Введение

Класс белков иммунной системы

Рецепторы, подобные Toll (TLR) – это класс белков, играющих ключевую роль во врожденном иммунитете. Это одноцепочечные рецепторы, обычно экспрессируемые на клетках-сенсорах, таких как макрофаги и дендритные клетки, которые распознают структурно консервативные молекулы, происходящие от микроорганизмов. Как только эти микроорганизмы достигают физических барьеров, таких как кожа или слизистая оболочка кишечника, они распознаются TLR, что активирует иммунный ответ. TLR включают TLR1, TLR2, TLR3, TLR4, TLR5, TLR6, TLR7, TLR8, TLR9, TLR10, TLR11, TLR12 и TLR13. У людей отсутствуют гены для TLR11, TLR12 и TLR13, а у мышей – функциональный ген для TLR10. Рецепторы TLR1, TLR2, TLR4, TLR5, TLR6 и TLR10 локализованы на клеточной мембране, в то время как TLR3, TLR7, TLR8 и TLR9 находятся во внутриклеточных везикулах (поскольку они являются сенсорами нуклеиновых кислот). TLR получили свое название из-за сходства с белком, кодируемым геном toll.

Функция

Способность иммунной системы распознавать молекулы, широко представленные у патогенов, отчасти обусловлена наличием иммунных рецепторов, называемых TLR (toll-подобными рецепторами), которые экспрессируются на мембранах лейкоцитов, включая дендритные клетки, макрофаги, клетки-натуральные киллеры, клетки адаптивного иммунитета – Т-клетки и В-клетки, а также неиммунные клетки (эпителиальные и эндотелиальные клетки, и фибробласты). Связывание лигандов – либо в форме адъюванта, используемого в вакцинах, либо в форме инвазивных компонентов при естественном заражении – с TLR является ключевым молекулярным событием, которое в конечном итоге приводит к врожденным иммунным ответам и развитию антиген-специфического приобретенного иммунитета. При активации TLR рекрутируют адапторные белки (белки, опосредующие взаимодействие между другими белками) в цитозоле иммунной клетки для распространения пути передачи сигнала, индуцированного антигеном. Эти рекрутированные белки затем отвечают за последующую активацию других белков, включая протеинкиназы (IKKi, IRAK1, IRAK4 и TBK1), которые дополнительно усиливают сигнал и в конечном итоге приводят к повышению или подавлению экспрессии генов, координирующих воспалительные реакции и другие транскрипционные события. Некоторые из этих событий приводят к продукции цитокинов, пролиферации и выживанию клеток, в то время как другие способствуют усилению адаптивного иммунитета. Флагеллин, лиганд TLR5, индуцирует секрецию цитокинов при взаимодействии с TLR5 на человеческих Т-клетках. TLR, вместе с рецепторами интерлейкина 1, формируют суперсемейство рецепторов, известное как «суперсемейство рецепторов интерлейкина 1 / toll-подобных рецепторов»; все члены этого семейства имеют общий так называемый TIR (toll/IL-1 receptor) домен. Существуют три подгруппы TIR доменов. Белки с TIR доменами подгруппы 1 являются рецепторами интерлейкинов, продуцируемых макрофагами, моноцитами и дендритными клетками, и все они содержат внеклеточные домены иммуноглобулина (Ig). Белки с TIR доменами подгруппы 2 являются классическими TLR и связываются напрямую или косвенно с молекулами микробного происхождения. Третья подгруппа белков, содержащих TIR домены, состоит из адапторных белков, которые локализуются исключительно в цитозоле и опосредуют передачу сигнала от белков подгрупп 1 и 2.

