Ағылшыншамен салыстырыңыз: абзацты басыңыз — түпнұсқа терезеде ашылады. Абзац астындағы EN түймесі оны мәтін ішінде көрсетеді.
Мазмұны
Кіріспе
Археоглобус (Archaeoglobus) – еуроархеоттар тобына жататын туыс. Археоглобусты жоғары температуралы мұнай кендерінде кездестіруге болады, онда олар мұнайдың қышқылдануына себеп болуы мүмкін.
Genus of archaea
Archaeoglobus is a genus of the phylum Euryarchaeota. Archaeoglobus can be found in high temperature oil fields where they may contribute to oil field souring.
Метаболизм
Археоглобус 60 және 95 °C арасындағы өте жоғары температурада, қысықсыз жағдайда өседі, ең жақсы өсу 83 °C-да байқалады (ssp. A. fulgidus VC 16). A. fulgidus геномының толық тізбегі метаногенез үшін қажетті гендердің дерлік толық жиынтығын ашты. Бұл гендердің A. fulgidus-тағы функциясы әлі белгісіз, ал метил CoM редуктаза ферментінің жоқтығы басқа метаногендердегідей механизммен метаногенездің жүзеге асуына кедерес келтіреді.
Archaeoglobus grow anaerobically at extremely high temperatures between 60 and 95 °C, with optimal growth at 83 °C (ssp. A. fulgidus VC 16). The complete A. fulgidus genome sequence revealed the presence of a nearly complete set of genes for methanogenesis. The function of these genes in A. fulgidus remains unknown, while the lack of the enzyme methyl CoM reductase does not allow for methanogenesis to occur by a mechanism similar to that found in other methanogens.
Сипаттамасы мен маңызы
Археоглобус түрлері гипертермофилдер болып табылады және оларды гидротермальдық жерлерде, мұнай кен орындарында және ыстық су бұлақтарында кездестіруге болады. Олар қоршаған ортаның әсеріне ұшырағанда, мысалы, экстремалды pH немесе температура, жоғары концентрациядағы металл, антибиотиктер, ксенобиотиктер немесе оттегі қосылғанда биоқабықша түзе алады. Бұл археялар темір сульфидін өндіре отырып, мұнай және газ өңдеу жүйелерінде темір мен болаттың тозуына себеп болады. Дегенмен, олардың биоқабықшалары металлмен ластанған үлгілерді залалсыздандыру немесе металдарды экономикалық тұрғыдан пайдалы формада жинау үшін өнеркәсіптік немесе зерттеу салаларында қолданылуы мүмкін.
Archaeoglobus members are hyperthermophiles that can be found in hydrothermal vents, oil deposits, and hot springs. They can produce biofilm when subjected to environmental stresses such as extreme pH or temperature, high concentrations of metal, or the addition of antibiotics, xenobiotics, or oxygen. These archaeons are known to cause the corrosion of iron and steel in oil and gas processing systems by producing iron sulphide. Their biofilms, however, may have industrial or research applications in the form of detoxifying metal contaminated samples or to gather metals in an economically recoverable form.
Геном құрылымы
Археоглобус фулгидустың геномы – шамамен 2,178,000 негіз жұбынан тұратын, E. coli бактериясының көлемінен жартысына жуық дөңгелек хромосома. Бұл бактерия болғанымен, дұрыс тамақтандырылса археоглобус монета сияқты үлкенге дейін өсе алады. Геномның төрттен бірі функциялары әлі анықталмаған, бірақ Метанококк жәннашчи сияқты басқа археондарда экспрессияланатын сақталған белоктарды кодтайды. Тағы бір төрттен бірі археялық доменге тән белоктарды кодтайды. Геномдағы байқаларлық нәрсе – гендердің көптеген көшірмелері бар, ал көшірілген ақуыздар бір-бірінен өзгеше. Бұл, әсіресе, қалдық майлы қышқылдар арқылы көміртекті ыдырату және қайта өңдеу жолдарына қатысты метаболизмдегі айырмашылықты көрсетеді. Көшірілген гендер геномның оның әріптесі М. жәннашчиге қарағанда үлкен болуына себеп болады. Сондай-ақ, Археоглобуста M. жәннашчиде 18 болған интеиндер кодтау аймақтарында жоқ екені анықталды.
