Ксантомонадалар тәртібі: бактериялар тобының сипаттамасы
Xanthomonadales
Бактериялардың Xanthomonadales тәртібі – өсімдік патогендері, адамға зиянды түрлері. Ауыл шаруашылығындағы маңызды дақылдарға зиян келтіреді, инфекция тудырады.
Ағылшыншамен салыстырыңыз: абзацты басыңыз — түпнұсқа терезеде ашылады. Абзац астындағы EN түймесі оны мәтін ішінде көрсетеді.
Мазмұны
Кіріспе
Бактериялар тобы Ксантомонадтар – гаммапротеобактериялардың бактериялық тобы. Олар бактериялық фитопатогендердің ең ірі топтарының бірі болып табылады және Xanthomonas citri, Xanthomonas euvesicatoria, Xanthomonas oryzae және Xylella fastidiosa сияқты түрлерді қамтиды. Бұл бактериялар қызанақ, банан, цитрус, күріш және кофе сияқты ауыл шаруашылығында маңызды өсімдіктерге зиян келтіреді. Бұл топтың көптеген түрлері сонымен қатар адамға патогенді. Stenotrophomonas туысына жататын түрлер – көптеген дәрілерге төзімді, мүмкіндік пайдаланатын патогендер болып табылады және иммуножеткіліксіздігі бар пациенттерде ауруханалық инфекцияларға себеп болады.
Order of bacteria
The Xanthomonadales are a bacterial order within the Gammaproteobacteria. They are one of the largest groups of bacterial phytopathogens, harbouring species such as Xanthomonas citri, Xanthomonas euvesicatoria, Xanthomonas oryzae and Xylella fastidiosa. These bacteria affect agriculturally important plants including tomatoes, bananas, citrus plants, rice, and coffee. Many species within the order are also human pathogens. Species within the genus Stenotrophomonas are multidrug resistant opportunistic pathogens that are responsible for nosocomial infections in immunodeficient patients.
Сипаттамалары
Ксантомонадтар грамтеріс, каталаза-оң, спора түзбайтын, міндетті түрде оттекті қажет ететін бактериялар. Бұл тәртіпке жататын мүшелер тік таяқша тәрізді, протекалары жоқ. Кейбір түрлері жылжымайтын болса, басқалары флагеллум арқылы қозғалады. Стенотрофомона – Ксантомонадтар ішінде нитратты тотығуға қабілетті жалғыз туыс.
The Xanthomonadales are gram negative, catalase positive, non spore forming obligate aerobes. Members belonging to the order are straight rods lacking prosthecae. While some members are non motile, other species within the order are motile by means of flagella. Stenotrophomonas is the only genus capable of nitrate reduction within the Xanthomonadales.
Таксономия
Ксантомонадтальдер екі отбасының ішінде жарамды түрде аталатын 28 туыстан тұрады: Ксантомонадтылар және Роданобактериялылар. Ксантомонадтылар отбасы 13 туыстан, ал Роданобактериялылар отбасы 14 туыстан тұрады. Отбасыларды әр отбасыға тән түрлі ақуыздардың арасында табылған сақталған ерекше инделдер негізінде бір-бірінен ажыратуға болады.
The Xanthomonadales consist of 28 validly named genera among two families: Xanthomonadaceae and Rhodanobacteraceae. The Xanthomonadaceae consists of 13 genera while the Rhodanobacteraceae consist of 14 genera. The families can be distinguished from one another on the basis of conserved signature indels found among a variety of proteins, specific for each family.
Филогенетикалық орны
Ксантомонадтар – гаммапротеобактериялар құрамындағы бактериялардың ерте дивергенттері, және олар көбінесе класс үшін жасалған филогенетикалық ағаштардың түбін анықтау үшін қолданылады. Соңғы уақытқа дейін Xanthomonodales отряды Xanthomonadaceae, Algiphilaceae, Solimonadaceae, Nevskiaceae және Sinobacteraceae тұқымдастарын қамтыды. Дегенмен, барлық тұқымдастарға тән молекулалық белгілер табылмады. Организмдер таксономиялық тұрғыдан қайта ұйымдастырылды, нәтижесінде Xanthomonadales құрамына Xanthomonadaceae кірді, ол кейін екі тұқымдасқа бөлінді. Бұл бөліну, өңделген Xanthomonadales отрядының барлық мүшелері үшін ерекше табылған CSI-ға сәйкес келді, бұл қазіргі таңда қабылданған таксономияны қолдайды. Қалған барлық түрлер Nevskiales отрядына көшірілді, олар Xanthomonadales-пен CSI-ды бөліспейді, бірақ гаммапротеобактериялар ішіндегі жақын туыстар болып қалады. Cardiobacteriales, Chromatiales, Methylococcales, Legionellales және Thiotrichales – сонымен қатар, Xanthomonadales және Nevskiales мүшелерінің филогенетикалық көршілері болып табылатын терең тармақталған отрядтар. Nevskiales отряды бір ғана тұқымдасты (Salinisphaeraceae) және алты туысты қамтиды: Alkanibacter, Fontimonas, Hydrocarboniphaga, Nevskia, Solimonas және Steroidobacter. Wohlfahrtiimonas chitiniclastica және Ignatzschineria larvae – тарихи тұрғыдан Xanthomonadaceae тұқымдасының мүшелері ретінде қабылданған екі түр. Алайда, олар тұқымдасымен немесе Xanthomonadales отрядымен сақталған белгілерді бөліспейді. Бұл түрлер жақын орналасқан гаммапротеобактериялар ішінде терең тармақтану құрайды және Cardiobacteriales мүшелерімен монофилетті болып табылады. Осылайша, бұл түрлер қазіргі уақытта incertae sedis деп белгіленеді.
The Xanthomonadales are early divergents of bacteria within the Gammaproteobacteria, and are often used to root phylogenetic trees created for the class. Until recently, the Xanthomonodales order was inclusive of the families Xanthomonadaceae, Algiphilaceae, Solimonadaceae, Nevskiaceae and Sinobacteraceae. However, no molecular signatures were found that were inclusive of all families. The organisms were taxonomically rearranged such that Xanthomonadales included Xanthomonadaceae, which was later divided into two families. The division was in accordance with CSIs that were found specifically for all members of the emended Xanthomonadales order, providing support for the currently accepted taxonomy. All other species were transferred to Nevskiales, which did not share CSIs with Xanthomonadales, but remain close relatives within the Gammaproteobacteria. Cardiobacteriales, Chromatiales, Methylococcales, Legionellales and Thiotrichales are also deep branching orders that are phylogenetic neighbours of Xanthomonadales and Nevskiales members. The order Nevskiales harbors a single family (Salinisphaeraceae) and six genera: Alkanibacter, Fontimonas, Hydrocarboniphaga, Nevskia, Solimonas and Steroidobacter. Wohlfahrtiimonas chitiniclastica and Ignatzschineria larvae are two species that have historically been accepted as members of the family Xanthomonadaceae. However, they do not share conserved signatures with the family, or with the Xanthomonodales order. These species form deep branching within neighbouring Gammaproteobacteria, and are monophyletic with Cardiobacteriales members. These species are thus currently labelled as incertae sedis.