Predictor@home: Прогнозирование структуры белка с помощью BOINC
Predictor@home
Predictor@home: распределённые вычисления для предсказания структуры белков с помощью BOINC. Участие в CASP, тестирование алгоритмов, альтернатива Folding@home.
Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Введение
Проект добровольных вычислений на основе BOINC для предсказания структуры белка.
BOINC based volunteer computing project to predict protein structure
Predictor@home был проектом добровольных вычислений, использовавшим программное обеспечение BOINC для предсказания структуры белка по аминокислотной последовательности в рамках 6-го двухгодичного конкурса CASP (Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction) – критической оценки методов предсказания структуры белка. Главной целью проекта было тестирование и оценка новых алгоритмов для предсказания как известных, так и неизвестных белковых структур. Predictor@home дополнял проект Folding@home. Если последний был направлен на изучение динамики сворачивания белков, то Predictor@home ставил своей задачей определение конечной третичной структуры. Однако некоторое время Predictor@home конкурировал с другими проектами BOINC, занимающимися предсказанием структуры белка, такими как Rosetta@home. Каждый из них использовал различные методы быстрого и надежного предсказания конечной третичной структуры. В настоящее время Predictor@home неактивен.
Predictor@home was a volunteer computing project that used BOINC software to predict protein structure from protein sequence in the context of the 6th biannual CASP, or Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction. A major goal of the project was the testing and evaluating of new algorithms to predict both known and unknown protein structures. Predictor@home was complementary to Folding@home. Whereas the latter aims to study the dynamics of protein folding, Predictor@home aimed to specify what the final tertiary structure will be. However, for a time, Predictor@home competed with other BOINC protein structure prediction projects, such as Rosetta@home. Each uses different methods of rapidly and reliably predicting the final tertiary structure. Predictor@home is currently inactive.
История
Predictor@home отличается тем, что стал первым независимым проектом BOINC, который был запущен. Проект был создан и поддерживался Микелой Тауфер в Исследовательском институте Скриппса. 6 сентября 2006 года Predictor@home был временно отключен, и новые рабочие единицы перестали рассылаться. В мае 2008 года проект вернулся в альфа-статус для экспериментов с новыми методами. Летом 2008 года серверы проекта были перенесены в Мичиганский университет, и по состоянию на декабрь 2008 года проект уже несколько месяцев не отправлял никаких задач. Сайты статистики BOINC не могли получить обновленные XML-данные, так как проектная команда приостановила их передачу. 10 июня 2009 года веб-сайт и форумы Predictor@home были закрыты.
Predictor@home holds the distinction of being the first independent BOINC project to be launched. The project was set up and run by Michela Taufer at The Scripps Research Institute. On September 6, 2006, Predictor@home was temporarily taken off line, with no new work units being sent out. In May, 2008, the project reverted to Alpha status while experimenting with new methods. Over the summer of 2008, the project servers were moved to the University of Michigan and as of December 2008, the project had not sent out any work for some months. BOINC stats sites were unable to obtain updated XML data, as this had been suspended by the project team. On June 10, 2009, the Predictor@home web site and forums were shut down.