The Archaeoglobus fulgidus genome is a circular chromosome roughly half the size of E. coli at 2,178,000 base pairs. Although this is bacteria archaeoglobus can grow to the size of a quarter if fed properly. A quarter of the genome encodes preserved proteins whose functions are not yet determined, but are expressed in other archaeons such as Methanococcus jannaschii. Another quarter encodes proteins unique to the archaeal domain. One observation about the genome is that there are many gene duplications and the duplicated proteins are not identical. This suggests metabolic differentiation specifically with respect to the decomposing and recycling carbon pathways through scavenged fatty acids. The duplicated genes also gives the genome a larger genome size than its fellow archaeon M. jannaschii. It is also noted that Archaeoglobus contained no inteins in coding regions where M. jannaschii had 18.
Метаногендер мен термококкпен туыстығын көрсететін молекулалық белгілер
Архея геномдары бойынша салыстырмалы геномдық зерттеулер Археоглобус туысының мүшелерінің метаногендік археяларға ең жақын туыс екенін көрсетеді. Бұл барлық метаногендер мен Археоглобуста кездесетін 10 сақталған ерекше белгілі белоктардың болуымен расталады. Сонымен қатар, Термококк, Археоглобус және метаногендер мүшелерінде ғана кездесетін 18 ақуыз анықталды, бұл осы үш архея тобының басқа археялардан өзге ортақ ата-тегі болуы мүмкін екенін ұсынады. Дегенмен, осы архея туыстарындағы осы ерекше белгілі белоктардың ортақ болуының себебі жақтық гендердің тасымалдануы болуы мүмкін екендігіне күмәндік келтіруге болмайды.
Comparative genomic studies on archaeal genomes provide evidence that members of the genus Archaeoglobus are the closest relatives of methanogenic archaea. This is supported by the presence of 10 conserved signature proteins that are uniquely found in all methanogens and Archaeoglobus. Additionally, 18 proteins which are uniquely found in members of Thermococci, Archaeoglobus and methanogens have been identified, suggesting that these three groups of Archaea may have shared a common relative exclusive of other Archaea. However, the possibility that the shared presence of these signature proteins in these archaeal lineages is due to lateral gene transfer cannot be excluded.
Экология
Археоглобус түрлері көптеген мүмкін көміртек көздерін пайдаланып, қоқыс іздеушілер ретінде ортада өмір сүреді. Олар май қышқылдары, аминқышқылдарының ыдырауы, альдегидтер, органикалық қышқылдар және тіпті CO-дан да көміртек ала алады. Археоглобус үшін ең қолайлы өсу температурасы жоғары температура (шамамен 83 °C), бірақ биофильм ортасы қоршаған ортаның өзгеруіне белгілі бір төзімділікті қамтамасыз етеді. Биофильм полисахаридтерден, ақуыздардан және металдардан құралған.
Archaeoglobus species utilize their environment by acting as scavengers with many potential carbon sources. They can obtain carbon from fatty acids, the degradation of amino acids, aldehydes, organic acids, and possibly CO as well. Higher temperatures (approx. 83 °C) are ideal growth temperatures for Archaeoglobus, although a biofilm environment provides some environmental elasticity. Biofilm is composed of polysaccharides, proteins, and metals.
Медицина
Биофильммен қорғалған жасушаларды дәстүрлі антимикробтық терапиямен жою қиын, осының арқасында олардың медициналық қолданылуына мүмкіндік туады.
Cells protected by biofilm are difficult to destroy using conventional anti microbial therapy, which gives them medicinal possibilities.