Введение
Белки млекопитающих, обнаруженные у человека
Мишень рапамицина у млекопитающих (mTOR), также называемая механистической мишенью рапамицина и иногда обозначаемая как связывающий белок FK506 12 рапамициноассоциированный белок 1 (FRAP1), – это киназа, кодируемая геном MTOR у человека. mTOR является членом семейства протеинкиназ, связанных с фосфатидилинозитол-3-киназой. mTOR взаимодействует с другими белками и служит основным компонентом двух различных белковых комплексов – mTOR комплекс 1 и mTOR комплекс 2, которые регулируют различные клеточные процессы. В качестве основного компонента mTORC2, mTOR также функционирует как тирозинкиназа, способствующая активации инсулиновых рецепторов и рецепторов фактора роста, подобного инсулину 1. mTORC2 также участвует в контроле и поддержании актинового цитоскелета. Однако, ранние исследования показали, что рапамицин обладает выраженной иммуносупрессивной и цитостатической противоопухолевой активностью. Рапамицин не привлек значительного внимания фармацевтической промышленности до 1980-х годов, когда компания Wyeth Ayerst поддержала усилия Сегала по дальнейшему изучению влияния рапамицина на иммунную систему. Это в конечном итоге привело к одобрению препарата FDA в качестве иммунодепрессанта после трансплантации почки. Однако, до одобрения FDA механизм действия рапамицина оставался полностью неизвестным.
Последующая история
Открытие TOR и mTOR произошло в результате независимых исследований природного продукта рапамицина, проведенных Джозефом Гейтманом, Рао Моввой и Майклом Н. Холлом в 1991 году, а также Дэвидом М. Сабатини, Хедие Эрджумент Бромеж, Мэри Луи, Полом Темпстом и Соломоном Х. Снайдером. Однако молекулярная мишень комплекса рапамицина FKBP12 у млекопитающих оставалась неизвестной. В 1994 году исследователи из лабораторий Стюарта Л. Шрайбера, Соломона Х. Снайдера и Роберта Т. Абрахама независимо друг от друга обнаружили белок, непосредственно взаимодействующий с рапамицином FKBP12, который получил название mTOR из-за гомологии с генами TOR/DRR дрожжей. Впоследствии он стал использоваться в качестве иммунодепрессанта после трансплантации органов. Интерес к рапамицину возродился после открытия структурно родственного иммуносупрессивного природного продукта FK506 в 1987 году. В 1989–1990 годах было установлено, что FK506 и рапамицин ингибируют сигнальные пути рецептора Т-клеток (TCR) и рецептора IL-2 соответственно. Эти два природных продукта были использованы для обнаружения белков, связывающих FK506 и рапамицин, включая FKBP12, и для получения доказательств того, что комплексы FKBP12–FK506 и FKBP12–рапамицин могут действовать посредством механизмов усиления функции, направленных на различные клеточные функции. Ключевую роль в этих исследованиях сыграли работы Фрэнсиса Дюмонта и Нолана Сигала из Merck, показавшие, что FK506 и рапамицин выступают в качестве взаимных антагонистов. Эти исследования указывали на FKBP12 как на возможную мишень рапамицина, но предполагали, что комплекс может взаимодействовать с другим звеном в механистической цепи. В 1991 году кальцинеурин был идентифицирован как мишень FKBP12–FK506. Мишень FKBP12–рапамицина оставалась неясной до тех пор, пока генетические и молекулярные исследования на дрожжах не установили, что FKBP12 является мишенью рапамицина, а TOR1 и TOR2 – мишенями комплекса FKBP12–рапамицин в 1991 и 1993 годах. В 1994 году несколько независимых групп обнаружили киназу mTOR как прямую мишень в тканях млекопитающих. Изначально аббревиатура "mTOR" расшифровывалась как "mammalian target of rapamycin" (мишень рапамицина у млекопитающих), но впоследствии значение "m" было изменено на "mechanistic" (механистическая). Аналогично, с последующими открытиями TOR у рыбы зебры был назван zTOR, TOR у Arabidopsis thaliana – AtTOR, а TOR у Drosophila – dTOR. В 2009 году Комитет по номенклатуре генов HUGO (HGNC) официально изменил название гена FRAP1 на mTOR, что означает "mechanistic target of rapamycin" (механистическая мишень рапамицина). Открытие TOR и последующая идентификация mTOR открыли путь к молекулярному и физиологическому изучению пути mTOR, получившего такое название, и оказали каталитическое влияние на развитие химической биологии, где небольшие молекулы используются в качестве зондов для изучения биологических процессов.
