Введение
Тип бактерий
Fibrobacterota — небольшой тип бактерий, включающий многие из основных бактерий рубца, обеспечивающих расщепление растительной целлюлозы у жвачных животных. Представители этого типа ранее классифицировались в других типах. Род Fibrobacter (единственный род типа Fibrobacterota) был выделен из рода Bacteroides в 1988 году.
Таксономия
В настоящее время принятая таксономия основана на Списке прокариотических названий со статусом в номенклатуре (LSPN) и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI). Класс Chitinispirillia Sorokin et al. 2016
Отряд Chitinispirillales Sorokin et al. 2016
Семейство Chitinispirillaceae Sorokin et al. 2016
Род Chitinispirillum Sorokin et al. 2016
Вид C. alkaliphilum Sorokin et al. 2016
Класс Chitinivibrionia Sorokin et al. 2014
Отряд Chitinivibrionales Sorokin et al. 2014
Семейство Chitinivibrionaceae Sorokin et al. 2014
Род Chitinivibrio Sorokin et al. 2014
Вид C. alkaliphilus Sorokin et al. 2014
Класс Fibrobacteria Spain et al. 2012
Отряд Fibrobacterales Spain et al. 2012 ["Fibromonadales" Abdul Rahman et al. 2016]
Семейство Fibrobacteraceae Spain et al. 2012 [Fibromonadaceae" Abdul Rahman et al. 2016]
Род Fibrobacter Montgomery et al. 1988
Вид F. intestinalis Montgomery et al. 1988
Вид F. succinogenes (Hungate 1950) Montgomery et al. 1988
Подвид F. s. elongatus Montgomery et al. 1988
Подвид F. s. succinogenes (Hungate 1950) Montgomery et al. 1988
Род "Candidatus Fibromonas" Abdul Rahman et al. 2016
Вид "Ca. F. termitidis" Abdul Rahman et al. 2016
Род "Hallerella" Wylensek et al. 2020
Вид "H. porci" Wylensek et al. 2021
Вид "H. succinigenes" Wylensek et al. 2020
Order Chitinispirillales Sorokin et al. 2016]
Family Chitinispirillaceae Sorokin et al. 2016
Genus Chitinispirillum Sorokin et al. 2016
Species C. alkaliphilum Sorokin et al. 2016
Class Chitinivibrionia Sorokin et al. 2014
Order Chitinivibrionales Sorokin et al. 2014
Family Chitinivibrionaceae Sorokin et al. 2014
Genus Chitinivibrio Sorokin et al. 2014
Species C. alkaliphilus Sorokin et al. 2014
Class Fibrobacteria Spain et al. 2012
Order Fibrobacterales Spain et al. 2012 ["Fibromonadales" Abdul Rahman et al. 2016]
Family Fibrobacteraceae Spain et al. 2012 [Fibromonadaceae" Abdul Rahman et al. 2016]
Genus Fibrobacter Montgomery et al. 1988
Species F. intestinalis Montgomery et al. 1988
Species F. succinogenes (Hungate 1950) Montgomery et al. 1988
Subspecies F. s. elongatus Montgomery et al. 1988
Subspecies F. s. succinogenes (Hungate 1950) Montgomery et al. 1988
Genus "Candidatus Fibromonas" Abdul Rahman et al. 2016
Species "Ca. F. termitidis" Abdul Rahman et al. 2016
Genus "Hallerella" Wylensek et al. 2020
Species "H. porci" Wylensek et al. 2021
Species "H. succinigenes" Wylensek et al. 2020
Распространение
Считается, что тип Fibrobacterota тесно связан с CFB [Cytophaga Flavibacterium Bacteroidota]. Два описанных вида этого типа, а именно Fibrobacter succinogenes и Fibrobacter intestinalis, являются важными компонентами фибролитических сообществ в кишечнике млекопитающих и привлекли значительное внимание в последние десятилетия в связи с давним интересом к микробам, способным расщеплять растительные волокна. Молекулярные данные, основанные на амплификации генов 16rRNA из различных сред обитания, указывают на то, что этот тип гораздо более широко распространен, чем предполагалось ранее. Большинство клонов из сред обитания млекопитающих группируются вместе с известными изолятами в так называемом подтипе 1, а также встречаются у некоторых тараканов, питающихся подстилкой. Преобладание подтипа 2 в бактериальных сообществах, связанных с целлюлозными волокнами, в задней кишке термитов Nasutitermes corniger, питающихся древесиной, позволяет предположить, что они играют важную роль в разложении растительного материала у высших термитов.