Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Содержание
Введение
Вид бактерии, вызывающий коклюш.
Species of bacterium causing pertussis or whooping cough
Bordetella pertussis – это грамотрицательная, аэробная, патогенная, инкапсулированная коккобацилла рода Bordetella, являющаяся возбудителем коклюша. Факторы вирулентности включают коклюшный токсин, токсин аденилатциклазы, нитевидный гемагглютинин, пертактин, фимбрии и трахеальный цитотоксин. Бактерии распространяются воздушно-капельным путем, а инкубационный период заболевания составляет в среднем 7–10 дней (в диапазоне 6–20 дней). Человек – единственный известный резервуар для B. pertussis. Полный геном B. pertussis, состоящий из 4 086 186 пар оснований, был опубликован в 2003 году. По сравнению с ближайшим родственником B. bronchiseptica, размер генома значительно уменьшен. Это в основном связано с адаптацией к одному виду хозяина (человеку) и утратой способности выживать вне организма хозяина. Как и B. bronchiseptica, B. pertussis способна экспрессировать структуру, подобную жгутику, хотя исторически она классифицировалась как неподвижная бактерия.
Bordetella pertussis is a Gram negative, aerobic, pathogenic, encapsulated coccobacillus bacterium of the genus Bordetella, and the causative agent of pertussis or whooping cough. Its virulence factors include pertussis toxin, adenylate cyclase toxin, filamentous hæmagglutinin, pertactin, fimbria, and tracheal cytotoxin. The bacteria are spread by airborne droplets and the disease's incubation period is 7–10 days on average (range 6–20 days). Humans are the only known reservoir for B. pertussis. The complete B. pertussis genome of 4,086,186 base pairs was published in 2003. Compared to its closest relative B. bronchiseptica, the genome size is greatly reduced. This is mainly due to the adaptation to one host species (human) and the loss of capability of survival outside a host body. Like B. bronchiseptica, B. pertussis can express a flagellum like structure, even though it has been historically categorized as a nonmotile bacterium.
Таксономия
Род Bordetella включает девять видов: B. pertussis, B. parapertussis, B. bronchiseptica, B. avium, B. hinzii, B. holmesii, B. trematum, B. ansorpii и B. petrii. 16S рРНК является компонентом всех бактерий, позволяющим сравнивать филы (типы) внутри образца. Расширение человеческой деятельности в области сельского хозяйства привело к увеличению контакта человека с почвой. Этот рост не только создал более благоприятные условия для предков Bordetella для процветания, но и для распространения на людей. Со временем Bordetella, например B. pertussis, адаптировалась к специфическому заражению людей и все еще способна размножаться и процветать в почвенных условиях. Изначально было установлено, что B. pertussis является мономорфным патогеном, у большинства обнаруженных штаммов которого были одни и те же два типа аллелей: ptxA1 или ptxA2. Современные достижения в области секвенирования генома позволили более детально изучить B. pertussis, что привело к открытию региона ptxP. Изучение этого гена выявило мутации, указывающие на отсутствие участков генома на цепи ДНК. Исследование, проведенное Бартом и др., показало, что 25% генов в референсном штамме Tohama I последовательности B. pertussis отсутствовали по сравнению с предковыми штаммами. Эти мутации были связаны с увеличением внутригеномной рекомбинации и потерей ДНК. Гены, контролируемые системой BvgAS, превратили B. pertussis в гораздо более заразный патоген, оптимально приспособленный для процветания в организме человека. Максимальный уровень pH для их роста составляет 8,0. Минимальный диапазон pH для поддержания роста – от 6,0 до 6,5. Бактерии не способны размножаться при pH ниже 5,0. Кроме того, Bordetella pertussis предпочитает температурный диапазон от 35 °C до 37 °C. Как было упомянуто ранее, это строгий аэроб, и для его питания требуется тщательное добавление никотинамида. Установлено, что рост бактерий подавляется в присутствии жирных кислот, пероксидных сред, ионов металлов и сульфидов. Будучи строгим аэробом, бактерии нуждаются в кислороде для роста и поддержания жизнедеятельности. Такие аэробы осуществляют клеточное дыхание для метаболизма веществ с использованием кислорода, при этом конечным акцептором электронов в цепи переноса электронов является кислород. Организм является оксидазоположительным, но уреазо-, нитратредуктазо- и цитратоотрицательным.