mTORC1
Комплекс mTOR1 (mTORC1) состоит из mTOR, регуляторного ассоциированного белка mTOR (Raptor), белка млекопитающих, летального при взаимодействии с SEC13, 8 (mLST8), а также некор-компонентов PRAS40 и DEPTOR. Этот комплекс выполняет функцию сенсора питательных веществ, энергии и редокс-потенциала и регулирует синтез белка.
mTORC2
Комплекс mTOR2 (mTORC2) состоит из MTOR, нечувствительного к рапамицину компаньона MTOR (RICTOR), MLST8 и взаимодействующего белка киназы протеина стресса млекопитающих 1 (mSIN1). Показано, что mTORC2 функционирует как важный регулятор актин-цитоскелета посредством стимуляции F-актин-стрессовых волокон, паксилина, RhoA, Rac1, Cdc42 и белковой киназы C α (PKCα). Фосфорилирование серинового остатка Ser473 Akt mTORC2 стимулирует фосфорилирование Akt на треониновом остатке Thr308 PDK1 и приводит к полной активации Akt. Кроме того, mTORC2 проявляет активность тирозинкиназы и фосфорилирует рецептор фактора роста, подобного инсулину 1 (IGF1R) и рецептор инсулина (InsR) на тирозиновых остатках Tyr1131/1136 и Tyr1146/1151 соответственно, что приводит к полной активации IGF1R и InsR. Это, по-видимому, обеспечивает большинство полезных эффектов препарата (включая увеличение продолжительности жизни в исследованиях на животных). Подавление инсулинорезистентности сиртуинами объясняет по крайней мере часть этого эффекта. Нарушение функции сиртуина 3 приводит к митохондриальной дисфункции. Рапамицин оказывает более сложное воздействие на mTORC2, ингибируя его только в определенных типах клеток при длительном воздействии. Нарушение функции mTORC2 вызывает симптомы, подобные диабету, такие как снижение толерантности к глюкозе и нечувствительность к инсулину.
Эксперименты по удалению генов
Сигнальный путь mTORC2 менее изучен, чем сигнальный путь mTORC1. Функции компонентов комплексов mTORC были исследованы с использованием нокдаунов и нокаутов, и было выявлено следующее: NIP7: нокдаун снижает активность mTORC2, что проявляется в уменьшении фосфорилирования субстратов mTORC2. RICTOR: сверхэкспрессия приводит к метастазированию, а нокдаун ингибирует фосфорилирование PKC, индуцированное факторами роста. Полное удаление Rictor у мышей вызывает эмбриональную летальность, в то время как тканеспецифическое удаление приводит к разнообразным фенотипам; общим фенотипом делеции Rictor в печени, белой жировой ткани и бета-клетках поджелудочной железы является системная непереносимость глюкозы и инсулинорезистентность в одной или нескольких тканях. Снижение экспрессии Rictor у мышей сокращает продолжительность жизни самцов, но не самок. mTOR: ингибирование mTORC1 и mTORC2 препаратом PP242 [2 (4 Amino 1 isopropyl 1H pyrazolo[3,4 d]pyrimidin 3 yl) 1H indol 5 ol] вызывает аутофагию или апоптоз; ингибирование только mTORC2 препаратом PP242 предотвращает фосфорилирование Ser 473 на AKT и останавливает клетки в фазе G1 клеточного цикла. Генетическое снижение экспрессии mTOR у мышей значительно увеличивает продолжительность жизни. PDK1: нокаут летален; гипоморфный аллель приводит к уменьшению объема органов и размеров организма, но не влияет на активацию AKT. AKT: у мышей с нокаутом наблюдается спонтанный апоптоз (AKT1), тяжелый диабет (AKT2), маленький мозг (AKT3) и задержка роста (AKT1/AKT2). Гетерозиготные мыши по AKT1 имеют увеличенную продолжительность жизни. TOR1, ортолог mTORC1 у S. cerevisiae, является регулятором метаболизма углерода и азота; штаммы TOR1 KO регулируют реакцию на азот, а также доступность углерода, что указывает на его роль ключевого сенсора питательных веществ у дрожжей.
