Введение
Компьютерная программа, используемая для создания и модификации имитируемых представлений молекулярных структур. Молекулярный редактор – это компьютерная программа для создания и модификации представлений химических структур. Молекулярные редакторы могут манипулировать представлениями химической структуры в имитируемом двумерном или трехмерном пространстве, используя соответственно 2D или 3D компьютерную графику. Двумерные изображения используются для иллюстраций или для запросов к химическим базам данных. Трехмерные изображения используются для построения молекулярных моделей, обычно как часть программных пакетов для молекулярного моделирования. Редакторы молекулярных баз данных, такие как Leatherface, RECAP и Molecule Slicer, позволяют автоматически модифицировать большое количество молекул в соответствии с правилами, заданными пользователем, например, "депротонировать карбоновые кислоты" или "разрывать экзоциклические связи". Молекулярные редакторы обычно поддерживают чтение и запись как минимум одного формата файла или строчного представления. Примерами являются Molfile и упрощенная нотация входных молекулярных данных (SMILES) соответственно. Файлы, созданные молекулярными редакторами, могут быть отображены с помощью программ молекулярной графики.
A molecule editor is a computer program for creating and modifying representations of chemical structures. Molecule editors can manipulate chemical structure representations in either a simulated two dimensional space or three dimensional space, via 2D computer graphics or 3D computer graphics, respectively. Two dimensional output is used as illustrations or to query chemical databases. Three dimensional output is used to build molecular models, usually as part of molecular modelling software packages. Database molecular editors such as Leatherface, RECAP, and Molecule Slicer allow large numbers of molecules to be modified automatically according to rules such as 'deprotonate carboxylic acids' or 'break exocyclic bonds' that can be specified by a user. Molecule editors typically support reading and writing at least one file format or line notation. Examples of each include Molfile and simplified molecular input line entry specification (SMILES), respectively. Files generated by molecule editors can be displayed by molecular graphics tools.
Самостоятельные программы
Программа Разработчик(и) Лицензия Платформы Информация ACD/ChemSketch ACD/Labs Windows Химически интеллектуальный графический интерфейс, позволяющий рисовать практически любую химическую структуру, включая органические, органометаллические соединения, полимеры и структуры Маркуша. Доступна бесплатная версия. Amira (программное обеспечение) Visage Imaging, Zuse Institute Berlin Windows, macOS, Linux Доступна 14-дневная пробная версия. Ascalaph Designer Agile Molecule Windows, Linux Бесплатная программа. Avogadro Команда проекта Avogadro Windows, macOS, Linux 3D-редактор и визуализатор молекул. BALLView Команда проекта BALL LGPL Windows, macOS, Linux Просмотрщик, редактор, инструмент моделирования. Bioclipse Разработчики Bioclipse Кроссплатформенная Java, на основе Eclipse Rich Client Platform (RCP). Biovia Draw MDL Information Systems Windows Разработана как ISIS/Draw, теперь принадлежит Dassault Systèmes. ChemDoodle iChemLabs Кроссплатформенная Java. ChemDraw PerkinElmer Windows, macOS Редактирование химических структур и реакций. Deneb AtelGraphics Windows, Linux Доступна пробная версия; простой в использовании графический интерфейс для пакетов SIESTA, VASP, QE и т.д. ChemWindow Wiley Windows Доступна как часть программной среды KnowItAll; бесплатная для академических исследований и обучения. Gabedit Abdulrahman Allouche Windows, macOS, Linux 3D-редактор и визуализатор молекул. JChemPaint Кроссплатформенная 2D-редактор структурных формул, написанный на Java. Molecular Operating Environment (MOE) Chemical Computing Group Windows, macOS, Linux; язык программирования SVL Платформа для приложений молекулярного моделирования / поиска лекарств, с 3D-эскизом и редактированием молекул, 2D-изображением и преобразованием 2D в 3D. SAMSON Inria Windows, macOS, Linux Программная платформа для интегрированной вычислительной нанонауки. Настраивается с помощью SAMSON Elements (модулей для SAMSON). Spartan Wavefunction, Inc. Windows, macOS, Linux XDrawChem Windows, macOS, Linux На основе OpenBabel.
Встраиваемые редакторы JavaScript
Лицензия разработчика программы Настольный браузер IE6, 7, 8 Настольный браузер (другие) iPad iPhone Android Информация Kekulé Программа Kekule.js Lab Лицензия MIT KetcherEPAM Systems Лицензия Apache✔Первоначально разработана GGA Software Services до приобретения компанией EPAM Systems.