Введение

Ресурс белковой информации (PIR), расположенный в Медицинском центре Джорджтаунского университета, представляет собой комплексный общедоступный биоинформатический ресурс, поддерживающий геномные и протеомные исследования, а также научные изыскания. Он содержит базы данных последовательностей белков.

История

PIR был создан в 1984 году Национальным фондом биомедицинских исследований как ресурс для помощи исследователям и пользователям в идентификации и интерпретации информации о последовательностях белков. До этого фонд составил первую всеобъемлющую коллекцию макромолекулярных последовательностей в «Атласе последовательности и структуры белков», опубликованном с 1964 по 1974 год под редакцией Маргарет Дейхофф. Дейхофф и ее исследовательская группа были пионерами в разработке компьютерных методов для сравнения последовательностей белков, обнаружения отдаленно родственных последовательностей и дубликаций внутри последовательностей, а также для вывода эволюционных историй на основе выравнивания последовательностей белков. После смерти Дейхофф в 1983 году руководство проектом перешло к Виноне Баркер и Роберту Ледли. В 1999 году Кэти Х. Ву присоединилась к Национальному фонду биомедицинских исследований, а затем к Медицинскому центру Джорджтаунского университета, чтобы возглавить биоинформатические усилия PIR, и занимала должность главного исследователя, а с 2001 года – директора. На протяжении четырех десятилетий PIR предоставлял научному сообществу множество баз данных белков и инструментов анализа, доступных бесплатно, включая базу данных последовательностей белков – первую международную базу данных (см. PIR International), которая выросла из «Атласа последовательности и структуры белков». В 2002 году PIR совместно со своими международными партнерами – Европейским институтом биоинформатики и Швейцарским институтом биоинформатики – получил грант от NIH на создание UniProt, единой мировой базы данных последовательностей и функций белков, путем объединения базы данных последовательностей белков Protein Information Resource, Swiss-Prot и TrEMBL. По состоянию на 2010 год PIR предлагает широкий спектр ресурсов, ориентированных главным образом на поддержку распространения и стандартизации аннотаций белков: PIRSF, iProClass и iProLINK. Протеиновая онтология – еще одна популярная база данных, выпущенная Информационным ресурсом белков.