Введение
Тип плазмиды
Эписома – это особый тип плазмиды, который сохраняется как часть генома эукариот, не интегрируясь в него. Эписомы обеспечивают это, реплицируясь вместе с остальным геномом и впоследствии ассоциируясь с метафазными хромосомами во время митоза. В отличие от стандартных плазмид, эписомы не подвергаются деградации и могут быть сконструированы таким образом, чтобы не подвергаться эпигенетическому подавлению в ядре эукариотической клетки. Эписомы встречаются в природе при некоторых типах длительных инфекций, вызываемых аденоассоциированным вирусом или вирусом Эпштейна-Барр. В 2004 году было предложено использовать невирусные эписомы в генной терапии для долгосрочного изменения экспрессии генов. По состоянию на 1999 год было известно множество последовательностей ДНК (дезоксирибонуклеиновой кислоты), позволяющих стандартной плазмиде эпизомально удерживаться. Одним из примеров является последовательность S/MAR. Продолжительность эпизомального удержания значительно варьируется в зависимости от различных генетических конструкций, и существует множество известных характеристик в последовательности эписомы, влияющих на продолжительность и стабильность экспрессии переносимого трансгена. Одной из таких характеристик является количество CpG-сайтов, способствующих эпигенетическому подавлению трансгена, переносимого эписомой.
An episome is a special type of plasmid, which remains as a part of the eukaryotic genome without integration. Episomes manage this by replicating together with the rest of the genome and subsequently associating with metaphase chromosomes during mitosis. Episomes do not degrade, unlike standard plasmids, and can be designed so that they are not epigenetically silenced inside the eukaryotic cell nucleus. Episomes can be observed in nature in certain types of long term infection by adeno associated virus or Epstein Barr virus. In 2004, it was proposed that non viral episomes might be used in genetic therapy for long term change in gene expression. As of 1999, there were many known sequences of DNA (deoxyribonucleic acid) that allow a standard plasmid to become episomally retained. One example is the S/MAR sequence. The length of episomal retention is fairly variable between different genetic constructs and there are many known features in the sequence of an episome which will affect the length and stability of genetic expression of the carried transgene. Among these features is the number of CpG sites which contribute to epigenetic silencing of the transgene carried by the episome.
Механизм эпизомальной ретенции
Механизм, лежащий в основе эпизомальной ретенции в случае S/MAR-эписом, в целом остается неясным. По состоянию на 1985 год, при латентной инфекции вирусом Эпштейна-Барр, эпизомы, по-видимому, ассоциировались с ядерными белками клетки-хозяина посредством набора вирусных белков.
Эпизомы у прокариотов
Эписомы у прокариотов – это особые последовательности, которые могут делиться как независимо от прокариотической хромосомы, так и интегрироваться в нее.