The genus Bordetella contains nine species: B. pertussis, B. parapertussis, B. bronchiseptica, B. avium, B. hinzii, B. holmesii, B. trematum, B. ansorpii, and B. petrii. 16S rRNA is a component of all bacteria that allows for the comparison of phyla within a sample. The expansion of human development into the agricultural field caused there to be an influx of human to soil contact. This increase not only created more advantageous environments for the ancestors of Bordetella not only to thrive in, but to spread to humans as well. Over time, Bordetella, like B. pertussis, has adapted to specifically infect humans and they are still able to multiply and thrive in soil conditions. It was initially determined that B. pertussis is a monomorphic pathogen in which majority of strains found had the same two types of alleles: ptxA1 or ptxA2. Modern developments in genome sequencing have allowed B. pertussis to be studied more allowing for the discovery of the ptxP region. Through studying the gene, there has been evidence of mutations within the gene that show missing genomes present on the DNA strand. A study by Bart et al., revealed that 25% of the genes on the Tohama I reference strain of B. pertussis sequence were missing in comparison to the ancestral strains. These mutations were noted to be caused by an increase in intragenomic recombination with loss of DNA. Genes controlled by the BvgAS system have transformed B. pertussis into a much more contagious pathogen. optimal to thrive in the human body. The max pH level for their growth was at a pH level of 8.0. The minimum pH range for minimal growth was at pH 6.0 6.5. The bacteria are not able to reproduce at pH levels lower than 5.0. In addition, Bordetella pertussis favors a temperature range of 35 °C to 37 °C. It is a strict aerobe as mentioned previously and its nutritional requirements are meticulous in its requirement for nicotinamide supplement. It has been identified that growth of the bacteria is hindered in the presence of fatty acids, peroxide media, metal ions, and sulfides. As a strict aerobe, the bacteria requires oxygen to grow and sustain. Such aerobes undergo cellular respiration to metabolize substances using oxygen. In such respiration, the terminal electron acceptor for the electron transport chain is oxygen. The organism is oxidase positive, but urease, nitrate reductase, and citrate negative.
Метаболизм
B. pertussis представляет уникальные проблемы и возможности для моделирования метаболизма, особенно учитывая его повторное появление как патогена. Обнаружено, что повышенные уровни глутамата замедляют рост из-за окислительного стресса, что указывает на сложную взаимосвязь. Этот эффект усиливается наблюдениями, предполагающими, что небольшая начальная популяция может усиливать окислительный стресс посредством кворумного зондирования – явление, требующее дальнейшего изучения. При культивировании B. pertussis в сбалансированной среде, содержащей лактат и глутамат, не накапливающей аммиак, наблюдается частично нарушенный цикл лимонной кислоты и способность бактерии синтезировать и расщеплять β-гидроксибутират. Выращивание B. pertussis в этой среде привело к некоторому образованию полигидроксибутирата, но не к выделению β-гидроксибутирата, что свидетельствует о более эффективном преобразовании углерода в биомассу по сравнению с существующими средами. В условиях образования биопленки клетки B. pertussis демонстрировали повышенный уровень токсинов и сниженную экспрессию определенных белков, что указывает на метаболический сдвиг в сторону использования полного цикла трикарбоновых кислот (ТЦК) вместо глиоксилатного шунта. Эти изменения коррелировали с повышенной аккумуляцией полигидроксибутирата и активностью супероксиддисмутазы, что потенциально способствует увеличению выживаемости в биопленках. Несмотря на менее неблагоприятный энергетический профиль по сравнению с тканями хозяина, такими как дыхательная система человека, B. pertussis эффективно сочетает биосинтез с катаболизмом, поддерживая устойчивый рост даже после длительной инкубации. Вспышки коклюша были зарегистрированы среди шимпанзе в зоопарке и диких горилл; в обоих случаях считается вероятным, что заражение произошло при тесном контакте с людьми. В ряде зоопарков существует давняя практика вакцинации приматов против коклюша. Исследования показывают, что некоторые виды приматов обладают высокой чувствительностью к B. pertussis и при воздействии низких инфекционных доз часто заболевают клиническим коклюшем. Факт естественного распространения бактерий среди диких популяций животных не был окончательно подтвержден лабораторной диагностикой. В исследовательских целях бабуины используются в качестве модели инфекции, хотя не установлено, аналогична ли патология у бабуинов таковой у людей.
