Кіріспе
Кейбір киназалар мен GTPазаларда кездесетін кішігірім белок домені. SRC гомология 3 домені (немесе SH3 домені) – шамамен 60 аминқышқылы қалдықтарынан тұратын кішігірім белок домені. Алғашқыда SH3 вирустық адаптерлік v Crk ақуызындағы сақталған тізбек ретінде сипатталған. Бұл домен фосфолипаза молекулаларында және Abl және Src сияқты бірнеше цитоплазмалық тирозинкиназаларда да кездеседі. Сонымен қатар, PI3 киназа, Ras GTPазасын белсендіретін белок, CDC24 және cdc25 сияқты басқа да бірнеше белоктар отбасында анықталды. SH3 домендері цитоскелетті, Ras протеинін, Src киназасын және тағы басқаларын реттейтін сигналдық жолдардың ақуыздарында табылады. SH3 ақуыздары адаптерлік ақуыздармен және тирозинкиназалармен өзара әрекеттеседі. Тирозинкиназалармен өзара әрекеттескенде, SH3 ақуыздары көбінесе белсенді орыннан алыс байланысады. Адам геномында кодталған ақуыздарда шамамен 300 SH3 домені кездеседі. Бұдан өзге, SH3 домені сигнал трандукция жолдарындағы ақуыз-ақуыз өзара әрекеттесуін бақылауға және цитоплазмалық сигнализацияға қатысқан ақуыздардың өзара әрекеттесуін реттеуге жауапты.
The SRC Homology 3 Domain (or SH3 domain) is a small protein domain of about 60 amino acid residues. Initially, SH3 was described as a conserved sequence in the viral adaptor protein v Crk. This domain is also present in the molecules of phospholipase and several cytoplasmic tyrosine kinases such as Abl and Src. It has also been identified in several other protein families such as: PI3 Kinase, Ras GTPase activating protein, CDC24 and cdc25. SH3 domains are found in proteins of signaling pathways regulating the cytoskeleton, the Ras protein, and the Src kinase and many others. The SH3 proteins interact with adaptor proteins and tyrosine kinases. Interacting with tyrosine kinases, SH3 proteins usually bind far away from the active site. Approximately 300 SH3 domains are found in proteins encoded in the human genome. In addition to that, the SH3 domain was responsible for controlling protein protein interactions in the signal transduction pathways and regulating the interactions of proteins involved in the cytoplasmic signaling.
Құрылымы
SH3 домені екі тығыз жиналған антипараллель β-парақтар түрінде орналасқан бес немесе алты β-жіпшені қамтитын ерекше бета-барельді құрылымына ие. Байлаушы аймақтарда қысқа спиральдер кездесуі мүмкін. SH3 типті құрылым – эукариоттар мен прокариоттарда да таралған ежелгі құрылым.
SH3 интерактомы
SH3 домені арқылы жүзеге асырылатын ақуыз-ақуыздық өзара әрекеттесу желілері, яғни SH3 интерактомдары, құрттың SH3 интерактомының ашытқыдағы ұқсас желіге едәуір ұқсайтынын көрсетті, себебі ол эндоцитоз процесінде қатысатын ақуыздарға қатысты айқын байытылған. Бірақ, құрт пен ашытқы арасындағы SH3 доменіне байланысты гомологты өзара әрекеттесулер кеңінен өзгертілген.