Расширенная семья

TLR присутствуют как у позвоночных, так и у беспозвоночных. Молекулярные строительные блоки TLR обнаружены в бактериях и растениях, а рецепторы распознавания растительных паттернов хорошо известны как необходимые для защиты хозяина от инфекции. Таким образом, TLR представляются одним из наиболее древних и консервативных компонентов иммунной системы. В последние годы TLR также были идентифицированы в нервной системе млекопитающих. Члены семейства TLR были обнаружены на глиальных клетках, нейронах и нейральных клетках-предшественниках, где они регулируют определение судьбы клеток. По оценкам, у большинства видов млекопитающих имеется от десяти до пятнадцати типов TLR. Тринадцать TLR (обозначаемых просто TLR1–TLR13) были идентифицированы у человека и мыши, и эквивалентные формы многих из них обнаружены у других видов млекопитающих. Однако эквиваленты некоторых TLR, обнаруженных у человека, отсутствуют у всех млекопитающих. Например, ген, кодирующий белок, аналогичный TLR10 у человека, присутствует у мышей, но, по-видимому, был поврежден в прошлом ретровирусом. С другой стороны, мыши экспрессируют TLR 11, 12 и 13, ни один из которых не представлен у человека. Другие млекопитающие могут экспрессировать TLR, не встречающиеся у человека. Другие не-млекопитающие виды могут иметь TLR, отличные от TLR млекопитающих, как демонстрирует TLR14, распознающий компоненты клеточной стенки, обнаруженный у рыбы-иглобрюха Takifugu. Это может осложнить использование экспериментальных животных в качестве моделей врожденного иммунитета человека. Участие Toll-сигнализации в иммунитете было впервые продемонстрировано на плодовой мушке Drosophila melanogaster. Плодовые мушки обладают только врожденным иммунным ответом, что позволяет проводить исследования, избегая влияния адаптивных иммунных механизмов на передачу сигналов. Ответ мушки на грибковую или бактериальную инфекцию осуществляется посредством двух различных каскадов сигнализации, один из которых – Toll-путь, а другой – путь иммунодефицита. Toll-путь аналогичен TLR-сигнализации у млекопитающих, но, в отличие от TLR млекопитающих, Toll не активируется напрямую ассоциированными с патогенами молекулярными паттернами (PAMP). Его внеклеточный домен рецептора распознает расщепленную форму цитокина spätzle, который секретируется в гемолимфе в виде неактивного димерного предшественника. Toll-рецептор разделяет цитоплазматический TIR-домен с TLR млекопитающих, но внеклеточный домен и внутрицитоплазматический хвост отличаются. Это различие может отражать функцию этих рецепторов как рецепторов цитокинов, а не PRR. Toll-путь активируется различными стимулами, такими как грамположительные бактерии, грибы и факторы вирулентности. Сначала фермент, осуществляющий процессинг Spätzle (SPE), активируется в ответ на инфекцию и расщепляет Spätzle (spz). Расщепленный Spätzle затем связывается с Toll-рецептором и перекрестно связывает его внеклеточные домены. Это вызывает конформационные изменения в рецепторе, приводящие к сигнализации через Toll. С этого момента каскад сигнализации очень похож на сигнализацию через TLR у млекопитающих. Toll-индуцированный сигнальный комплекс (TICS) состоит из MyD88, Tube и Pelle (ортолога IRAK у млекопитающих). Сигнал от TICS затем передается на Cactus (гомолог IκB у млекопитающих), фосфорилированный Cactus полиубиквитилируется и деградирует, что позволяет осуществить ядерную транслокацию DIF (фактора, связанного с дорсальным иммунитетом; гомолога NF-κB у млекопитающих) и индуцировать транскрипцию генов для антимикробных пептидов (AMP), таких как дрозомицин. У Drosophila имеется в общей сложности 9 генов семейства toll и 6 генов семейства spz, которые взаимодействуют друг с другом в различной степени.

TLR2

TLR2 также известен как CD282 (кластер дифференцировки 282).

TLR3

TLR3 не использует MyD88-зависимый путь. Его лигандом является ретровирусная двухцепочечная РНК (dsRNA), которая активирует TRIF-зависимый сигнальный путь. Для изучения роли этого пути в ретровирусном перепрограммировании были разработаны методы подавления экспрессии TLR3 или TRIF, и результаты показали, что для полной индукции экспрессии генов-мишеней ретровирусным экспрессионным вектором необходим только путь TLR3. Эта ретровирусная экспрессия четырех транскрипционных факторов (Oct4, Sox2, Klf4 и c Myc; OSKM) индуцирует плюрипотентность в соматических клетках. Это подтверждается исследованием, которое демонстрирует, что эффективность и количество получаемых человеческих iPSC с использованием ретровирусных векторов снижаются при подавлении экспрессии этого пути пептидными ингибиторами или shRNA-опосредованном подавлении TLR3 или его адапторного белка TRIF. Таким образом, стимуляция TLR3 вызывает значительные изменения в ремоделировании хроматина и ядерном перепрограммировании, и активация воспалительных путей необходима для этих изменений, индукции генов плюрипотентности и генерации колоний индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека (iPSC).

TLR11

Как отмечалось выше, клетки человека не экспрессируют TLR11, но клетки мышей экспрессируют. TLR11, специфичный для мышей, распознает уропатогенную E. coli и апикомплексного паразита Toxoplasma gondii. Для Toxoplasma gondii лигандом является белок профилин, а для E. coli – флагеллин. Флагеллин от энтеропатогенной Salmonella также распознается TLR11.

