Введение
Вид бактерии
Salmonella enterica (ранее Salmonella choleraesuis) — это палочковидная, жгутиковая, факультативно-анаэробная, грамотрицательная бактерия и вид рода Salmonella. Она подразделяется на шесть подвидов: arizonae (IIIa), diarizonae (IIIb), houtenae (IV), salamae (II), indica (VI) и enterica (I). Некоторые из её сероваров являются серьезными патогенами для человека; многие из них (в частности) являются сероварами подвида Salmonella enterica subsp. enterica.
Патогенез
Выделяемые белки играют ключевую роль в патогенезе инфекционных заболеваний, вызываемых S. enterica. Сальмонелла характеризуется необычайно большим количеством фимбриальных и нефимбриальных адгезинов, которые обеспечивают образование биопленки и контакт с клетками хозяина. Выделяемые белки также вовлечены в инвазию клеток хозяина и внутриклеточную пролиферацию – два основных признака патогенеза сальмонелл.
Способность к восстановлению ДНК
Воздействие на S. enterica желчных солей, таких как дезоксихолат натрия, индуцирует SOS-ответ на повреждение ДНК, что указывает на то, что желчные соли вызывают повреждение ДНК в этом организме. Обнаружено, что воздействие желчных солей увеличивает частоту мутаций GC-AT переходов, а также индуцирует гены регулонов OxyR и SoxRS, что дополнительно свидетельствует о том, что желчные соли вызывают окислительное повреждение ДНК. AsdA (антисенсовая РНК к dnaA) – это цис-кодируемая антисенсовая РНК к dnaA, описанная у S. enterica серовара Typhi. Она была обнаружена с помощью глубокого секвенирования, а ее транскрипция подтверждена Northern blot и RACE-анализом. Предполагается, что длина AsdA составляет около 540 нуклеотидов, и она представляет собой комплементарную нить к кодирующей ДнаА, белку, играющему центральную роль в инициации репликации ДНК и, следовательно, клеточного деления. В богатых питательными веществами средах она высоко экспрессируется только после достижения стационарной фазы роста, но при ограничении железа или осмотическом стрессе экспрессия начинается уже в экспоненциальной фазе роста. Повышенная экспрессия AsdA стабилизирует мРНК dnaA, увеличивая ее уровень и, тем самым, повышая скорость трансляции. Это позволяет предположить, что AsdA является регулятором репликации ДНК.
Номенклатура
S. enterica имеет шесть подвидов, и каждый подвид имеет ассоциированные серовары, различающиеся по антигенной специфичности. S. enterica насчитывает более 2500 сероваров. Salmonella bongori ранее считалась подвидом S. enterica, но теперь признана отдельным видом в роде Salmonella. Большинство сероваров сальмонелл, вызывающих заболевания у человека, относятся к подвиду enterica. К этим серогруппам относятся S. Typhi, S. Enteritidis, S. Paratyphi, S. Typhimurium и S. Choleraesuis. Серовары могут быть обозначены так, как указано в предыдущем предложении (с заглавной буквы и без курсива после названия рода), либо следующим образом: "S. enterica subsp. enterica, serovar Typhi". S. e. subsp. arizonae, названная в честь штата Аризона, чаще всего встречается у холоднокровных животных (особенно змей), но также может инфицировать индейку, овец и людей. Она эндемична для юго-западных Соединенных Штатов. Схожий подвид S. e. subsp. diarizonae также инфицирует змей и иногда людей.
Эпидемиология
Большинство случаев сальмонеллеза вызваны пищевыми продуктами, зараженными *S. enterica*, которая часто инфицирует крупный рогатый скот и птицу, хотя другие животные, такие как домашние кошки и хомяки, также могут быть источником инфекции для человека. Она преимущественно обитает в кишечном тракте животных и человека и может быть обнаружена в кормах, почве, подстилке, помете и фекалиях. Основным резервуаром патогена является птица, и 70% случаев заболевания у людей связывают с употреблением зараженных яиц, курицы или индейки. Сырые куриные и гусиные яйца могут содержать *S. enterica*, изначально в белке, хотя большинство яиц не инфицированы. По мере старения яйца при комнатной температуре, мембрана желтка начинает разрушаться, и *S. enterica* может распространяться в желток. Охлаждение и замораживание не уничтожают все бактерии, но значительно замедляют или останавливают их рост. Пастеризация и облучение пищевых продуктов используются для уничтожения сальмонелл в коммерчески производимых продуктах, содержащих сырые яйца, таких как мороженое. Пищевые продукты, приготовленные в домашних условиях из сырых яиц, такие как майонез, торты и печенье, могут распространять сальмонеллы, если их не подвергнуть надлежащей термической обработке перед употреблением. Сальмонеллы являются ведущим пищевым патогеном в Соединенных Штатах, вызывающим наибольшее количество смертей и приводящим к самым высоким экономическим затратам. Это устойчивый микроорганизм, способный выживать в течение длительного времени в жарких и сухих условиях, что повышает его эффективность как патогена и позволяет ему выживать в суровых условиях желудочно-кишечного тракта и на фермах. Сальмонеллы были обнаружены в 10–26% проб окружающей среды на фермах в Теннесси, Северной Каролине, Алабаме, Калифорнии и Вашингтоне. Геномы *S. enterica* были реконструированы из человеческих останков возрастом до 6500 лет, обнаруженных в Западной Евразии, что свидетельствует о широком географическом распространении инфекций, вызванных *S. enterica*, в доисторические времена, а также о возможной роли процесса неолитизации в эволюции адаптации хозяина. Дополнительные реконструированные геномы из колониальной Мексики указывают на *S. enterica* как на причину коколицтли, эпидемии в Новой Испании в XVI веке. Дети в возрасте до 5 лет, пожилые люди и взрослые с ослабленным иммунитетом подвержены повышенному риску системного распространения заболевания и нуждаются в специализированном лечении для борьбы с ним. Обильное питье и антибактериальные препараты, такие как фторхинолоны, являются типичными схемами лечения сальмонеллеза. Осложнения заболевания часто проявляются в виде анемии или септицемии, а смертность составляет 15% после появления этих симптомов.