Системная биомедицина: применение системной биологии для изучения здоровья и болезней человека. Моделирование многоуровневых процессов, ключевые факторы и интеграция данных.
Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Введение
Системная биомедицина, также называемая системной биомедицинской наукой, – это применение системной биологии к пониманию и модуляции процессов развития и патологических процессов у людей, а также в моделях на животных и клеточных моделях. В то время как системная биология направлена на моделирование исчерпывающих сетей взаимодействий (с долгосрочной целью, например, создания всеобъемлющей вычислительной модели клетки), преимущественно на внутриклеточном уровне, системная биомедицина подчеркивает многоуровневую, иерархическую природу моделей (молекулы, органеллы, клетки, ткани, органы, индивид/генотип, факторы окружающей среды, популяция, экосистема) посредством выявления и отбора ключевых факторов на каждом уровне и их интеграции в модели, раскрывающие глобальное, эмерджентное поведение рассматриваемого биологического процесса. Такой подход особенно целесообразен, когда выполнение всех экспериментов, необходимых для создания исчерпывающих моделей, ограничено временем и стоимостью (например, в моделях на животных) или этическими соображениями (например, при проведении экспериментов на людях). В 1992 году была опубликована работа по системной биомедицине, автором которой является Камада Т. (ноябрь-декабрь), а также статья о системной медицине и фармакологии, автором которой является Зенг Б. Дж. (апрель), в тот же период. В 2009 году первая коллективная монография по системной биомедицине была выпущена под редакцией Эдисона Т. Лю и Дугласа А. Лауфенбургера. В октябре 2008 года в Европейском институте онкологии была создана одна из первых исследовательских групп, специализирующихся исключительно на системной биомедицине. Один из первых исследовательских центров, специализирующихся на системной биомедицине, был основан Руди Баллингом. Люксембургский центр системной биомедицины является междисциплинарным центром Люксембургского университета. Недавно первый центр, посвященный пространственным аспектам в системной биомедицине, был создан в Университете здоровья и науки штата Орегон. Первый рецензируемый журнал по данной тематике, Systems Biomedicine, был недавно основан издательством Landes Bioscience.
Systems biomedicine, also called systems biomedical science, is the application of systems biology to the understanding and modulation of developmental and pathological processes in humans, and in animal and cellular models. Whereas systems biology aims at modeling exhaustive networks of interactions (with the long term goal of, for example, creating a comprehensive computational model of the cell), mainly at intra cellular level, systems biomedicine emphasizes the multilevel, hierarchical nature of the models (molecule, organelle, cell, tissue, organ, individual/genotype, environmental factor, population, ecosystem) by discovering and selecting the key factors at each level and integrating them into models that reveal the global, emergent behavior of the biological process under consideration. Such an approach will be favorable when the execution of all the experiments necessary to establish exhaustive models is limited by time and expense (e. g., in animal models) or basic ethics (e. g., human experimentation). In the year of 1992, a paper on system biomedicine by Kamada T. was published (Nov. Dec.), and an article on systems medicine and pharmacology by Zeng B. J. was also published (April) in the same time period. In 2009, the first collective book on systems biomedicine was edited by Edison T. Liu and Douglas A. Lauffenburger. In October 2008, one of the first research groups uniquely devoted to systems biomedicine was established at the European Institute of Oncology. One of the first research centers specialized on systems biomedicine was founded by Rudi Balling. The Luxembourg Centre for Systems Biomedicine is an interdisciplinary center of the University of Luxembourg. The first centre devoted to spatial issues in systems biomedicine has been recently established at Oregon Health and Science University. The first peer reviewed journal on this topic, Systems Biomedicine, was recently established by Landes Bioscience.