Лиганды

Из-за специфичности рецепторов, подобных Toll (и других рецепторов врожденного иммунитета), они не могут быть легко изменены в ходе эволюции. Эти рецепторы распознают молекулы, постоянно ассоциированные с угрозами (то есть с патогенами или клеточным стрессом) и обладают высокой специфичностью к этим угрозам (то есть не могут быть ошибочно приняты за собственные молекулы, нормально экспрессируемые в физиологических условиях). Молекулы, связанные с патогенами и отвечающие этим требованиям, считаются критически важными для функционирования патогена и трудно поддающимися изменению посредством мутаций; их называют эволюционно консервативными. К некоторым консервативным характеристикам патогенов относятся липополисахариды (LPS) клеточной поверхности бактерий, липопротеины, липопептиды и липоарабиноманнан; белки, такие как флагеллин из бактериальных жгутиков; двухцепочечная РНК вирусов; неметилированные CpG-острова бактериальной и вирусной ДНК; а также CpG-острова, обнаруженные в промоторах эукариотической ДНК, и некоторые другие молекулы РНК и ДНК. Поскольку лиганды TLR присутствуют в большинстве патогенов, они также могут содержаться в вакцинах, полученных из патогенов (например, вакцины против кори, паротита, краснухи, гриппа и полиомиелита). Большинство коммерчески доступных вакцин были исследованы на предмет способности их собственных лигандов TLR активировать различные подмножества иммунных клеток. Для большинства TLR специфичность распознавания лигандов в настоящее время установлена с помощью генной таргетной терапии (также известной как "нокаут гена") – техники, позволяющей избирательно удалять отдельные гены у мышей. Сводка известных лигандов TLR представлена в таблице выше.

Эндогенные лиганды

Стереотипный воспалительный ответ, вызванный активацией Toll-подобных рецепторов, породил предположение о том, что эндогенные активаторы этих рецепторов могут участвовать в развитии аутоиммунных заболеваний. Предполагается, что TLR связываются с молекулами организма-хозяина, включая фибриноген (участвующий в свертывании крови), белки теплового шока (HSP), HMGB1, компоненты внеклеточного матрикса и собственную ДНК (которая обычно разрушается нуклеазами, но в условиях воспаления и аутоиммунитета может образовывать комплекс с эндогенными белками, приобретать устойчивость к этим нуклеазам и проникать к эндосомным TLR, таким как TLR7 или TLR9). Эти эндогенные лиганды обычно образуются в результате нефизиологической гибели клеток. Сигнализация TLR разделяется на два различных сигнальных пути: зависимый от MyD88 и зависимый от TRIF.

MyD88-зависимый путь

Реакция, зависимая от MyD88, происходит при димеризации TLR и используется всеми TLR, за исключением TLR3. Ее основным эффектом является активация NFκB и митоген-активированных протеинкиназ. Связывание лиганда и конформационные изменения, происходящие в рецепторе, приводят к рекрутированию адапторного белка MyD88, члена семейства TIR. MyD88 затем рекрутирует IRAK4, IRAK1 и IRAK2. IRAK-киназы затем фосфорилируют и активируют белок TRAF6, который, в свою очередь, полиубиквинирует белок TAK1, а также сам себя для облегчения связывания с IKKβ. При связывании TAK1 фосфорилирует IKKβ, который затем фосфорилирует IκB, вызывая его деградацию и позволяя NFκB диффундировать в ядро клетки и активировать транскрипцию, что приводит к индукции воспалительных цитокинов.

ТРИФ-зависимый путь

И TLR3, и TLR4 используют TRIF-зависимый путь, который активируется dsRNA и LPS соответственно. Для TLR3 dsRNA приводит к активации рецептора и рекрутированию адаптора TRIF. TRIF активирует киназы TBK1 и RIPK1, что создает ветвление в сигнальном пути. Сигнальный комплекс TRIF/TBK1 фосфорилирует IRF3, обеспечивая его транслокацию в ядро и продукцию интерферона I типа. В то же время, активация RIPK1 вызывает полиубиквитинирование и активацию TAK1 и NFκB транскрипции аналогично MyD88-зависимому пути. В последнее время ресиквимод изучается как средство для иммунотерапии рака, действующее посредством стимуляции макрофагов, связанных с опухолью. Несколько лигандов TLR находятся в стадии клинической разработки или тестируются на животных моделях в качестве адъювантов вакцин, с первым клиническим применением у людей в рекомбинантной вакцине против опоясывающего герпеса в 2017 году, содержащей компонент монофосфорилипида А. У молочных животных во время естественной вспышки ящура были зарегистрированы уровни экспрессии мРНК TLR7. Показано, что TLR4 играет важную роль в долгосрочных побочных эффектах опиоидов. Его активация приводит к высвобождению воспалительных модуляторов, включая TNF α и IL-1β, и считается, что постоянное низкоуровневое высвобождение этих модуляторов со временем снижает эффективность лечения опиоидами и участвует в развитии толерантности к опиоидам, гипералгезии и аллодинии. Активация TLR4, индуцированная морфином, ослабляет обезболивающее действие опиоидов и усиливает развитие толерантности и зависимости от опиоидов, злоупотребление наркотиками и другие негативные побочные эффекты, такие как угнетение дыхания и гипералгезия. Препараты, блокирующие действие TNF α или IL-1β, показали способность усиливать анальгетический эффект опиоидов и уменьшать развитие толерантности и других побочных эффектов, что также было продемонстрировано с препаратами, блокирующими сам TLR4. "Неестественные" энантиомеры опиоидных препаратов, такие как (+) морфин и (+) налоксон, не обладают аффинностью к опиоидным рецепторам, но при этом проявляют такую же активность в отношении TLR4, как и их "нормальные" энантиомеры. Таким образом, "неестественные" энантиомеры опиоидов, такие как (+) налоксон, могут быть использованы для блокирования активности TLR4 опиоидных анальгетиков, не проявляя при этом аффинности к μ-опиоидным рецепторам.