NIP7: Knockdown reduced mTORC2 activity that is indicated by decreased phosphorylation of mTORC2 substrates. RICTOR: Overexpression leads to metastasis and knockdown inhibits growth factor induced PKC phosphorylation. Constitutive deletion of Rictor in mice leads to embryonic lethality, while tissue specific deletion leads to a variety of phenotypes; a common phenotype of Rictor deletion in liver, white adipose tissue, and pancreatic beta cells is systemic glucose intolerance and insulin resistance in one or more tissues. Decreased Rictor expression in mice decreases male, but not female, lifespan. mTOR: Inhibition of mTORC1 and mTORC2 by PP242 [2 (4 Amino 1 isopropyl 1H pyrazolo[3,4 d]pyrimidin 3 yl) 1H indol 5 ol] leads to autophagy or apoptosis; inhibition of mTORC2 alone by PP242 prevents phosphorylation of Ser 473 site on AKT and arrests the cells in G1 phase of the cell cycle. Genetic reduction of mTOR expression in mice significantly increases lifespan. PDK1: Knockout is lethal; hypomorphic allele results in smaller organ volume and organism size but normal AKT activation. AKT: Knockout mice experience spontaneous apoptosis (AKT1), severe diabetes (AKT2), small brains (AKT3), and growth deficiency (AKT1/AKT2). Mice heterozygous for AKT1 have increased lifespan. TOR1, the S. cerevisiae orthologue of mTORC1, is a regulator of both carbon and nitrogen metabolism; TOR1 KO strains regulate response to nitrogen as well as carbon availability, indicating that it is a key nutritional transducer in yeast.
Рак
Сверхактивация сигнального пути mTOR значительно способствует инициации и развитию опухолей, и активность mTOR оказалась нарушенной при многих типах рака, включая рак молочной железы, простаты, легких, меланому, рак мочевого пузыря, мозга и почечноклеточный рак. Причин конститутивной активации несколько. Среди наиболее распространенных – мутации в гене-супрессоре опухолей PTEN. PTEN-фосфатаза негативно регулирует сигнальный путь mTOR, вмешиваясь в действие PI3K, расположенного выше по потоку эффектора mTOR. Кроме того, активность mTOR нарушается во многих раковых заболеваниях в результате повышенной активности PI3K или Akt. Аналогично, переэкспрессия нисходящих эффекторов mTOR – 4E-BP1, S6K1, S6K2 и eIF4E – приводит к неблагоприятному прогнозу при раке. Также, мутации в белках TSC, ингибирующих активность mTOR, могут приводить к развитию туберозного склероза, который проявляется в виде доброкачественных новообразований и повышает риск развития почечноклеточной карциномы. Повышение активности mTOR стимулирует прогрессию клеточного цикла и увеличивает пролиферацию клеток, главным образом за счет влияния на синтез белка. Более того, активный mTOR косвенно поддерживает рост опухоли, ингибируя аутофагию. Конститутивно активированный mTOR обеспечивает карциномные клетки кислородом и питательными веществами, увеличивая трансляцию HIF1A и поддерживая ангиогенез. mTOR также способствует другой метаболической адаптации раковых клеток, поддерживающей их повышенную скорость роста – активации гликолитического метаболизма. Akt2, субстрат mTOR, в частности mTORC2, повышает экспрессию гликолитического фермента PKM2, тем самым способствуя эффекту Варбурга.
