Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Содержание
Введение
Порядок бактерий Ксантомонадцы — это бактериальный порядок в составе Гаммапротеобактерий. Они представляют собой одну из крупнейших групп бактериальных фитопатогенов, включающую такие виды, как Xanthomonas citri, Xanthomonas euvesicatoria, Xanthomonas oryzae и Xylella fastidiosa. Эти бактерии поражают сельскохозяйственно важные растения, в том числе помидоры, бананы, цитрусовые, рис и кофе. Многие виды в этом порядке также являются патогенными для человека. Виды рода Stenotrophomonas — это мультирезистентные оппортунистические патогены, вызывающие нозокомиальные инфекции у пациентов с ослабленным иммунитетом.
Order of bacteria
The Xanthomonadales are a bacterial order within the Gammaproteobacteria. They are one of the largest groups of bacterial phytopathogens, harbouring species such as Xanthomonas citri, Xanthomonas euvesicatoria, Xanthomonas oryzae and Xylella fastidiosa. These bacteria affect agriculturally important plants including tomatoes, bananas, citrus plants, rice, and coffee. Many species within the order are also human pathogens. Species within the genus Stenotrophomonas are multidrug resistant opportunistic pathogens that are responsible for nosocomial infections in immunodeficient patients.
Характеристики
Ксантомонадлы — грамотрицательные, каталазоположительные, не образующие спор облигатные аэробы. Представители этого порядка — прямые палочки, не имеющие протекающих выростов. Некоторые представители неподвижны, в то время как другие виды обладают подвижностью благодаря жгутикам. Stenotrophomonas — единственный род, способный к восстановлению нитратов в пределах Xanthomonadales.
The Xanthomonadales are gram negative, catalase positive, non spore forming obligate aerobes. Members belonging to the order are straight rods lacking prosthecae. While some members are non motile, other species within the order are motile by means of flagella. Stenotrophomonas is the only genus capable of nitrate reduction within the Xanthomonadales.
Таксономия
Ксантомонадные включают 28 валидно описанных родов, относящихся к двум семействам: Ксантомонадные (Xanthomonadaceae) и Роданобактериальные (Rhodanobacteraceae). Семейство Ксантомонадные включает 13 родов, а семейство Роданобактериальные – 14 родов. Эти семейства можно различить по наличию консервативных сигнатурных вставок и делеций в различных белках, характерных для каждого семейства.
The Xanthomonadales consist of 28 validly named genera among two families: Xanthomonadaceae and Rhodanobacteraceae. The Xanthomonadaceae consists of 13 genera while the Rhodanobacteraceae consist of 14 genera. The families can be distinguished from one another on the basis of conserved signature indels found among a variety of proteins, specific for each family.
Филогенетическое положение
Ксантомонадлы – ранние дивергенты бактерий в пределах гаммапротеобактерий и часто используются для укоренения филогенетических деревьев, создаваемых для этого класса. До недавнего времени в порядок ксантомонадных включались семейства Ксантомонадные, Алгифиловые, Солимонадные, Невскиевые и Синобактериальные. Однако не было обнаружено молекулярных сигнатур, объединяющих все эти семейства. Таксономическая перестройка привела к тому, что порядок ксантомонадных включал только семейство Ксантомонадные, которое впоследствии было разделено на два семейства. Это разделение соответствовало CSI (консервативным сигнатурным индексам), специфичным для всех представителей исправленного порядка ксантомонадных, что подтверждает современную принятую таксономию. Все остальные виды были перенесены в порядок Невскиальные, которые не имеют общих CSI с ксантомонадными, но остаются их близкими родственниками в пределах гаммапротеобактерий. Кардиобактериальные, Хроматиальные, Метилококкальные, Легионелловые и Тиотрихальные также являются глубоко разветвленными порядками, являющимися филогенетическими соседями представителей ксантомонадных и невскиальных. Порядок Невскиальные включает одно семейство (Salinisphaeraceae) и шесть родов: Alkanibacter, Fontimonas, Hydrocarboniphaga, Nevskia, Solimonas и Steroidobacter. Wohlfahrtiimonas chitiniclastica и Ignatzschineria larvae – два вида, которые исторически считались членами семейства Ксантомонадные. Однако они не имеют общих консервативных сигнатур с этим семейством или с порядком ксантомонадных. Эти виды образуют глубокие ветви в пределах соседних гаммапротеобактерий и являются монофилетическими с представителями кардиобактериальных. Таким образом, в настоящее время эти виды классифицируются как incertae sedis.
The Xanthomonadales are early divergents of bacteria within the Gammaproteobacteria, and are often used to root phylogenetic trees created for the class. Until recently, the Xanthomonodales order was inclusive of the families Xanthomonadaceae, Algiphilaceae, Solimonadaceae, Nevskiaceae and Sinobacteraceae. However, no molecular signatures were found that were inclusive of all families. The organisms were taxonomically rearranged such that Xanthomonadales included Xanthomonadaceae, which was later divided into two families. The division was in accordance with CSIs that were found specifically for all members of the emended Xanthomonadales order, providing support for the currently accepted taxonomy. All other species were transferred to Nevskiales, which did not share CSIs with Xanthomonadales, but remain close relatives within the Gammaproteobacteria. Cardiobacteriales, Chromatiales, Methylococcales, Legionellales and Thiotrichales are also deep branching orders that are phylogenetic neighbours of Xanthomonadales and Nevskiales members. The order Nevskiales harbors a single family (Salinisphaeraceae) and six genera: Alkanibacter, Fontimonas, Hydrocarboniphaga, Nevskia, Solimonas and Steroidobacter. Wohlfahrtiimonas chitiniclastica and Ignatzschineria larvae are two species that have historically been accepted as members of the family Xanthomonadaceae. However, they do not share conserved signatures with the family, or with the Xanthomonodales order. These species form deep branching within neighbouring Gammaproteobacteria, and are monophyletic with Cardiobacteriales members. These species are thus currently labelled as incertae sedis.