Введение

Ретропозоны — это повторяющиеся фрагменты ДНК, которые встраиваются в хромосомы после обратной транскрипции из любой молекулы РНК.

Разница между ретропозонами и ретротранспозонами

В отличие от ретротранспозонов, ретропозоны никогда не кодируют обратную транскриптазу (RT) (но см. ниже). Следовательно, они являются неавтономными элементами в отношении активности транспозиции (в отличие от транспозонов). Ретротранспозоны без длинных терминальных повторов (LTR), такие как человеческие элементы LINE1, иногда ошибочно называют ретропозонами. Однако это зависит от автора. Например, Говард Темин опубликовал следующее определение: ретропозоны кодируют RT, но лишены длинных терминальных повторов (LTR), например, длинно-интеркалированные элементы (LINE). Ретротранспозоны также содержат LTR, а ретровирусы, кроме того, упаковываются в вирусные частицы (вирионы). Ретропоследовательности – это неавтономные элементы, лишенные RT. Они ретропозируются с помощью механизмов автономных элементов, таких как LINE; примерами являются короткие интеркалированные ядерные элементы (SINE) или ретро(псевдо)гены, происходящие из мРНК.

Дублирование генов

Ретропозиция объясняет приблизительно 10 000 событий дупликации генов в геноме человека, из которых около 2–10% предположительно функциональны. Такие гены называются ретрогенами и представляют собой определенный тип ретропозонов.

Горизонтальный перенос генов

Классическим примером является ретропозиция сплайсированной пре-мРНК гена c-Src в провирусного предка вируса саркомы Рауса (RSV). Ретропозированная пре-мРНК c-Src по-прежнему содержала один интрон и внутри RSV теперь называется геном v-Src.