Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Содержание
Введение
Белок с рецепторной структурой, но с неустановленным лигандом.
A protein with a receptor structure but with unidentified ligand
В биохимии, сиротский рецептор – это белок, имеющий структуру, сходную с другими идентифицированными рецепторами, но для которого эндогенный лиганд еще не идентифицирован. Если лиганд для сиротского рецептора впоследствии обнаруживается, рецептор называют «усыновленным сиротой». И наоборот, термин «сиротский лиганд» относится к биологическому лиганду, чей соответствующий рецептор еще не идентифицирован.
In biochemistry, an orphan receptor is a protein that has a similar structure to other identified receptors but whose endogenous ligand has not yet been identified. If a ligand for an orphan receptor is later discovered, the receptor is referred to as an "adopted orphan". Conversely, the term orphan ligand refers to a biological ligand whose cognate receptor has not yet been identified.
Примеры
Примеры сиротских рецепторов встречаются в семействах рецепторов, связанных с G-белком (GPCR), и ядерных рецепторов. Если для сиротского рецептора обнаруживается эндогенный лиганд, он "принимается" или "деорфанизируется". Примером является ядерный рецептор фарнезоидный Х-рецептор (FXR) и GPCR TGR5/GPCR19/G-белок-связанный рецептор желчных кислот, оба из которых активируются желчными кислотами. К принятым сиротским рецепторам в группе ядерных рецепторов относятся FXR, печеночный X-рецептор (LXR) и рецептор, активируемый пролифератором пероксисом (PPAR). Другим примером участка сиротского рецептора является участок связывания PCP в NMDA-рецепторе, типе лиганд-зависимого ионного канала. Этот участок является местом действия рекреационного препарата PCP, однако неизвестно, связывается ли с ним какой-либо эндогенный лиганд. Сиротские GPCR обычно называют "GPR" с последующим номером, например GPR1. В семействе GPCR почти 100 генов, кодирующих рецепторы, остаются сиротскими.
Examples of orphan receptors are found in the G protein coupled receptor (GPCR) and nuclear receptor families. If an endogenous ligand is found, the orphan receptor is "adopted" or "de orphanized". An example is the nuclear receptor farnesoid X receptor (FXR) and the GPCR TGR5/GPCR19/G protein coupled bile acid receptor, both of which are activated by bile acids. Adopted orphan receptors in the nuclear receptor group include FXR, liver X receptor (LXR), and peroxisome proliferator activated receptor (PPAR). Another example of an orphan receptor site is the PCP binding site in the NMDA receptor, a type of ligand gated ion channel. This site is where the recreational drug PCP works, but no endogenous ligand is known to bind to this site. GPCR orphan receptors are usually given the name "GPR" followed by a number, for example GPR1. In the GPCR family, nearly 100 receptor like genes remain orphans.
Открытие
Исторически рецепторы обнаруживали, используя лиганды для поиска соответствующих им рецепторов. Таким образом, по определению, эти рецепторы не были "сиротскими". Однако, благодаря современным методам молекулярной биологии, таким как обратная фармакология, скрининг кДНК-библиотек и секвенирование генома, рецепторы стали идентифицировать на основе сходства последовательностей с известными рецепторами, даже не зная, какие лиганды с ними взаимодействуют.
Historically, receptors were discovered by using ligands to "fish" for their receptors. Hence, by definition, these receptors were not orphans. However, with modern molecular biology techniques such as reverse pharmacology, screening of cDNA libraries, and whole genome sequencing, receptors have been identified based on sequence similarity to known receptors, without knowing what their ligands are.