B. pertussis presents unique challenges and opportunities for metabolic modeling, especially given its reemergence as a pathogen. Elevated glutamate levels were found to slow growth due to oxidative stress, revealing a complex relationship. This effect is compounded by observations suggesting that a small starting population could amplify oxidative stress through quorum sensing, a phenomenon deserving further investigation. When B. pertussis is in a balanced that medium of lactate and glutamate that does not accumulate ammonium, a partially faulty citric acid cycle in B. pertussis and its ability to synthesize and break down β hydroxybutyrate is observed. Cultivating B. pertussis in this medium resulted in some production of polyhydroxybutyrate but no excretion of β hydroxybutyrate, indicating a more efficient conversion of carbon into biomass compared to existing media formulations. In biofilm conditions, B. pertussis cells exhibited increased toxin levels alongside reduced expression of certain proteins, indicating a metabolic shift towards utilizing the full tricarboxylic acid (TCA) cycle over the glyoxylate shunt. These changes correlated with heightened polyhydroxybutyrate accumulation and superoxide dismutase activity, potentially contributing to prolonged survival in biofilms. Despite a less negative energy profile compared to host tissues like the human respiratory system, B. pertussis efficiently couples biosynthesis with catabolism, sustaining robust growth even after extended incubation periods. Outbreaks of whooping cough have been observed among chimpanzees in a zoo, and among wild gorillas; in both cases it is considered likely that the infection was acquired as a result of close contact with humans. Several zoos have a long standing custom of vaccinating their primates against whooping cough. Research shows that some primate species are highly sensitive to B. pertussis, and developed a clinical whooping cough in high incidence when exposed to low inoculation doses. Whether the bacteria spread naturally in wild animal populations has not been confirmed satisfactorily by laboratory diagnosis. In research settings, baboons have been used as a model of the infection although it is not known whether the pathology in baboons is the same as in humans.
Коклюш
Коклюш – это инфекция дыхательной системы, характеризующаяся звуком, напоминающим «закупорку» или «свист», при вдохе. B. pertussis заражает хозяина, колонизируя эпителиальные клетки легких. Бактерия содержит поверхностный белок – нитевидный гемагглютининовый адгезин, который связывается с сульфатидами, находящимися на ресничках эпителиальных клеток. Другими адгезинами являются фимбрии и петрактин. После закрепления бактерия производит трахеальный цитотоксин, который останавливает движение ресничек. Это препятствует очищению легких от инородных частиц, в результате чего организм реагирует приступами кашля. B. pertussis обладает способностью подавлять функцию иммунной системы хозяина. Токсин, известный как коклюшный токсин, ингибирует связывание G-белка, регулирующее преобразование АТФ в циклический аденозинмонофосфат, опосредованное аденилатциклазой. В результате фагоциты преобразуют избыточное количество аденозинтрифосфата в циклический аденозинмонофосфат, вызывая нарушения в механизмах клеточной сигнализации и препятствуя адекватному ответу фагоцитов на инфекцию. Коклюшный токсин, ранее известный как фактор, стимулирующий лимфоцитоз, вызывает снижение проникновения лимфоцитов в лимфатические узлы, что может привести к состоянию, известному как лимфоцитоз, с общим количеством лимфоцитов более 4000/мкл у взрослых или более 8000/мкл у детей. Помимо воздействия на лимфоциты, он ограничивает миграцию нейтрофилов в легкие и снижает функцию резидентных макрофагов, ответственных за элиминацию бактерий. Инфицирование B. pertussis чаще всего происходит у детей младше одного года, поскольку в этом возрасте они не вакцинированы, или у детей с ослабленным иммунитетом, обычно в возрасте от 11 до 18 лет. Признаки и симптомы схожи с симптомами обычной простуды: насморк, чихание, легкий кашель и незначительное повышение температуры. Пациент становится наиболее заразным во время катаральной стадии инфекции, обычно через две недели после начала кашля. Инфекция может распространяться