Ағылшыншамен салыстырыңыз: абзацты басыңыз — түпнұсқа терезеде ашылады. Абзац астындағы EN түймесі оны мәтін ішінде көрсетеді.
Кіріспе
Джорджтаун университетінің медициналық орталығында орналасқан Ақуыз ақпараттық ресурсы (PIR) геномдық және протеомдық зерттеулерді, сондай-ақ ғылыми зерттеулерді қолдауға арналған біріктірілген, жалпыға қолжетімді биоинформатикалық ресурс. Ол ақуыз тізбектерінің дерекқорларын қамтиды.
The Protein Information Resource (PIR), located at Georgetown University Medical Center, is an integrated public bioinformatics resource to support genomic and proteomic research, and scientific studies. It contains protein sequences databases
Тарих
PIR 1984 жылы Ұлттық биомедициналық зерттеулер қорымен зерттеушілер мен қолданушыларға ақуыз тізбектері туралы ақпаратты анықтау және түсіндіруге көмектесетін ресурс ретінде құрылды. Оған дейін, осы қор 1964 жылдан 1974 жылға дейін Маргарет Дейхоффтың редакторлығымен жарық көрген «Ақуыз тізбегі мен құрылымының атласы» арқылы макромолекулалық тізбектердің алғашқы толық жинағын жинақтады. Дейхофф және оның зерттеу тобы ақуыз тізбектерін салыстыру, қашық байланысты тізбектерді және тізбектердегі дубликаттарды анықтау, сондай-ақ ақуыз тізбектерінің сәйкестендіруінен эволюциялық тарихты шығару үшін компьютерлік әдістерді әзірлеуде алғашқы қадам жасады. 1983 жылы Дейхоффтың қазасынан кейін Уинона Баркер мен Роберт Ледли жобаны басқаруды өз мойнына алды. 1999 жылы Кэти Х. Ву Ұлттық биомедициналық зерттеулер қорына, кейін Джорджтаун университетінің медициналық орталығына PIR-дің биоинформатикалық жұмыстарын басқару үшін қосылды. Ол алдымен Бас зерттеуші, ал 2001 жылдан бастап директор болып қызмет етеді. Төрт онжылдық бойы PIR ғылыми қауымдастыққа тегін қолжетімді көптеген ақуыз деректер базасын және талдау құралдарын ұсынып келеді, соның ішінде Ақуыз тізбегі деректер базасы – алғашқы халықаралық деректер базасы (PIR International қараңыз), ол «Ақуыз тізбегі мен құрылымының атласынан» өркендеді. 2002 жылы PIR және оның халықаралық серіктестері – Еуропалық биоинформатика институты мен Швейцария биоинформатика институты NIH грантын алды, осы арқылы Ақуыз ақпарат ресурсының Ақуыз тізбегі деректер базасын, Swiss-Prot және TrEMBL деректер базаларын біріктіріп, жалғыз ғана әлемдік ақуыз тізбегі мен функциясының дерекқоры UniProt-ты құруға кірісті. 2010 жылдан бастап PIR негізінен ақуыз аннотациясының таралуына және стандартталуына көмектесуге бағытталған көптеген ресурстарды ұсынады: PIRSF, iProClass және iProLINK. Ақуыз онтологиясы – Ақуыз ақпарат ресурсы ұсынған тағы бір танымал деректер базасы.
PIR was established in 1984 by the National Biomedical Research Foundation as a resource to assist researchers and customers in the identification and interpretation of protein sequence information. Prior to that, the foundation compiled the first comprehensive collection of macromolecular sequences in the Atlas of Protein Sequence and Structure, published from 1964 to 1974 under the editorship of Margaret Dayhoff. Dayhoff and her research group pioneered in the development of computer methods for the comparison of protein sequences, for the detection of distantly related sequences and duplications within sequences, and for the inference of evolutionary histories from alignments of protein sequences. Winona Barker and Robert Ledley assumed leadership of the project after the death of Dayhoff in 1983. In 1999, Cathy H. Wu joined the National Biomedical Research Foundation, and later on Georgetown University Medical Center, to head the bioinformatics efforts of PIR, and has served first as Principal Investigator and, since 2001, as Director. For four decades, PIR has provided many protein databases and analysis tools freely accessible to the scientific community, including the Protein Sequence Database, the first international database (see PIR International), which grew out of Atlas of Protein Sequences and Structure. In 2002, PIR – along with its international partners, the European Bioinformatics Institute and the Swiss Institute of Bioinformatics – were awarded a grant from NIH to create UniProt, a single worldwide database of protein sequence and function, by unifying the Protein Information Resource Protein Sequence Database, Swiss Prot, and TrEMBL databases. as of 2010, PIR offers a wide variety of resources mainly oriented to assist the propagation and standardization of protein annotation: PIRSF, iProClass, and iProLINK. The Protein Ontology is another popular database released by the Protein Information Resource.