Открытие

Когда микробы впервые были признаны причиной инфекционных заболеваний, сразу же стало ясно, что многоклеточные организмы должны быть способны распознавать их при заражении и, следовательно, распознавать молекулы, уникальные для микробов. Обширная литература, охватывающая большую часть прошлого века, свидетельствует о поисках ключевых молекул и их рецепторов. Более 100 лет назад Ричард Пфайффер, ученик Роберта Коха, ввел термин "эндотоксин" для описания вещества, продуцируемого грамотрицательными бактериями, способного вызывать лихорадку и шок у экспериментальных животных. В последующие десятилетия эндотоксин был химически охарактеризован и идентифицирован как липополисахарид (ЛПС), продуцируемый большинством грамотрицательных бактерий. Этот липополисахарид является неотъемлемой частью грамотрицательной мембраны и высвобождается при разрушении бактерии. Другие молекулы (бактериальные липопептиды, флагеллин и неметилированная ДНК) также показали способность провоцировать защитные реакции организма-хозяина. Однако эти реакции могут быть вредными, если они чрезмерно продолжительны или интенсивны. Логично было предположить, что для этих молекул должны существовать рецепторы, способные предупреждать организм о наличии инфекции, но они долгое время оставались неуловимыми. Рецепторы, подобные Toll (TLR), теперь считаются ключевыми молекулами, предупреждающими иммунную систему о наличии микробных инфекций. Прототипный член семейства, Toll-рецептор (; Tl) у плодовой мушки *Drosophila melanogaster*, был обнаружен в 1985 году Кристиане Нюсслайн-Фольхард и Эриком Вишаусом и их коллегами, которые в 1995 году стали лауреатами Нобелевской премии. Он известен своей ролью в развитии эмбриогенеза, определяя дорсально-вентральную ось. Свое название он получил благодаря восклицанию Кристиане Нюсслайн-Фольхард в 1985 году: "Das ist ja toll!" ("Это потрясающе!"), в связи со слаборазвитой вентральной частью личинки плодовой мушки. В 1996 году Жюль А. Хоффманн и его коллеги обнаружили, что Toll играет важную роль в иммунитете мушки к грибковым инфекциям, активируя синтез антимикробных пептидов. В 1996 году Тагути и его коллеги картировали ген Toll на хромосому. Поскольку иммунная функция Toll у *Drosophila* тогда не была известна, предполагалось, что TIL (впоследствии известный как TLR1) может участвовать в развитии млекопитающих. Однако в 1991 году (до открытия TIL) было установлено, что молекула с четкой ролью в иммунной функции у млекопитающих, рецептор интерлейкина-1 (IL-1), также имеет гомологию с Toll у *Drosophila*; цитоплазматические участки обеих молекул были сходными. В 1997 году Чарльз Джейнвей и Руслан Меджитов показали, что рецептор, подобный Toll, известный как TLR4, при искусственной лигации с помощью антител может индуцировать активацию определенных генов, необходимых для инициирования адаптивного иммунного ответа. Они использовали позиционное клонирование, чтобы доказать, что мыши, не способные реагировать на ЛПС, имеют мутации, отменяющие функцию TLR4. Это идентифицировало TLR4 как один из ключевых компонентов рецептора ЛПС. В свою очередь, другие гены TLR были инактивированы у мышей путем генной таргетной модификации, в основном в лаборатории Сидзуо Акиры и его коллег. В настоящее время считается, что каждый TLR обнаруживает дискретный набор молекул – некоторые микробного происхождения, а некоторые – продукты повреждения клеток – и сигнализирует о наличии инфекции. Растительные гомологи Toll были обнаружены Памелой Рональд в 1995 году (рисовый XA21) и Томасом Боллером в 2000 году (Arabidopsis FLS2). В 2011 году Бютлер и Хоффманн были удостоены Нобелевской премии по физиологии и медицине за их работу. Хоффманн и Акира получили Международную премию Канады Гайрднер в 2011 году.