this order is Enterobacter. The order contained a large, diverse group of species, occupying distinct ecological niches and possessing a variety of biochemical characteristics. Many genera within the order have significant impacts on human activity, such as the pathogenic species Escherichia coli, Salmonella enterica, and Yersinia pestis, as well as agriculture harming phytopathogens such as members of the genera Dickeya, Pectobacterium, Brenneria, Erwinia and Pantoea. The large number of species as well as the range of different biochemical characteristics made describing the order and its subgroups extremely difficult. The assignment and classification of this order was largely based on 16S rRNA genome sequences, which is known to have low discriminatory power and yield different results depending on the algorithm and organism strain used. In addition, these analyses have shown that 'Enterobacteriales' exhibited polyphyletic branching, with distinct subgroups. In 2016, "Enterobacteriales" was proposed to be reclassified as Enterobacterales, and the type genus changed to Enterobacter in accordance with the International Code of Nomenclature of Prokaryotes.
Молекулалық қолтаңбалар
Enterobacterales түрлерінің геномдық тізбектерін талдау нәтижесінде осы ретке тән бес сақталған ерекше индельдер (CSI) анықталды. Бұл CSI пептид ABC тасымалдаушы пермеаза, YeiP сияқты созу факторы P, L-арабиноза изомераза, пирофосфатаза және гипотетикалық белоктарда кездеседі, және көбінесе осы реттің барлық немесе көп бөлігімен ғана ортақ болады. Бұл CSI осы ретті басқа гаммапротеобактериялардан ажыратуға мүмкіндік беретін молекулалық құралды ұсынады және Enterobacterales ретінің монофилеттік екенін растайды.