Болезнь Альцгеймера
Сигнализация mTOR пересекается с патологией болезни Альцгеймера (АД) в нескольких аспектах, что указывает на ее потенциальную роль в качестве фактора, способствующего прогрессированию заболевания. В целом, данные свидетельствуют о гиперактивности сигнализации mTOR в мозге при АД. Например, посмертные исследования мозга людей с болезнью Альцгеймера выявляют нарушение регуляции PTEN, Akt, S6K и mTOR. Сигнализация mTOR, по-видимому, тесно связана с наличием растворимых бета-амилоидных (Aβ) и тау-белков, которые агрегируют и формируют два основных признака заболевания: Aβ-плаки и нейрофибриллярные клубки, соответственно. Исследования in vitro показали, что Aβ является активатором пути PI3K/AKT, который, в свою очередь, активирует mTOR. Кроме того, воздействие Aβ на клетки N2K повышает экспрессию p70S6K – нижестоящей мишени mTOR, известной более высокой экспрессией в нейронах, которые впоследствии развивают нейрофибриллярные клубки. Клетки яичников китайского хомячка, трансфицированные семейной мутацией 7PA2, связанной с АД, также демонстрируют повышенную активность mTOR по сравнению с контролем, и эта гиперактивность блокируется ингибитором гамма-секретазы. Эти исследования in vitro показывают, что увеличение концентрации Aβ усиливает сигнализацию mTOR; однако считается, что значительно высокие, цитотоксические концентрации Aβ снижают сигнализацию mTOR. В соответствии с данными, полученными in vitro, активность mTOR и активированный p70S6K значительно повышены в коре и гиппокампе животных моделей АД по сравнению с контрольными группами. Фармакологическое или генетическое удаление Aβ в животных моделях АД устраняет нарушение нормальной активности mTOR, что указывает на прямое участие Aβ в сигнализации mTOR. Учитывая эти результаты, сигнальный путь mTOR, по-видимому, является одним из механизмов Aβ-индуцированной токсичности при АД. Гиперфосфорилирование тау-белков с образованием нейрофибриллярных клубков – один из признаков АД. Активация p70S6K способствует формированию клубков, а также гиперактивности mTOR посредством усиления фосфорилирования и снижения дефосфорилирования. Также было предложено, что mTOR способствует тау-патологии, увеличивая трансляцию тау и других белков. Синаптическая пластичность является ключевым фактором обучения и памяти – двух процессов, которые серьезно нарушены у пациентов с АД. Трансляционный контроль, или поддержание белкового гомеостаза, показал свою важность для нейронной пластичности и регулируется mTOR. Как избыточная, так и недостаточная продукция белка посредством активности mTOR, по-видимому, способствуют нарушению обучения и памяти. Более того, учитывая, что дефицит, вызванный гиперактивностью mTOR, можно уменьшить с помощью лечения рапамицином, возможно, что mTOR играет важную роль в влиянии на когнитивные функции посредством синаптической пластичности. Дополнительные доказательства активности mTOR при нейродегенерации поступают из недавних данных, демонстрирующих, что eIF2α P – вышестоящая мишень пути mTOR – опосредует гибель клеток при прионных заболеваниях посредством устойчивой трансляционной ингибиции. Некоторые данные указывают на роль mTOR в снижении клиренса Aβ. mTOR является отрицательным регулятором аутофагии; следовательно, гиперактивность в сигнализации mTOR должна снижать клиренс Aβ в мозге при АД. Нарушения аутофагии могут быть потенциальным источником патогенеза при заболеваниях, связанных с неправильным сворачиванием белка, включая АД. Исследования на мышиных моделях болезни Гентингтона показали, что лечение рапамицином облегчает удаление агрегатов хантингтина. Возможно, такое же лечение может быть полезно для удаления отложений Aβ.
Лимфопролиферативные заболевания
Гиперактивные пути mTOR были выявлены при некоторых лимфопролиферативных заболеваниях, таких как аутоиммунный лимфопролиферативный синдром (АЛПС), мультицентрическая болезнь Кастельмана и посттрансплантационное лимфопролиферативное расстройство (ПТЛР).
