Кіріспе
Бактериялардың типі Fibrobacterota – өсімдік негізді целлюлозаны тірімал жануарларда ыдыратуға мүмкіндік беретін көптеген маңызды қарын бактерияларын қамтитын шағын бактериялар типі. Бұл типке жататын бактериялар бұрын басқа типтерге жатқызылған. Fibrobacter туысы (Fibrobacterota типінің жалғыз туысы) 1988 жылы Bacteroides туысынан бөлініп шықты.
Fibrobacterota is a small bacterial phylum which includes many of the major rumen bacteria, allowing for the degradation of plant based cellulose in ruminant animals. Members of this phylum were categorized in other phyla. The genus Fibrobacter (the only genus of Fibrobacterota) was removed from the genus Bacteroides in 1988.
Таксономия
Қазіргі таңда қабылданған таксономия Номенклатурадағы тұрақты прокариоттық атаулар тізіміне (LSPN) және Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығына (NCBI) негізделген. Читиниспириллия классы Sorokin et al. 2016
Chitinispirillales тәртібі Sorokin et al. 2016]
Читиниспирилла тұқымдасы Sorokin et al. 2016
Chitinispirillum туысы Sorokin et al. 2016
C. alkaliphilum түрі Sorokin et al. 2016
Chitinivibrionia классы Sorokin et al. 2014
Chitinivibrionales тәртібі Sorokin et al. 2014
Chitinivibrionaceae тұқымдасы Sorokin et al. 2014
Chitinivibrio туысы Sorokin et al. 2014
C. alkaliphilus түрі Sorokin et al. 2014
Fibrobacteria классы Spain et al. 2012
Fibrobacterales тәртібі Spain et al. 2012 ["Fibromonadales" Abdul Rahman et al. 2016]
Fibrobacteraceae тұқымдасы Spain et al. 2012 [Fibromonadaceae" Abdul Rahman et al. 2016]
Fibrobacter туысы Montgomery et al. 1988
F. intestinalis түрі Montgomery et al. 1988
F. succinogenes түрі (Hungate 1950) Montgomery et al. 1988
F. s. elongatus подвиды Montgomery et al. 1988
F. s. succinogenes подвиды (Hungate 1950) Montgomery et al. 1988
"Candidatus Fibromonas" туысы Abdul Rahman et al. 2016
"Ca. F. termitidis" түрі Abdul Rahman et al. 2016
"Hallerella" туысы Wylensek et al. 2020
"H. porci" түрі Wylensek et al. 2021
"H. succinigenes" түрі Wylensek et al. 2020
Order Chitinispirillales Sorokin et al. 2016]
Family Chitinispirillaceae Sorokin et al. 2016
Genus Chitinispirillum Sorokin et al. 2016
Species C. alkaliphilum Sorokin et al. 2016
Class Chitinivibrionia Sorokin et al. 2014
Order Chitinivibrionales Sorokin et al. 2014
Family Chitinivibrionaceae Sorokin et al. 2014
Genus Chitinivibrio Sorokin et al. 2014
Species C. alkaliphilus Sorokin et al. 2014
Class Fibrobacteria Spain et al. 2012
Order Fibrobacterales Spain et al. 2012 ["Fibromonadales" Abdul Rahman et al. 2016]
Family Fibrobacteraceae Spain et al. 2012 [Fibromonadaceae" Abdul Rahman et al. 2016]
Genus Fibrobacter Montgomery et al. 1988
Species F. intestinalis Montgomery et al. 1988
Species F. succinogenes (Hungate 1950) Montgomery et al. 1988
Subspecies F. s. elongatus Montgomery et al. 1988
Subspecies F. s. succinogenes (Hungate 1950) Montgomery et al. 1988
Genus "Candidatus Fibromonas" Abdul Rahman et al. 2016
Species "Ca. F. termitidis" Abdul Rahman et al. 2016
Genus "Hallerella" Wylensek et al. 2020
Species "H. porci" Wylensek et al. 2021
Species "H. succinigenes" Wylensek et al. 2020
Тарату
Филомы Fibrobacterota CFB [Cytophaga Flavibacterium Bacteroidota] филомымен тығыз байланысты саналады. Бұл туыстағы екі сипатталған түр, атап айтқанда, Fibrobacter succinogenes және Fibrobacter intestinalis, сүтқоректілердің ішектеріндегі фибролиттік қауымдастықтардың маңызды мүшелері болып табылады. Өсімдік талшығын ыдырата алатын микроорганизмдерге ұзақ жылдар бойы қызығушылық болғандықтан, соңғы онжылдықтарда оларға көп көңіл бөлінді. Әртүрлі орталардан алынған 16rRNA гендерін күшейтуге негізделген молекулалық дәлелдер, бұл филом бұрын ойланғаннан гөрі әлдеқайда кең таралғанын көрсетеді. Сүтқоректілердің ортасынан алынған көптеген клондар белгілі оқшауланған түрлермен бірге «1-ші субфилум» деп аталатын топқа және кейбір шөппен қоректенетін тарақандарға жатады. Ағашпен қоректенетін Nasutitermes corniger термиттерінің артқы ішегіндегі целлюлолиттік талшықтармен байланысты бактериялық қауымдастықтарда 2-ші субфилумның басымдығы олардың жоғары термиттердегі өсімдік материалдарын ыдыратуда маңызды рөл атқаратынын көрсетеді.