воздушно-капельным путем при кашле, чихании или смехе. Пароксизмальный кашель предшествует громкому, свистящему вдоху, характерному для коклюша. После приступа пациент может издавать звук, напоминающий «закупорку» или «свист» при вдохе, или его может вырвать. Ожидается увеличение скорости распространения инфекции, когда хозяин находится в наиболее заразной фазе, при максимальной концентрации жизнеспособных бактерий B. pertussis. После кашля бактерии из дыхательных путей хозяина попадают в воздух в виде аэрозольных капель, представляя угрозу для окружающих. Человек-хозяин может проявлять различные физические реакции в ответ на патоген B. pertussis, в зависимости от способности его организма бороться с инфекцией. Однако для сохранения B. pertussis в популяции необходима непрерывная цепочка передачи, поскольку отсутствуют животные-резервуары, и бактерии не выживают в окружающей среде. B. pertussis распространяется преимущественно воздушно-капельным путем, требуя непосредственного контакта между людьми из-за короткого времени выживания бактерий вне организма. Отмечено, что в период с 1991 по 2008 год было зарегистрировано 258 случаев смерти младенцев в возрасте до 8 месяцев.
Pertussis is an infection of the respiratory system characterized by a “whooping” sound when the person breathes in. B. pertussis infects its host by colonizing lung epithelial cells. The bacterium contains a surface protein, filamentous haemagglutinin adhesin, which binds to the sulfatides found on cilia of epithelial cells. Other adhesins are fimbriae and petractin. Once anchored, the bacterium produces tracheal cytotoxin, which stops the cilia from beating. This prevents the cilia from clearing debris from the lungs, so the body responds by sending the host into a coughing fit. B. pertussis has the ability to inhibit the function of the host's immune system. The toxin, known as pertussis toxin, inhibits G protein coupling that regulates an adenylate cyclase mediated conversion of ATP to cyclic adenosine monophosphate. The result is that phagocytes convert too much adenosine triphosphate to cyclic adenosine monophosphate, causing disturbances in cellular signaling mechanisms, and preventing phagocytes from correctly responding to the infection. Pertussis toxin, formerly known as lymphocytosis promoting factor, causes a decrease in the entry of lymphocytes into lymph nodes, which can lead to a condition known as lymphocytosis, with a complete lymphocyte count of over 4000/μl in adults or over 8000/μl in children. Beside targeting lymphocytes, it limits neutrophil migration to the lungs. It also decreases the function of tissue resident macrophages, which are responsible for some bacterial clearance. The infection of B. pertussis occurs mostly in children under the age of one since this is when they are unimmunized, or children with faded immunity, normally around the ages 11 through 18. The signs and symptoms are similar to a common cold: runny nose, sneezing, mild cough, and low grade fever. The patient becomes most contagious during the catarrhal stage of infection, normally two weeks after the coughing begins. It may become airborne when the person coughs, sneezes, or laughs. The paroxysmal cough precedes a crowing inspiratory sound characteristic of pertussis. After a spell, the patient might make a “whooping” sound when breathing in, or may vomit. Transmission rates are expected to rise as the host experiences their most contagious stage when the total viable count of B. pertussis is at its highest. After the host coughs, the bacteria in their respiratory airways will be exposed into the air by way of aerosolized droplets, threatening nearby humans. A human host can exhibit a range of physical reactions as a result of the B. pertussis pathogen, depending on how well their body is equipped to fight infection. However, for B. pertussis to persist in a population the bacterium needs an uninterrupted chain of transmission as there are no animal reservoirs and the bacteria do not survive in the environment. B. pertussis primarily spreads through respiratory droplets, requiring direct contact between individuals due to its short survival time outside the body. It was noted that between 1991 and 2008, there were 258 deaths for infants 8 months old and younger.