Синтез белка и рост клеток
Активация mTORC1 необходима для синтеза миофибриллярного мышечного белка и гипертрофии скелетных мышц у человека в ответ как на физические упражнения, так и на употребление определенных аминокислот или производных аминокислот. Постоянная инактивация mTORC1-сигнализации в скелетных мышцах способствует потере мышечной массы и силы при мышечной дистрофии в пожилом возрасте, раковой кахексии и атрофии мышц, вызванной физической неактивностью. Активация mTORC2, по-видимому, опосредует рост нейритов в дифференцированных нейро2а клетках мыши. Прерывистая активация mTOR в префронтальных нейронах β-гидрокси-β-метилбутиратом подавляет возрастное снижение когнитивных функций, связанное с обрезкой дендритов у животных, явление, которое также наблюдается у людей.
Лизосомное повреждение ингибирует mTOR и вызывает аутофагию
Активный mTORC1 локализуется на лизосомах. mTOR ингибируется при повреждении лизосомной мембраны различными экзогенными или эндогенными агентами, такими как инвазивные бактерии, химические вещества, проникающие через мембрану и образующие осмотически активные продукты (этот тип повреждения можно смоделировать, используя проникающие через мембрану дипептидные предшественники, полимеризующиеся в лизосомах), амилоидные белковые агрегаты (см. выше раздел о болезни Альцгеймера) и цитоплазматические органические или неорганические включения, включая кристаллы мочевой кислоты и кристаллический диоксид кремния. Это метаболический ответ. Однако при повреждении лизосом ингибирование mTOR активирует автофагический ответ в его функции контроля качества, что приводит к процессу, называемому лизофагией, который удаляет поврежденные лизосомы. На этом этапе другой галектин, галектин 3, взаимодействует с TRIM16, направляя селективную аутофагию поврежденных лизосом. Многие из этих процессов находятся под прямым негативным контролем mTOR, например, комплекс ULK1 ATG13, (ii) комплекс ULK1 ATG13 FIP200/RB1CC1 ассоциируется с Beclin 1 VPS34 ATG14 посредством прямых взаимодействий между HORMA доменом ATG13 и ATG14, (iii) ATG16L1 взаимодействует с WIPI2, который связывается с PI3P, ферментативным продуктом класса III PI3K Beclin 1 VPS34 ATG14. Таким образом, инактивация mTOR, инициированная (через GALTOR Beclin 1) вышеуказанных систем аутофагии и дальнейшая инактивация mTORC1, обеспечивает сильную индукцию аутофагии и аутофагическое удаление поврежденных лизосом. Кроме того, несколько типов событий убиквитинирования происходят параллельно и дополняют процессы, опосредованные галектином: убиквитинирование TRIM16, ULK1 и Beclin 1 стабилизирует эти комплексы, способствуя активации аутофагии, как описано выше. mTOR играет роль в фиброзных заболеваниях и аутоиммунитете, а блокада пути mTORC изучается в качестве метода лечения склеродермии. Полный механизм действия этих агентов не ясен, но предполагается, что они функционируют путем подавления ангиогенеза опухоли и нарушения G1/S перехода.
Антивозрастные
Ингибиторы mTOR могут быть полезны для лечения или профилактики ряда возрастных состояний, включая нейродегенеративные заболевания, такие как болезнь Альцгеймера и болезнь Паркинсона. После непродолжительного лечения ингибиторами mTOR дактолизибом и эверолимусом у пожилых людей (в возрасте 65 лет и старше) наблюдалось снижение числа инфекций в течение года. Различные природные соединения, включая эпигаллокатехин галлат (EGCG), кофеин, куркумин, берберин, кверцетин, ресвератрол и птеростильбен, показали способность ингибировать mTOR при воздействии на изолированные клетки в культуре. Однако на данный момент нет убедительных доказательств того, что эти вещества ингибируют mTOR-сигнализацию или продлевают жизнь человека при приеме в виде диетических добавок, несмотря на многообещающие результаты, полученные на животных, таких как плодовые мушки и мыши. В настоящее время проводятся различные клинические исследования.