Лечение
Коклюш лечат макролидами, например, эритромицином. Терапия наиболее эффективна при начале в инкубационный или катаральный период. Оптимально начинать лечение в течение 1–2 недель от начала симптомов. При применении в фазе спазматического кашля время выздоровления не сокращается, но дальнейшее распространение инфекции снижается до 5–10 дней после заражения.
Whooping cough is treated by macrolides, for example erythromycin. The therapy is most effective when started during the incubation period or the catarrhal period. It is ideal for treatment should be within 1–2 weeks from onset of symptoms. When applied during the paroxysmal cough phase, the time of reconvalescence is not affected, only further transmission is reduced to 5–10 days after infection.
Профилактика
Вакцина против коклюша широко используется со второй половины 20-го века. Эти ацеллюлярные вакцины также вводятся внутримышечно и состоят из очищенных поверхностных антигенов, в основном фимбрий, нитевидного гемагглютинина, пертактина и токсина коклюша. Обе вакцины используются и сегодня, при этом вакцина aP преимущественно применяется в развитых странах. Вакцина aP также входит в состав вакцинации против дифтерии, столбняка и ацеллюлярного коклюша (DTaP). Заболеваемость среди младенцев распространена и часто имеет серьезные последствия, поскольку они более восприимчивы к *Bordetella pertussis*, чем подростки и здоровые взрослые. Поэтому, чтобы снизить риск заражения и распространения этого заболевания, родителям рекомендуется пройти профилактическую вакцинацию. "В связи с повторным ростом заболеваемости коклюшем, возникают опасения относительно уровня защиты, обеспечиваемого текущей вакциной. Эта вакцина не обеспечивает защиту от других видов *Bordetella*, таких как *B. holmesii* и *B. bronchiseptica*, что еще больше подчеркивает необходимость разработки новой вакцины. В настоящее время ведутся исследования по созданию новой вакцины, такой как BPZE1 – живой аттенуированной вакцины против *B. pertussis*, которая эффективна и против других патогенов из группы 'классических бордетелл'. Эта новая вакцина инактивирует ген, кодирующий три основных токсина, всего одной интраназальной дозой. В настоящее время изучается ее безопасность для пациентов с ослабленным иммунитетом и беременных женщин. Другие перспективные вакцины также находятся на стадии изучения и проходят испытания на точность, эффективность и безопасность."
Pertussis vaccine has been widely used since the second half of the 20th century. These acellular vaccines are also intramuscular and are composed of purified surface antigens, mainly fimbriae, filamentous hemagglutinin, pertactin and pertussis toxin. Both vaccines are still used today, with the aP vaccine predominantly used in developed countries. The aP vaccine is also a part of the diphtheria, tetanus, and acellular pertussis (DTaP) immunization. Cases in infants are common and often have serious impacts as they are more susceptible to Bordetella pertussis than adolescents and healthy adults. Therefore, to decrease likelihood of contracting and spreading this disease, parents are recommended to receive the preventative vaccine. 'With the resurgence of pertussis cases, there are concerns regarding the level of protection provided by the current vaccine. This vaccine does not offer protection against other species of Bordetella such as B. holmesii and B. bronchiseptica and further highlights the need for a revamped vaccine. Research is currently developing a novel vaccine such as the BPZE1, which is a live attenuated vaccine against B. pertussis and challenges the other pathogens in the 'Classical Bordetellae.'' This new vaccine inactivates the gene encoding 3 major toxins with only a single intranasal dose. It is currently being studied for safety in immunocompromised patients and pregnant women. There are other promising vaccines that are under study and in trial periods for accuracy, efficacy, and safety.